Circos整体学习（一） circos简单了解

Circos软件是常用的展示图片的软件，其主要是perl中svg画图的集成包。

主要是调用svg进行图片的绘制。前段时间小遍也简单介绍了在线绘制circos图片的方法。后面小遍还会介绍如何利用Rcircos进行circos的绘制。

本期主要主要想从另外一个角度对circos进行下简单的介绍。

小编发现网络上有很多的circos的教程，更多的是先讲解了circos中的配置文件。而对于从来没有接触过circos的同学们更应该首先从整体上进行下了解。然后对其数据格式进行下了解，然后能够简单的运行起来，然后再进行图片的修饰和美化。

因此其路线应该是：

（1）简单整体了解

（2）了解其数据格式

（3）了解其配置文件和简单运行

（4）进一步的修饰和美化

因此希望借助本篇文章，童鞋们能对circos有一个简单的认识，更上一层楼。

circos的小编的理解

首先circos主要是用来绘制基因组圈图的。

如上图，其中内部的连线在circos中称为links，主要是研究基因在基因组中的复制和共线性。

而其他部分可以添加基因组的各种组分的比例，这样可以更好的展示基因组的整体特征。

当然circos绘制图片不仅仅可以用于基因组特征的展示，更多的应用于其他领域，比各个人物之间的关系等。

这个图是简单的示意下人物之间的关系，其实还是可以更真实、更美观的。

当然这篇文章不是继续吐槽娱乐圈，而是真正的让大家理解circos，可以弄啥子。

简单概括就是如果童鞋们现在研究的东东存在关系的展示，就可以用circos进行绘制。

比如某两个基因之间的关系啊，基因组之间的关系啊，人物关系啊，个个国家进口出口贸易额啊，某个疾病和基因之间的关系等等。都可以。

就像circos说明文档中说的circos is good。如果能用圈展示，就用圈展示，因为圈更能代表关系。

吐槽下，小伙伴们其实可以利用朋友圈中好友给你和你给好友点赞的次数绘制一下关系网络，看看到底那个小伙伴是真真的关系你哈。

废话就到此为止。

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