Graphpad Prism搞定折线和曲线图,so easy!
特别福利:关注 "解螺旋" 微信公众号,回复关键词"6月"可索取2016年6月资源包 "实验常用protocol+质粒图谱大全"。(回复关键字正确方式点这里)
作者:解螺旋·子非鱼
如需转载请注明来源:解螺旋·医生科研助手
GraphPad Prism不仅简单易学,且相比Excel作图更灵活,比SPSS更漂亮。之前我们介绍了Graphpad Prism搞定各种柱状图(回复关键词柱状图可查看该文),其实要做一款高颜值的折线组合图或生存曲线图,用Graphpad Prism同样可以轻松搞定!
折线图为统计图中最常见的一类图,它的特点是可以显示随时间而变化的连续数据,因此每个数据点都有一个相应的X轴值和Y轴值。
作图篇
1、打开Graphpad prism软件,选择XY图(XY graphs),点击折线图图标,并把样本数设为4,同时设置为Mean and Error ,如下图:
2、在Data栏中输入以下数据,软件就会自动帮你算出均值(Mean)和误差值(Error),并做好折线图了。
3、点击Data1,即可看到折线图。
修饰篇
4、双击图中任意一条折线,可在以下界面中对其进行修饰美化。改的同时图示中的颜色和线型也会同步改过来。
5、有时,需要对多个图片进行组合。可点击菜单栏中的Insert中的New Data Table (+Graph),插入新的表格Data2,并将数据输入表格中,如下图所示:
6、点击左侧的Layouts,可根据制作图片的数量,选择合适的布局,下图选择的是2张图分成2排的排列格式。
7、点击OK后,可在以下界面双击,选择相应的图表,即可得到组合后的图片。
得到的组合图片如下图所示:
无论是临床研究还是基础研究,都有可能碰到生存曲线的制作,只是对象不同(人或者实验动物)。
作图篇
1、老样子,第一步是新建一个文件,这次我们要选择Surival,在数据选项里,选择用空白表格。
2、在出现的表格中,根据生存曲线的固定要求,X轴表示时间(单位可以是小时、日、月、年)。Y轴可以是单组或多组,这里我们就设置试验组和对照组。这里的数据都要用0或1来表示,其中1代表发生,0代表未发生。如果是做总体生存期OS的话,1就是死亡,0就是存活。像这样输入完数据。
3、数据输完后,点左侧的Graphs,出现作图的设置,主要是要注意红框的三个地方。其中,在Show result as中,选择“Fractions”时,曲线纵坐标是从0-1;选择“Percents”时,那么纵坐标是从0-100。
结果是这样的。。。
修饰篇
4、双击Y轴,如下图将Automatically determine the range and interval前的√去掉, 把Range中的Maximum改成100,同时将Major ticks intervals改成20,点击”OK“,就可以获得我们常常看到的生存曲线了。然后再以同样的方式设置好X轴。
5、最后就是曲线的美化了,双击任一生存曲线可以改变曲线的颜色,线型。改的同时图示中的颜色和线型也会同步改过来。
PS:可在左侧的Curve comparison中查看p值并添加在图片中。
6、大多数研究会讨论中位生存时间。只要在图中双击Y轴,在”Additional ticks and grid lines“中写入0.5 (如果开始作图时选择”Percents“,这里应写入50),点选 Tick Line在Details按钮中选择参考线的颜色和线型,最后点Export将图片输出即可。同样的,添加X轴的参考线,也可参照以上的方法。
7、这样就可以得到以下这条符合要求的生存曲线了。
可由图中看出,实验组的中位生存时间大概是80天,而对照组的中位生存时间大概是100天。
41:Endnote,知道这些才算够!
42:癌症防治新希望,关于肿瘤疫苗的那些事
43:盘点 | 靶向药物的适应症和不良反应全汇总
44:知网涨价,Sci-hub又上不了时,肿么办?
45:SCI作图,如何摆脱图样图森破
46:如何慧眼识珠,与SCI杂志两情相悦?
47:盘点 | 论文写作中,遇到的那些好用神器
48:盘点 | 靠谱protocol哪里找?
49:GIF动图, 这样学习统计好欢快!
50:Protocol集中营,你值得拥有!
回复SCI、国自然、信号通路、CNS、实验工具、统计查看相应专栏文章!