其他
在科研工作中经常会遇到热图的绘制。但是热图的绘制工具不是很简单,没有简单的图形页面,对于那些不太懂命令行的人来说绘制热图非常复杂,而且超级没有效率。
那么有没有一个款在线工具,提供简单的窗口,然后绘制热图,而且绘制的还是相当可以的呢。小编这次就推荐一款软件Matrix2png。
Matrix2png是进行微阵列数据和许多其他数据类型的可视化。一个简单但功能强大的程序它可以从文本文件的数据生成PNG格式的图像。它快速,易于使用和合理灵活。它可以用于生成可发布图片,或作为图像发生器为web应用程序。使用于各种数组型数据。
特点
目前只支持PNG格式输出
支持linux操作系统
输入格式简单
可以下载到本地运行
下面主要介绍这个工具在线如何使用
首先看一下支持的文件格式
输入文件时需要将文件保存为txt文件,然后上传
完成上传之后要对图像的显示进行简单的设计
这里有每个元素的大小选择,是否显示零的那些元素,是否利用○来代替矩形等。
完成以上设置之后,接下来要对颜色进行设置。
颜色包括背景颜色,缺失值颜色。对比度等。
还有一些其他的用法,又掉高达上,暂时没有理解,大家想仔细了解,就自己去研究吧。
设置完毕颜色之后可以对图像的布局和绘制进行设计。如是否显示坐标,lable等。还可以对数据进行选择等。
更多的功能等着你自己去研究。
工具网址:网址:http://www.chibi.ubc.ca/matrix2png/bin/matrix2png.cgi
或者点击阅读原文前往 生信人导航已收录
欢迎关注生信人