解螺旋公众号·陪伴你科研的第2924天
欢迎来到毕业季导师吐槽现场!又是一年毕业季,论文不仅废学生,更废我们导师。有的导师已经被学生的奇葩论文伤害到直接躺平,只愿看一眼漂亮的终稿。有的导师则纯属“自虐”,比如我,每一稿都强忍痛苦看完,并给出一堆得罪学生的修改建议。话说,最近我发现学生发我邮箱的论文动不动就被归入垃圾邮件夹,直到我提心吊胆地打开一探究竟,才发现人工智能真是深不见底,果然是“垃圾”。于是,我反手就借用系统用语回复了学生:“你的邮件疑似垃圾邮件,请调整正文内容或是排版后重新发送。”真没想到,2分钟后,学生又发来一版,内容完全没动,仅仅只是修改了文件名。
于是,我也只能毫不客气地修改了一通,并在修改意见里再次提出了8大灵魂问题:这个内容很有趣,但和你的研究有关系吗?
这么多年了,我第一次不知道怎么改你的论文,你真是太厉害了!我该拿你咋办呢?
这版严重缺乏论证逻辑,我让你增加的引用案例,你加了吗?
这部分借鉴了好多,不害怕查重吗?
这种格式是你独创的吗?
word天哪!图片都是糊的,发之前要仔细检查下,请问我说过多少遍了?
再说一遍,你积累的数据量太少,图表展示太low,今年的学术图表培训你有参与吗?
以上问题你看完才有资格说看不懂,不懂的话也不要着急,延期2年我细细教你,你看可以吗?
以我对学生的了解,你不仅要在修改论文时反复提出同一个修改意见,还要提出强制性学习策略,才能彻底解决问题。
就拿学术图表质量差这个问题来说,每年我都不得不重演“延毕要挟”让他们系统学习技能,把文档整理好喂到学生嘴里,论文质量才能有所改善。
鉴于世界上不是每位学生都能有幸碰到我这样的“自虐且负责到底的导师”,据我所知,有很多学生还被放养着,我在此跟大家分享下我们课题组集体都要学的——学术图表必修技能。好人做到底,也送给每个为论文操碎心的导师,搞定它保证师生可以和睦相处。
多数期刊对不一样的图也会有不一样的要求,一般来说有三种要求:1.line artwork(纯纯的黑白图,没有中间颜色)。是要求最高的,1200dpi以上。2.combiantion artwork(halftone artwork与line artwork的组合,或彩色图与line artwork的组合)。属于中间档,600dpi以上。3.halftone artwork(颜色深浅有差别的灰度图,也就是我们最常用的形式)。要求最低,300dpi以上就OK了;大家可以从实验阶段就留心保存高分辨率的原始图,一般来说600dpi就完全够用了(lineartwork是极少数的情况,特殊对待),我们不能一味追求高分辨率,分辨率太高会导致图片很大,投稿时上传容易出现困难。
多数期刊要求图片为TIFF格式或EPS矢量图,并且要形成独立文件。这就意味着大家要告别自己钟意的bmp或者jpg格式。因为bmp或者jpg格式这两种格式包含的信息量相对较少,即便是可以转换为TIFF,质量也会因此而下降,部分图像信息也会丢失。
强调下哈,物理大小虽然在投稿阶段并没有做出严格的要求,可在印刷排版时就会变得格外讲究起来。不过,大家也不要过于担心,一般情况只会规定一下宽度,半幅(单栏)在7.5cm左右,全幅(双栏)在15cm左右,不同期刊的要求会略有差异。欢迎补充。
关于这个问题大家很少会注意,一般情况分为2种:RGB用于数码设备上;CMYK为印刷业通用标准,这两种对图片色彩的要求也是不尽相同的,多数期刊在Manuscripts Accepted for Publication阶段会要求图片为CMYK色彩。
但现在很多期刊都是有网络版的,且RGB图比CMYK图表现出的效果好,色彩亮丽,更适合出现在网络上。而由RGB转变为CMYK模式容易,但是由CMYK模式转变为RGB模式,图象的表现力却会下降。所以有些期刊开始要求提供RGB的图。建议大家平时也留心保存RGB的图,不管是为了发表论文还是制作PPT报告,RGB的图都要更加合适。
以上,请大家熟读并默记以上常识,接下来才是重头戏,也就是我们在实际动手操作时会常犯的4大错误。这个大家懂的都懂,近期爆出的学术造假都有一些图片“误用”的情况存在。图片的真实性很重要,千万不要抱有侥幸心理。实验室其他成员的数据图也不要随便用,学术不端,被锤不仅是两行泪的问题!主要指图片比例不当、图表数据瞎排等。一个好看的论文配图一定要图和文字的比例得当,字体一致。表中数据与表格的排列要符合逻辑。标注等要清晰明朗方便理解。所列的指标名称应使用固定的缩略语。使用不常用的单位和缩写词时,需要在表注中说明。表格中的法定计算单位,一律使用符号,单位应该遵循国际标准命名原则。我们在制图时使用PowerPoint、Word中的一些功能进行组合,就很容易出现一些质量问题,在制作配图时还是应该多尝试使用专业学术类软件。科研绘图的重要性再强调也不为过!图片有更好的视觉传达效果,优质的论文配图不仅能为论文增光添彩,还能提升论文的层次,大大提高论文的中稿率。道理大家都懂,但是掌握这个技能也是真的难,尤其是看到大佬做的图,再看看自己的渣图,实在是惭愧!
