circRNA研究应用专篇②|解密“翻译”潜能
小编在上期circRNA推文中分享过circRNA在转录调控、分子海绵(sponge)、mRNA前体剪切竞争等方面的作用。那么关于高分文章必杀技——circRNA的翻译潜能,我们可以挖掘什么信息呢?请看下文。
CircPPP1R12A编码的新型蛋白通过Hippo-YAP促进结肠癌转移和发病[1]
背景:结直肠癌是全球常见的一种恶性肿瘤,结直肠癌中是否有蛋白编码circRNA的参与仍是未知的,且它们的功能性产物也很难检测到。本文作者围绕circRNA在结直肠癌的发生发展中发挥的作用进行了探索。测序:circRNA-seq技术路线:SMO环状RNA编码的新型蛋白质促进Hedgehog信号激活和胶质母细胞瘤致瘤性[2]
背景:成人中Hedgehog信号通路的持续激活导致胶质瘤发生进展:Hedgehog通路静息状态下,SMO受PTCH抑制;当HH配体结合PTCH时抑制解除并激活下游转录因子Gli,调控靶基因表达。SMO的激活需要胆固醇的结合与修饰,但是具体机制尚未明确。测序:circRNA-seq研究思路:以上文章通过 circRNA-seq 确定目的分子,结合翻译组、功能验证和机制研究,充分挖掘 circRNA 的翻译潜能,向我们展示了优秀的文章思路。诺禾致源提供 circRNA-seq 以及翻译组学测序分析服务,其中 circRNA 测序项目经验涵盖人、大鼠、小鼠、猪、绵羊、耗牛、牛、鸡、兔 子、鸟类、鸡、斑马鱼、罗非鱼、草鱼、牙鲆、水稻、烟草、 棉花、陆地棉、二穗短尾草、西瓜、梨、海带等几十个物种,影响因子累积120+,欢迎关注circRNA与翻译组的老师们随时联系驻地销售哟!
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参考文献:
[1] Zheng X, Chen L, Zhou Y, et al. A novel protein encoded by a circular RNA circPPP1R12A promotes tumor pathogenesis and metastasis of colon cancer via Hippo-YAP signaling [J]. Molecular Cancer, 2019, 18:47.
[2] Wu X, Xiao S, Zhang M, et al. A novel protein encoded by circular SMO RNA is essential for Hedgehog signaling activation and glioblastoma tumorigenicity [J]. Genome Biology, 2021, 22:33.
RNA研究部 于怡琳 | 文案图片来源于网络,侵删
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