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circRNA研究应用专篇②|解密“翻译”潜能

于怡琳 诺禾致源科服 2023-02-13

导语

小编在上期circRNA推文中分享过circRNA在转录调控、分子海绵(sponge)、mRNA前体剪切竞争等方面的作用。那么关于高分文章必杀技——circRNA的翻译潜能,我们可以挖掘什么信息呢?请看下文。


文献速递一

CircPPP1R12A编码的新型蛋白通过Hippo-YAP促进结肠癌转移和发病[1]

背景:结直肠癌是全球常见的一种恶性肿瘤,结直肠癌中是否有蛋白编码circRNA的参与仍是未知的,且它们的功能性产物也很难检测到。本文作者围绕circRNA在结直肠癌的发生发展中发挥的作用进行了探索。测序circRNA-seq技术路线

(点击放大查看清晰图片)研究结论: circPPP1R12A在结直肠癌细胞的增殖、迁移及侵袭中发挥关键性的作用。circPPP1R12A编码一个73aa的功能蛋白circPPP1R12A-73aa通过激活Hippo-YAP通路促进结直肠癌的生长和迁移。作者的研究为结直肠癌新的潜在的治疗靶点提供了一种有价值的思路。


文献速递二

SMO环状RNA编码的新型蛋白质促进Hedgehog信号激活和胶质母细胞瘤致瘤性[2]

背景:成人中Hedgehog信号通路的持续激活导致胶质瘤发生进展:Hedgehog通路静息状态下,SMO受PTCH抑制;当HH配体结合PTCH时抑制解除并激活下游转录因子Gli,调控靶基因表达。SMO的激活需要胆固醇的结合与修饰,但是具体机制尚未明确。测序:circRNA-seq研究思路

(点击放大查看清晰图片)研究结论:SMO-193a.a.上游调控分子FUS被shh/Gli1激活,促使SMO-193a.a.运输胆固醇激活SMO,形成正反馈回路,促进肿瘤发生发展。诺禾致源circRNA-seq采用去核糖体去线性的建库方式,依据应用点可划分的具体生信流程如下: 小结 

以上文章通过 circRNA-seq 确定目的分子,结合翻译组、功能验证和机制研究,充分挖掘 circRNA 的翻译潜能,向我们展示了优秀的文章思路。诺禾致源提供 circRNA-seq 以及翻译组学测序分析服务,其中 circRNA 测序项目经验涵盖人、大鼠、小鼠、猪、绵羊、耗牛、牛、鸡、兔 子、鸟类、鸡、斑马鱼、罗非鱼、草鱼、牙鲆、水稻、烟草、 棉花、陆地棉、二穗短尾草、西瓜、梨、海带等几十个物种,影响因子累积120+,欢迎关注circRNA与翻译组的老师们随时联系驻地销售哟!




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参考文献:

[1] Zheng X, Chen L, Zhou Y, et al. A novel protein encoded by a circular RNA circPPP1R12A promotes tumor pathogenesis and metastasis of colon cancer via Hippo-YAP signaling [J]. Molecular Cancer, 2019, 18:47.

[2] Wu X, Xiao S, Zhang M, et al. A novel protein encoded by circular SMO RNA is essential for Hedgehog signaling activation and glioblastoma tumorigenicity [J]. Genome Biology, 2021, 22:33.



RNA研究部   于怡琳 | 文案片来源于网络,侵删

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