下图是Cell的一篇文章中的信号通路图,看过是不是顿时心生崇拜之情,你要是也能做出如此高大上的图片,岂不是就离顶刊更近一步了呢?这里,我要告诉大家使用Excel、SPSS或者PS都不是最好的办法。今天我强推这款SCI图表的专业软件,大名鼎鼎的GraphpadPrism。不光我在用,全世界科学家都在用!来自110个国家/地区的超过75万名科学家在用Prism的呈现他们的研究结果。- 基础统计分析和绘图功能齐全,不需要输入程序语言,全自动生成计算结果和图表,且可以与MicrosoftOffice软件无缝衔接并自动更新。
- 几乎所有的图表元素,包括坐标轴、绘制的图形外观、标题、网格和辅助线、刻度标签等,都可以自由编辑。
- 图表排版方便,具有魔棒工具和从模板克隆创建图表的功能,可以快速统一图表外观形式。
- 曲线拟合功能尤其强大,集合了生命科学领域常见的曲线模型,快速拟合。
- 软件体积小(当前版本9.3.1安装包大小仅为87.8M),界面友好,学习成本低,自带学习数据和教程。
或许你会问,市面上有没有比它更好用的软件,考究如我,在摸索了十来种市面上常用或是小众的软件后,还是首推——GraphpadPrism。相对于其他统计绘图软件,例如R语言,它的绝对优势是可以直接输入原始数据,自动进行基本的生物统计,同时产生高质量的科学图表。
它简单易学,和Excel一样傻瓜,但比Excel规范得多,它比SPSS画出来的图要美。由于Graphpad容易上手,它的用户也很多,在Mac OS和Windows系统中都能使用。并且可以根据需要作出各种各样的图表,散点图、折线图、箱图、生存曲线、ROC等等。你也可以根据期刊的要求,直接生成对应的格式,再也不需要用ps调整像素了。综上所述,GraphpadPrism绝对是一款非常棒的医学绘图软件。他基于生物统计,曲线拟合和科学绘图于一体,从数据统计到figure的完成,GraphPadPrism可以一条龙服务,几乎可以搞定大部分医学研究所需的统计与作图。如何才能很快上手GraphpadPrism呢?
我们都知道,“一图胜千言”。无论是在SCI投稿,还是在课题申请和成果申报中,一张让人赏心悦目的科研插图,离不开一手好的作图技能!
大道理都懂,但是,很遗憾,在座的各位,并没有掌握这个技能。
据我所知各位手残党的惨状是:
A同学:想学,找导师请教,可是导师太忙,还不敢催,下一次请教的机会在下一次。导师又记得他找来学习过,所以使用作图任务就来了~
B同学:不想学,试图偷懒,向专业的公司寻求帮助,一般插图报价普遍都在1000元以上(源文件需另付报价的40-50%),被高昂的价格和反复的沟通成本劝退。
C同学:尽管准备好了学费,也不知道到底该去哪里学靠谱。
基于此种现状,我劝大家撸起袖子,自己亲自动手研究这门GraphpadPrism论文插图软件,学到就是赚到。
问题又来了~
数位同学表示:哪怕看了网络上数量繁多的GraphpadPrism教程,自己摸索效率真的很差。
网上虽然有很多GraphpadPrism的教程,但是,这些教程有很多的问题,比如版本太老,或者讲解不够详细等等。
我认识的GraphpadPrism用得很溜的科研人,他们的硬核做法是直接翻开《GraphPadPrism学术图表》这本经典教材,从头到尾,边操作,边翻书,书翻完了,作图的技能也被磨出来了,顺便还实现了斜杠人生。
为了助力每位科研人顺利发SCI,按时毕业,解螺旋决定:0元包邮送给各位这本口碑超高的配套工具书《GraphPadPrism学术图表》,哪里不懂,翻哪里,朴实无华,现学现用,让你的论文图表颜值无比sexy!
