美国国家卫生研究院研究员开发可以加快药物开发的软件

原文：NIH-led researchers develop software that could facilitate drug development出自：https://www.nlm.nih.gov翻译：医药研发社交平台翻译志愿者联盟郭嘉聪吴云山Walker时间：2016-08-03

由美国国家卫生研究院（NIH）研究员Teresa Pryztycka博士带领的研究团队开发出了一种叫做AptaTRACE的软件。该软件可以为药物开发者和其他科学家高精确度地鉴定出具有结合靶标能力的分子。Teresa Pryztycka博士
“这项研究最好地说明了如何从基于已有算法产生的大数据中获益，该算法可以将大数据转化为实用的信息。“ NIH国家医学图书馆旗下国家生物技术信息中心的资深研究员Pryztycka博士如是说。
适配体是能以高亲和力和专一性结合各种生物靶标的短链RNA或DNA分子。适配体序列和结构的特征与靶标表面的生化特征互补所以可以结合。.适配体的可能靶标包括有机小分子、蛋白或蛋白复合物、病毒表面及整个细胞。广泛的靶标范围使得适配体可以作为候选物在从分子生物传感器到药物传递系统到抗体置换等方面得到应用。

AptaTRACE设计上与识别适配体的实验室技术Exponential Enrichment的指数富集的配基系统进化技术（HT-SELEX）一起使用。 HT-SELEX 可以分析数以百万计的供选序列来识别靶标结合物。AptaTRACE则分析这个数据来发现可结合序列的共有特征（结构基元）。 
AptaTRACE 是第一个使用非常多轮的选择产生的全方位的排序数据来捕获结合靶点的适配体的序列特征和结构特征的算法。这些信息让研究者更好的理解为什么有些分子结合到靶点而其它分子不结合。理解这些结合结构的特征很关键，比如可以利用HT-SELEX识别的适配体来进行改造适配体从而将它转化为针对特定细胞的药物传递系统。这项介绍AptaTRACE的研究发表在7月27日发表的《Cell Systems》杂志。AptaTRACE 由Przytycka博士的研究组和加利福尼亚杜阿尔特希望市贝克曼研究所John Burnett博士领导的研究组以及德国弗莱堡大学Rolf Backofen博士领导的的研究组合作开发。John Burnett博士
AptaTRACE可以从NCBI网站和《Cell Systems》网站下载。下载链接： http://www.ncbi.nlm.nih.gov/CBBresearch/Przytycka/index.cgi#aptatools。 

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