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工具 | 手把手教会用Meta-disc做森林图

2015-12-04 解螺旋

特别福利:关注解螺旋微信号,回复关键词“12月”,可索取12月资源包:结肠癌文献视频讲解+SPSS软件及使用教程。

作者:解螺旋.叶子 解螺旋原创

转载请注明来源:解螺旋,医生科研助手

在选完题找好文献后,Meta分析就要把那些文献录入分析数据软件。这里入门的软件推荐用Meta-disc,它适合用于诊断性Meta分析,这款软件的功能很强大,而且具有操作简单、容易学习等优点。最后,这是个免费软件!(回复“disc”可下载软件)


怎么用Meta-disc进行数据录入呢?有三种办法:1、直接键盘手打;2、从Excel中复制粘贴到Meta-disc数据表中;3、点击菜单栏“file”——“import textfile”导入txt或csv格式文件。我们以第二种方法为例:从excel中直接复制粘贴,这也是最常用的一种方法。




上图中所示为Meta-disc所必须的栏目,左边起第一列为Author,即我们所纳入的文献第一作者名字。第二列为studyID,这列我们可以给每一篇文献进行一个编号,图中我们输入的是年份。


有时候如果合并结果的异质性较大,我们会做相应的亚组分析或Meta回归分析来探讨异质性的来源,这时候我们在录入数据时需要增加相应的列数。例如,我们纳入的文献来自于不同的国家或地区,我们想根据研究地区做一个Meta回归分析,在图中所示的界面中单击鼠标右键——datacolumns——add column,弹出下图所示的对话框,输入“country”,点击Aceptar,然后将每一篇文献的研究地区复制到相应的表格中就可以了。




接下来就能进行森林图的制作了,点击菜单栏中的“Analyze”选项,在下拉列表中选择“Plots”。在左上角的列表框中选择诊断性分析需要的指标:敏感度(sensitivity)、特异度(specificity)、阳性似然比(positiveLR)、阴性似然比(negativeLR)、诊断比值比(diagnosticOR)及SROCcurve,就可以得出相应的森林图和曲线图啦。




到这里图就做好了,点击图中右边“Export”按钮,选择好格式并命名就可以保存了。到这里,森林图就算是做好了,不过有时候会出现bug,如下图。




森林图右侧的信息并不能完整展示,这样的图片拿去投稿,90%以上是要被打回的,不仅浪费时间,也给编辑留下不好的印象。


那么,该如何解决呢?其实,方法很简单,保存jpg格式后,除了得到对应的文件外,Meta-disc也会有一个弹窗,这就是关键!这个图的边框是可以拖动的!那么我们就拖动它,拖动到图形完全展示,然后Ctrl+C,Ctrl+V,把图形粘贴到word,最后,将word另存为PDF。这样就可以得到高清的、符合发表要求的图片。如果想保存为jpg、tiff等格式,可以用PS软件打开PDF,然后另存。


经过这一系列的处理,就能得到高质量的森林图啦。



12月第1期微信群活动

主题:肿瘤靶向治疗——揭示针对RAF和MEK位点的靶向抑制剂的耐药机制

讲师: 王刚

时间:12月5日(周六)晚7点-8点半

文献名称:The Hippo effector YAP promotes resistance to RAF- and MEK-targeted cancer therapies

地点:解螺旋SCI微信群

文献来源:Nature Genetics 47, 250–256 (2015)

文献原文链接:http://pan.baidu.com/s/1eQdlbea 密码:5vdy


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