《GraphPadPrism学术图表》
全书内容共9章,我们帮大家理了下,各个章节的内容介绍,如下:
书里都有啥?上下划动查看第1章介绍了
软件下载、安装、使用界面、图形修饰与美化、学术图表配色、图片导出和发送等内容。
第2章介绍了
常见学术图表分类及选择与软件内嵌的大部分统计方法。
第3章介绍了
XY表及该数据表类型所支持的12类图表的绘制方法,以及带统计分析的XY表图形绘制,如相关分析、回归分析等。
第4章介绍了
纵列表(Column)及该数据表类型所支持的6类图表的绘制方法,并基于实例介绍了包含t检验和方差分析的相关图表绘制方法,以及ROC曲线、Bland-Altman图的绘制。
第5章介绍了
行列分组表(Grouped)及该数据表类型所支持的5类图表的绘制方法,并基于实例介绍了二(三)因素方差分析。
第6章介绍了
列联表(Contingency)及该数据表类型所支持的图表的绘制方法。
第7章介绍了
生存表(Survival)及该数据表类型所支持的生存曲线的绘制方法。
第8章介绍了
局部整体表(Partsof whole)、多变量表(Multiplevariables)及嵌套表(Nested)这3种数据表及其所支持的图形绘制,尤其是GraphPadPrism 9 新增的主成分分析和气泡图。
第9章介绍了
GraphPadPrism 绘图进阶技巧,包括首选项设置、图形组合、自定义配色方案、魔棒工具、克隆和模板等内容。
1. 系统介绍GraphpadPrism 9软件的使用方法,专业绘图大户!
大家都知道,作为一款专业的数据处理和绘图软件,GraphPadPrism 以其便捷性和专业性,在学术图表绘制中具有重要地位。
对比下来,目前在市面上系统介绍GraphPadPrism 绘图的图书难得一见,个别图书也只是对该软件较低版本的一些简单功能进行了介绍。
然而,这本书就很秀了,本书主要介绍基于GraphPadPrism 9 的学术图表绘制方法,可谓是赢在起跑线!本书以软件所定义的8种数据表为纲,按照“数据录入—数据分析—图表生成与美化”的顺序,结合科研实例,使用t检验、方差分析、生存分析和主成分分析等相关统计分析方法,介绍了散点图、气泡图、柱状图、线图、饼图、面积图等常见学术图表的绘制和美化方法。可谓一本书在手,从此可以绘制天下美图!3. 全面展现学术图表的绘制和美化过程,可洗眼睛了!
这本书开篇就介绍了GraphPadPrism图形生成和美化流程、学术图表配色原则和技巧、常用学术图表类型和软件内嵌的大部分统计方法的选择等内容,内容可谓细致入理,环环相扣,重点是这个过程很洗眼睛,颜狗福利!4. 手残党可“依葫芦画瓢”地绘制学术图表,太要友好!本书适合于需要绘制学术图表的高校学生和科研人员,也就是我,并且不需要具有GraphPadPrism使用基础,只需要具备基本的计算机知识即可用本书。因此,本书通常可以作为小白的工具书,可使我“依葫芦画瓢”地绘制所需要的学术图表。但在涉及统计分析时,我需要结合自己的专业知识背景和统计学知识进行判断。(对小白太友好了,我打算给本书的作者写封致谢信了!)5. 最后,就是本书还提供59个绘图源文件下载,这服务到位!01更多的时间
极简教程常规需要3个月学会的,3天就能学会
03发更高分的SCI
掌握顶刊的图表制作技巧,发更高分SCI
总之,为了导师的身体健康,大家顺利毕业,建议大家下次再发论文修改稿之前先修炼好作图技能,背诵以上作图常识,按照要求改。涉及到格式问题也可请教师兄师姐,内容修改意见不明白的也可以和导师沟通,尽量交上的论文不要遍一遍又一遍的废掉,这样实在是太耗时间,也太费导师了......
最后,再啰嗦一句,想要系统掌握科研绘图,或者希望自己画图技能更加精湛的同学,快来把这本书0元带回家吧,以后绝不在学术图表上出丑!