Microbiome | 人类世的植物微生物群落特征是微生物组研究的挑战!

人类活动对我们星球的影响如此之大，以至于形成了一个以人类为主的地质时代--人类世。人类人口的持续增长、某些地区的人口过剩、过度消费和密集型农业之间存在着直接联系；它们共同构成了人类世的主要驱动力。人类世也反映在行星边界的概念中；九个边界中的四个已经被跨越：灭绝率、森林砍伐、气候变化以及氮和磷的通量。然而，对于这些人为因素对不同的宿主相关和环境以及相互联系的微生物组的影响及其对我们星球的后果知之甚少。对人类微生物组的研究表明，生物多样性的大量丧失与慢性病的增加有关。这种相关性的发现标志着对微生物生物多样性重要性的认识有了根本性的突破，但它需要对驱动因素、作用方式和后果有更深入的了解。尽管人类活动对植物相关微生物群的影响可以通过各种实验方法进行研究，但人们对它的了解仍然很少，需要在全球食品安全方面给予更多关注，同时也需要在相互关联的微生物群和地球健康方面给予更多关注。

2022年3月30日，国际权威学术期刊Microbiome发表了奥地利格拉茨技术大学Gabriele Berg教授团队（The ISME Journal | 从植物微生物组中探索原始环境的抗菌素耐药性！Microbiome | 德国慕尼黑亥姆霍兹中心重新定义微生物组：旧概念和新挑战！（附视频）Microbiome | 奥地利格拉茨工业大学揭示沼泽生境中植物与微生物的密切互作和共同进化！）的最新相关研究成果，题为The plant microbiota signature of the Anthropocene as a challenge for microbiome research的评论文章。

最近提出的一个微生物组定义表明，结合统一的概念和标准，微生物组研究对于解决与人为驱动的各种微生物群落变化相关的新挑战可能很重要。这篇评论想进一步阐述这一建议，因为科研人员注意到受人类世影响的微生物群落中的特定特征。本文基于对现有文献的回顾和Gabriele Berg团队针对植物微生物组的研究进行讨论。它不仅对植物本身至关重要，而且与地球健康有关。科研人员认为，不同的人类活动通常与植物微生物群落的多样性和均匀性的变化有关，其特征还在于宿主特异性降低，以及r-战略微生物、病原体和超突变体的增加。锚定在微生物组中的抗性组随着特定抗菌素耐药性 (AMR) 机制的增加以及质粒相关耐药性基因的增加而跟随这种转变。人类世的这种典型微生物组特征通常与生态失调和恢复力丧失有关，并导致频繁的病原体爆发。尽管其中一些观察结果已经被研究证实，但这个问题需要在即将进行的微生物组研究中得到更多关注。本文旨在激发整体研究，以开发解决方案、恢复和保存生态系统功能的微生物多样性以及密切相关的地球健康。

图. 行星边界及其对植物整体微生物组特征的影响

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