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2015-06-08 解螺旋

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——日读一帖,解螺旋大V团队伴你科研路


作者:解螺旋.Peak

解螺旋出品,转载须经授权


  小伙伴们精读肿瘤机制的文章,一般包含以下常规化的思路:


  • A的异常表达诱导/抑制肿瘤的发生

  • A调控B(信号通路)诱导/抑制肿瘤的发生

  • A通过B调控C(信号通路)诱导/抑制肿瘤发生


  更复杂的机制也比比皆是,不过是以上几种的排列组合。今天解螺旋.Peak给大家带来一篇来自Cell Report研究胰腺肿瘤发生机制的文献,是很经典的A通过B调控C信号通路诱导/抑制肿瘤发生的思路,为何Peak这么说呢?咱们一看标题便知

  


  看完标题,你可以联想下面三个关键信息点:


  • PAF是什么玩意?

  • 原来是研究MAPK信号通路的(估计上过《细胞生物学<翟中和版>》都知道,哈哈)

  • LAMTOR3,这个是一个家族吧?一查原来人家有五个兄弟呢,LAMTOR1-5(其它只是脑补吧,肯定收获很大,反正我是)


  首先,说一下文章的基础,个人认为他们基于以下几点开展工作的:


  1. 在美国胰腺癌是第四大癌症死亡原因,5年生存率不到6%(Siegel et al., 2012).

  2. K-Ras致瘤突变发生在90%的胰腺癌患者身上(Bos, 1989; Thomas et al., 2007).

  3. 胰腺癌的发生和维持过程都需要K-Ras基因突变 (Collins et al., 2012;Ying et al., 2012).

  4. K-Ras 改变调控细胞增殖、分化和凋亡的MAPK信号通路(Malumbres and Barbacid, 2003).


  作者从这四点出发,认为胰腺癌的发生多与MAPK通路相关,他们开展相关工作集中点也就在这里了。所以,大家在日常研究过程中,要注意与自己研究领域相关的文献的积累。


什么是PAF?


  如果不知道PAF,不知道大家对PCNA是否熟悉?PCNA是增殖细胞核抗原(Proliferating Cell Nuclear Antigen),因其只存在于正常增殖细胞及肿瘤细胞内而得名,PAF是PCNA相关因子(PCNA-associated factor),在易出错的DNA修复和同源重组过程中的跨DNA损伤复制中起作用。


MAPK的核心区域:




重点内容提要:


  • PAF过表达与MAPK信号通路的激活和胰腺癌细胞增殖相关

  • 小鼠模型显示PAF过表达能够诱导胰腺癌肿瘤的形成

  • PAF通过反式激活LAMTOR3来激活MAPK信号通路(具体机制的发现)


-------Results解读-------


1.PAF在胰腺癌中的促有丝分裂作用


  作者在文章说中他们是分析Oncomine数据库发现PAF在胰腺癌中高表达。(说实话,只是想说个好的story罢了!他们前期做过相关文章,肯定得到了部分结果,并且前期也有人做过研究的~)



  得到这个结果,然后脑洞大开,常规思路吧(做癌症的,要不看看是否影响增殖,要么就是凋亡,要么迁移之类的。)首先,文章研究PAF的表达是否影响胰腺癌细胞的增殖


  实验1:敲除了内源的PAF,观察细胞增殖状态和数量,发现明显的抑制了细胞的增殖(图B),数量也显著的减少(图C)。(图A,检测敲除PAF的效率)。



  实验2:观察敲除的细胞周期状态,发现在G1期,细胞增加;S期、G2/M期细胞减少(上图D)。我的理解是:PAF敲除,对于细胞的G1影响小,细胞能成功的完成RNA和蛋白质的合成,为S期的复制做好物质和能量的准备。但是结果显示,S期和G2/M期的细胞减少,也就是说PAF是在DNA合成期和有丝分裂期起到重要作用


  实验3:Rescue实验,就是同时过表达了ntPAF,发现细胞数量能有效的回复(上图E,下图F),也就是说他们可能性的确定了PAF在细胞增殖的影响。




2. PAF诱导胰腺上皮肿瘤的发生


  既然PAF在胰腺癌细胞中观察到那么好的表型,最直接的就是构建大鼠模型!


  实验4:这部分就是成功构建了大鼠模型之后,通过检测胰腺上皮瘤的marker,证明PAF确实在胰腺癌的发生中起到作用。(反正就是跟去查病一样,各种指标指示可能犯病了,哈哈);


  在这之前,检测了一个有丝分裂的marker(Ki67),这个实验,我感觉挺好,正好呼应了第一个结果(上上图D)。胰腺癌Marker主要有:MUC1、CK19、COX2。总之文章成功说明了,PAF在胰腺癌的发生中起到重要作用。


3.PAF诱导胰腺肿瘤干细胞标记物的表达


  PAF既然在胰腺癌中能特意的过表达,并且确实在胰腺癌的发生中起到重要作用。那PAF是否影响胰腺肿瘤干细胞(Cancer Stem Cell,CSCs)的调控发生呢?于是乎,作者在构建的鼠模型中分离到CSCs之后进行了各个指标的检测,结果显示,PAF的功能确实和他们预测的一样(我的实验要是如此顺利该多好啊,~~o(>_<)o ~~),这个实验也是我比较喜欢的,从源头看发育


  不过在这之前,人家也做了两个小实验:


  • 在敲除PAF的Panc-1的细胞中检测CXCR4和CD24两个胰腺CSC的marker,发现都是显著的降低,说明PAF可能性参与调控胰腺CSC;

  • 检测了胰腺CSC的另外一个marker-ALDH(乙醛脱氢酶),发现PAF敲除之后ALDH表达量也下调。



4.拎出LAMTOR3


  既然PAF在胰腺癌中那么重要,那么它的发生机制是什么?



  

  Western也一致的证实,过表达诱导ERK1/2的磷酸化(上图B);另外,敲除PAF之后ERK的磷酸化能显著的被抑制。


  文章中做了一个小小的序列分析实验,发现在PAF诱导的胰腺癌中Ras和Raf基因都没有突变。




  所以文章认为PAF在其诱导的胰腺癌中没有介导TLS的发生。(这这这,怎么办啊?)不过人家有基础啊,并且都做了3个结果了,不能费啊!所以他们说根据以上实验结果,文章认为这些体内体外实验暗示PAF激活了MAPK信号通路下游的RAS。所以文章就检测了PAF是否通过对MAPK信号通路成员的转录调控作用来激活该通路。(这边我们可以想象,作者他们应该是试了很多通路或者因子的,很多情况下并不会有这么顺利的结果,文献中的story很有可能是倒述哦!)。


  这一试不要紧,发现新的机制了!结果发现敲除PAF的胰腺癌细胞中LAMTOR3转录受到了特异性的抑制(见下图)。




  实验做到这里,基本上就结束了,下面无非是一些具体调控的验证:




  最后,文章总结的机制模式图,一目了然:



  我给大家画了个思路图总结:




  文章很清晰的,首先在前人的基础上,根据数据库分析,反向PAF这个小东西在作祟,于是乎开始了一些验证试验,包括检测其在有丝分裂中的作用、构建鼠模型、验证调控CSC的作用,直到发现关键的MP1,而这些恰好的和已有的研究是一致~




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