转录组测序技术哪家强？百迈客首选没商量！

下周一就是中秋节啦～小编提前在这里祝大家中秋节快乐～实验顺顺利利，文章快快接收，Paper早早见刊～～哈哈

回归正题，测序这个词对于科研人员已经很熟悉了，大部分实验室做测序，尤其普通转录组测序现在就如做常规PCR一样，基本可以说是分子实验室必备的技术之一，转录组研究能够从整体水平研究基因功能以及基因结构，揭示特定生物学过程以及疾病发生过程中的分子机理。因此，RNA-Seq作为一种新的高效、快捷的转录组研究手段正在改变着人们对转录组的认识。

根据转录测序历程发展，测序分为cDNA芯片、Sanger测序、二代高通量测序和三代高通量测序技术。cDNA芯片特异性强、通量低、成本高，主要基于杂交技术的cDNA芯片和寡聚核苷酸芯片；Sanger测序长读长、准确度高、通量低、成本高，主要基于sanger测序的SAGE、LongSAGE和MPSS；二代高通量技术通量高、时间快、成本低，现在用的比较多的是IlluminaHiseq X-TEN和Novaseq系列；三代高通量测序RNA不需打断、长读长、通量低、成本高，主要有单分子荧光测序和电信号纳米孔技术的Pacbio和Nanpore技术；根据科研的应用方向，目前主流采用二代和三代高通量测序技术，自2005年随着二代高通量测序技术的发展，测序数据呈爆发式增长，NCBI发表的转录组测序文章亦是非常之多，在NCBI输入关键词transcriptom，统计文章数目，见下图，感受一下：

数据源来自NCBI

随着测序技术不断升级，基于第三代测序技术的全长转录组测序能够直接获得单个RNA分子从5’端到3’端的全长转录本，无需拼接组装就能够精确发现新基因和转录异构体，鉴定可变剪接、融合基因以及等位基因等结构分析。目前第三代单分子实时测序技术主要分为两大技术阵营：2011年PacBio公司推出了PacBioRS单分子实时测序仪，通过对单分子合成中的碱基磷酸基团上的荧光信号进行识别，并转换为碱基信息，其特点在于RNA无需打断，直接获得全长，准确性高，局限在于需要用二代测序数据对转录本进行定量。紧随其后，2012年Oxford NanoporeTechnologies（ONT）公司推出世界上唯一的采用纳米孔技术，将电信号转化为碱基序列的商业测序仪，相对于Pacbio，Nanopore既可以获得全长转录本，又可以对转录本定量，不需辅助二代，即实现转录本的定性和定量分析，成本低，可以说是科研界的新宠。Pacbio和Nanopore测序平台可谓各有所长，科研工作者可以根据自己的需求选择不同的平台。

基于Pacbio三代测序文章数逐年增加，2017年呈现爆发式增长近40余篇，文章发表影响因子累计400多分，2018年上半年已发表十几篇，表明越来越多的研究采用三代全长转录组阐释科学问题。截止2018年6月不完全统计三代全长转录组发表文章数目，见下图，感受一下；

Nanopore测序技术可谓是占尽了二代和三代的优点，短短几年的时间，芯片和软件不断更新迭代，迅速打入了测序市场。据官网统计Nanopore全长转录组测序技术发表文章将近四十余篇，部分文献，见下表，感受一下：

在科研和医学应用方面，二代和三代测序运用可谓遍地开花，那么百迈客作为紧跟时代前沿的领军者，在二代和三代测序技术经验也可谓业界其中一霸，何出此言呢，咱们下面拿实力说话。

据不完全统计，自2012年-2018年8月31日，北京百迈客转录组调控成功案例已累计发表296篇，累计影响因子（IF）909.4分，2分以下，63篇；2-3分，94篇；3-5分，113篇；5-10分，26篇，其中，转录组239篇，非编码RNA 、甲基化、蛋白组和代谢组共51篇，全长转录组6篇，2018年截止8月，成功案例已发表81篇，5分以上，11篇，主要为：

Plant Biotechnol J,Plant Cell Environ,J Exp Bot,Cell Physiol Biochem,Plant Biotechnol J.Plant J.等高分杂志。

目前国内发表三代测序文章十余篇，百迈客自2015年率先引进三代测序平台PacBio RSⅡ和PacBio Sequel，至今已积累了丰富的项目经验，目前已成功发表6篇文献，是国内发表全长转录组成功案例最多的公司，已发表文章研究物种分别有杨树、甘薯、野生甘薯、兔子、跳甲和辣椒，覆盖领域分别为林木、哺乳动物、昆虫和作物等。

今年8月份牛津纳米孔公司与百迈客公司达成长期合作，已引入Oxford Nanopore平台，拥有MinION、GridION X5和PromethION三种型号全套纳米孔测序仪。

在这中秋即将来临之际，我们给各位科研大咖奉上中秋佳节大礼~~~

百迈客公司作为国内测序行业领军企业，致力于将最前沿测序技术提供给科研者，科研实力和项目经验，咱们拿文章说话，实力已经摆在那了，啥也不说了，百迈客转录调控测序雄起！还在犹豫的大咖，点击阅读原文，即可获得百迈客二代和三代高通量测序成功案例列表哦！

PS：上次参加Nanopore全长转录组-念师恩，留言赠好礼活动（重磅来袭！Nanopore全长转录组测序服务开始啦！），公司已经将礼物用顺丰快马加鞭给老师邮寄了哦，亲们等着收中秋礼物吧！