一文读懂 | 与自噬相关的mTOR信号通号
特别福利:关注 "解螺旋" 微信公众号,回复关键词"7月"可索取2016年7月资源包三款语言神器:国产纠错神器-易改1check+语法纠正神器Ginger+写作风格检查神器WhiteSmoke。
作者:解螺旋·老谈
如需转载请注明来源:解螺旋·医生科研助手
近年来,关于自噬的研究呈现汹涌之势,在这股浪潮还未消退之际,我们能做点什么呢?接下来,就将为小伙伴们讲述自噬相关的信号通路,为大家的课题研究指明方向。
根据胞内底物运送到溶酶体的方式不同,哺乳动物细胞自噬可分为三种主要方式:巨自噬(Macroautophagy),微自噬(Microautophagy)和分子伴侣介导的自噬(Chaperone-mediatedautophagy)。
通常我们研究的是巨自噬,包括:信号刺激,吞噬泡的形成,吞噬泡与内含体/溶酶体的融合,内容物的降解以及降解产物的释放。
一方面,在正常条件下,mTOR高磷酸化Atg13抑制其活性。而mTOR的抑制信号,导致Atg13去磷酸化,形成ULK1(Atg1)-Atg13-FIP200复合物。
另一方面,抗凋亡蛋白Bcl-2/Bcl-XL/Bcl-w通过它们的BH3结合凹槽与Beclin 1的BH3结构域相互作用抑制其活性。而JNK1/DAPK途径能阻断这种抑制作用,具体地,JNK1磷酸化Bcl-2,DAPK磷酸化Beclin 1的BH3结构域,进而促进PI3K复合物III(对Atg蛋白的组装非常重要)的形成。
上述两种复合物是吞噬泡(双层膜结构)形成所必需的。随后,Atg12-Atg5-Atg16复合物和LC3嵌入膜上,形成自噬体。自噬体与内含体融合形成自噬内含体,最后,与溶酶体融合形成自溶酶体,降解内容物。在此过程中,Atg12-Atg5-Atg16复合物以及部分 LC3-II 便从外膜上脱落,只保留下膜结合形式的 LC3-II 定位于自噬体膜的内侧上。因此,LC3-II的含量或LC3-II/LC3-I的比例与自噬泡的数量呈正相关。
mTOR作为一种保守的丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶,是调节细胞生长、增殖、运动、存活和自噬等上游通路的汇合点。这里,我们主要看PI3K/AKT/mTOR抑制自噬的信号通路,它在许多肿瘤中被激活。
生长因子抑制自噬:生长因子信号激活PI3K/AKT/mTOR信号途径,从而抑制自噬(紫红色)。
饥饿和ER(内质网应激)压力促进自噬:AMPK/CaMKK信号途径(深绿色);p53/DRAM信号途径(深黄色)。
Ras信号途径既能促进自噬,又能抑制自噬(淡绿色)。
各种信号分子相应的抑制剂,如G蛋白耦联受体拮抗剂(淡蓝色)。
mTORC2调节细胞存活和细胞骨架,且能磷酸化AKT,导致mTORC1激活。
mTORC1促进细胞生长和代谢,而通过结合ULK1复合物抑制自噬。mTORC1的活性受到许多信号的调控,其主要调控因子是TSC蛋白质。TSC2与TSC1形成的复合物能使 Rheb 由活化形式转变为非活化形式,从而抑制 mTORC1的活性。而活化的AKT能够磷酸化 TSC2从而阻止 TSC复合物的形成,进一步导致 mTORC1的激活。
(1) mTOR激酶直接作用于Atg蛋白来调节自噬体的形成;
(2) mTOR介导的信号转导作用于下游效应物,如4E-BP1、S6K激酶,启动相关基因转录和翻译,从而调控自噬。
因此可检测S6K的磷酸化水平来研究有无激活mTOR信号途径。
综上,在我们的实际研究中,可以通过检测自噬相关markers来判断自噬发生与否。当然,如果发现靶分子作用于mTOR上游某分子,如Rhed,也可以和mTOR信号通路介导的增殖/自噬等联系起来。
目前,关于自噬的研究已经不单局限在肿瘤细胞中了,最近的研究开始将自噬与干细胞、微环境联系在一起了。
如下图所示,自噬调控神经干细胞分化为星形胶质细胞的机制。
Autophagy-related gene Atg5 is essential for astrocyte differentiation inthe developing mouse cortex. EMBO Rep. 2014, 15:1053-1061.
Atg5过表达后,LC3被激活,通过自噬降解JAK2-STAT3途径的抑制蛋白SOCS2,从而消除了SOCS2对STAT3的抑制作用,因而激活JAK2-STAT3途径,最终调控星形胶质细胞的分化。
这里用自噬代替了俗套的泛素化降解,着实让人眼前一亮。因此,小伙伴们不妨尝试检测自噬相关markers在肿瘤细胞、成纤维细胞、干细胞等的表达变化,来充实自己的研究!
51:一个神奇的网站:检索、分享、同行互助一站搞定
52:干货 |三天征服高冷女神Chip记
53:Endnote,知道这些才算够!
54:分享 | 高水平SCI的七步成文法
55:论文投稿开始要求图形摘要了,怎么弄?
56:3款语言神器,从此告别英文写作图样图森破
57:Pubmed检索实用指南:精准搜索和全文下载
58:干货 | 除了找文献,Pubmed还能干这些
59:如何在七天内写出一篇漂亮的英文综述
60:想和期刊编辑愉快的扯淡,你需要这些…(编辑信件回复模板集萃)
回复SCI、国自然、信号通路、CNS、实验工具、统计查看相应专栏文章!
投稿邮箱: tougao@helixlife.com.cn
合作微信:helixlife6