热图很重要，真的，这个大家都知道，这个不仅仅在计算表达量聚类的时候用得到，在评估测序数据质量的时候同样用得到，哪怕你在分析股票之间的关系的时候，也会用的热图。

虽然之前生信人也多次推过热图的文章。

但是

当我觅尽江湖，竟然没有发现一款绿色环保无污染，高端大气上档次的免费的热图绘制工具。

于是乎，小编就 ji ji ge 开发了一款图形化的热图绘制神器。

江湖规矩

先放下载链接，再放教程。

http://gap.shengxin.ren/tool/3/

或点击阅读原文直通

一本正经的教程讲解

---

1、首次登陆时，会提示注册邮箱，之后会生成一个文件，如下，以后可以将此文件复制到各个小程序的根目录下，就无需再注册啦！

2、双击运行主程序“HeatmapCluster.exe”，打开界面如下：

3、点击右侧“选择矩阵文件”（这里的矩阵文件为表达矩阵，对于行和列，无特殊要求，怎么开心怎么来）。这里，我们举例说明，矩阵文件如下所示（列名为sample，200例，行名为gene，11个）：

4、瞬间生成Heatmap如下（具体运行时间根据您的电脑配置）：

5、上面这个图很难看，并且很多参数需要调整，因此更改参数的选项如下：

6、更改颜色，点击这三个颜色框，可以随意选择颜色，这里举例说明选择蓝-白-红，三种颜色。

7、是否进行cluster？则选择“RowCluster”或者“ColCluster”。

8、是否进行Z-score？则选择按照Row还是Col进行Z变换，例子中，我们按照Row进行Z变换。

9、是否显示Row名字或者Col名字？则选择Show按钮。

10、选择聚类的方式？有“欧氏距离”和“皮尔森相关系数”两个选项。

11、调整完参数后，生成如下：

12、点击右侧保存相关按钮，建议保存为PDF格式，“绘图”按钮其实就是“刷新”功能啦！

13、最终保存的图像为下图（蓝-白-红）：

【来自生信人的忠实粉丝分享_杭州薛之谦】

点击阅读原文，直通小工具下载首页。