疾病biomarker研究一直以来是研究的热点,而将circular RNA作为biomarker是目前研究热点中的热点。今天,小编和大家分享一篇circRNA用于早期先兆子痫biomarker研究的报道。
先兆子痫(PE)是一种常见的妊娠期疾病,对孕妇和胎儿的健康造成了严重的影响。但是,到目前为止,PE的病理成因还不是很清楚。此外,有关PE的早期诊断也一直没有一种非常可靠的检测手段。Circular RNAs是一类新的环状非编码RNA,由于其封闭环状的结构特点,是最近一两年大家所追捧的新一代诊断biomarker。在先兆子痫病人血细胞中是否能检测到特异性的circRNAs?能否将circRNAs作为先兆子痫早期诊断的biomarker?该研究在这里为我们一一做了解答。
研究人员首先对18个怀孕8-20周的PE病人和18个正常的孕妇的血细胞(blood corpuscle)进行了基因芯片circRNAs筛选,共找到12个差异5倍以上的circRNAs。
为了验证芯片结果,研究人员对另外的32个PE病人和32个正常孕妇进行了qRT-PCR检测,发现circ_101222显著上调,miRNA结合原件(MRE)分析显示,circ_101222含有miR-326和miR-181结合位点。由于miR-181报道和PE相关,因此,circ_101222可能与PE发病是相关的。为了便于比较,研究人员同样对病人和正常孕妇的血浆蛋白因子endoglin(ENG)进行了ELISA检测,也发现病人中的ENG表达明显高于正常。
为了验证circ_101222作为biomarker的有效性,研究人员进行了ROC分析,发现circ_101222的AUC为0.706(95% CI 0.630–0.774),区分的敏感性和特异性分别为65.61 和68.54%。同样,对于ENG的ROC分析显示,敏感性和特异性分别达到68.29%和73.17%。值得注意的是,当把两者结合起来作为诊断分子时,敏感性和特异性能达到70.73和80.49%。因此,如果将circ_101222和ENG结合起来作为临床早期诊断的biomarker,可能是一个非常好的诊断标准。
该研究思路清晰,实验简单,从芯片筛选,到qRT –PCR验证,再与已有蛋白因子对比分析敏感性和特异性,筛选到了circ_101222,可能是一个非常好的PE早期诊断biomarker。该文章通过常规的实验思路发表影响因子3分多的文章,非常值得大家借鉴。同时,我们也可以看到,由于样本量的限制以及对circ_101222功能的不了解,将该circRNA有用临床诊断还有很长一段路要走。但是,我们也应该看到,从circRNAs入手,寻找疾病诊断的biomarker,是一个非常好的研究方向。文章来源:基因芯片知识屋