一句话知晓实验方法怎么选?WB、SPR、ELISA…
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作者:解螺旋.麦子
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在分子生物学实验室里的玩法,无非就是用某种特定的刺激物(如细胞活素)去刺激一些细胞或组织,让它们high起来,然后分析细胞对这些外源刺激物的反应,检测细胞内哪条信号通路被激活或失活,或者什么蛋白被分泌出来。这里面就有很多种方法,哪种最合适,关键看你要检测这个反应的哪个方面的特性。
WB
建立蛋白质的个人档案
一个典型的免疫印迹实验(Western Blot,WB)可检测信号通路中某种蛋白质的特性、表达和分布,分析容量大、敏感度高、特异性强。
但至于蛋白-蛋白相互作用则要用另一种更复杂的方法,即免疫共沉淀法(Co-immunoprecipitation,Co-IP),它接近细胞内的生理情况,是以成为经典方法。
WB影视,实验做累了可以用
SPR
想知道Ta和Ta能有多亲密?
表面等离子共振(Surface Plasmon Resonance,SPR)除了研究蛋白-蛋白相互作用(例如受体-配体相互作用),还有可研究小分子-蛋白或细胞-蛋白的相互作用。这种方法不需要标记蛋白(荧光标记或同位素标记),还可以实时定量分析这些相互作用的亲和力、热力学、动力学特性。SPR是分析动力学和亲和力的金标准。
SPR咖啡,熬夜读文献的时候用
EMSA
蛋白瞄着核酸,我们又瞄着那些蛋白
电泳迁移率实验(Electrophoretic Mobility Shift Assay,EMSA)最初用于检测DNA结合蛋白与相应的DNA序列结合的情况,可做定性和定量分析,包括细胞核中的转录因子(如NF-kB )的活性等等,现在也常用于研究RNA结合蛋白和相应的RNA序列相互作用。
这些分析用酶联免疫吸附实验(EenzymeLinked ImmunosorbentAssay,ELISA)也可以做,原理差不多。
EMSA,德国家居品牌,休息区的椅子可以吗?
PCR
把小树养大才能更好地招风
转录因子激活并和靶基因结合之后,该基因就被激活。PCR(Polymerase Chain Reaction)或Real Time PCR可以把特定的DNA序列大幅扩增,便于检测活性基因的表达情况。
PCR,用途很广啊
ELISA
追踪到天涯海角!
如果要看看细胞外如何,比如细胞培养上清液或体液中的某种蛋白质分泌情况,则通常选用ELISA,从而获知相应基因的活性。
艺人ELISA,在实验室放放她的歌吧……
参考资料:
http://bitesizebio.com/19759/western-blot-elisa-or-pcr-which-technique-should-i-use/
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