史上最全RNA送样建议,收藏这一篇就够了!
随着二代测序技术的发展,RNA-seq技术以其高通量、高灵敏度的特点广泛应用于基础研究、临床诊断、药物研发等多个领域。在RNA-seq技术的工作流程中,样本制备是其中的基础环节,而好的样本质量是实验成功的前提。
诺禾致源在基因测序领域深耕十年,在RNA-seq项目中积累了上百万个样本的处理经验,对RNA样本可能遇到的质量问题有深入分析和研究。其中约60%为RNA降解,30%为RNA总量不足。为帮助科研用户获得最佳质量的RNA样本,本文将从样本采集、保存、运输等方面教您如何有效改善您的样本状态。
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4. 选择高丰度组织部位提高RNA总量
不同组织部位的RNA丰度不同,需尽量选用高丰度的组织部位如肝脏、脾脏、心脏(见表2)。如需使用核酸不丰富的部位,可按照丰度表和送样建议表进行计算,酌情增加送样量。
表2 RNA丰度
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选择最佳的保存方式降低样本降解的风险
保存方式也是影响样本质量的重要原因。组织类型不同,保存方式也不同(见表3),可根据您的样本类型选择最佳的保存方式和操作方法。
点击文章底部阅读原文查看保存方式和操作方法等补充信息。
表3 RNA保存方式建议
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注意事项:
1. 动植物组织样本离体后立即液氮冻存,然后-80℃保存,尽快寄送,如需长期保存则需选择液氮冻存。未经液氮速冻可能会导致RNA缓慢降解。避免反复冻融,组织发生反复冻融后提取成功率在5%以下。
2. 保存液需完全浸透样本,保存液量不足会造成RNA降解。
1. 选择螺纹冻存管降低污染风险
带有螺口的冻存管密封性更好,不建议离心管送样;不得已使用离心管时,需用封口膜封死,避免撒漏。
2. 保证干冰用量且覆盖充分
干冰用量充分防止运输过程中发生样本冻融,保证样本四周被干冰完全覆盖。
更多问题欢迎给我们留言或联系当地技术支持和客户经理。
NGS产品部 孙依然 | 文案
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