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百迈客Hi-C建库试剂盒,C位出道!


DNA序列是高度折叠压缩在染色体内的,DNA与DNA片段之间存在三维构象。最先提出的3C(Chromosome Conformation Capture)技术,用于测定染色体特定位点之间的交互作用。之后发展出了4C、5C 技术, 分别用于测定染色体上一点到多点和多点与多点之间的交互作用。在2009年Job Dekker 又开发出了Hi-C 技术实现了全基因组范围内的染色体片段间的相互作用的捕获。Hi-C技术通过甲醛处理将DNA与蛋白质交联在一起从而固定DNA的构象,并进行酶切、生物素引入、酶连和提取,然后对处理好的核酸进行文库构建和高通量测序,最终通过对测序数据进行分析即可揭示染色体片段间的交互信息。
目前Hi-C 技术主要的应用方向是辅助基因组组装和染色质互作。辅助基因组组装:在已有二代或三代组装的Draft genome序列和已知染色体数目的前提下,利用Hi-C测序数据将Draft genome序列进行染色体群组的划分,并确定各序列在染色体上的顺序和方向,使基因组组装组装水平提升到染色体水平。百迈客利用Hi-C 技术组装基因组,近几年已有多篇高水平的文章见刊。
 

成功案例

 01


英文题目:Sequencing of 243 diploid cotton accessions based on an updated A genome identifies the genetic basis of key agronomic traits.中文题目:以更新的亚洲棉A基因组为基础的243份二倍体棉花的重要农艺性状的研究发表期刊:Nature Genetics

本研究中,利用了三代PacBio和Hi-C技术,重新组装了高质量的亚洲棉基因组,分析了243份二倍体棉花种质的群体结构和基因组分化趋势,同时确定了一些有助于棉花皮棉产量遗传改良的候选基因位点。


02

英文题目:Allele-defined genome of the autopolyploid sugarcane Saccharum spontaneum L.中文题目:同源多倍体(Saccharum spontaneum L.)基因组等位基因鉴定发表期刊:Nature Genetics

利用二代BAC文库测序,三代PacBio测序及Hi-C研究技术,成功地将甘蔗基因组组装到染色体水平,进而对同源四倍体甘蔗AP85-441的多倍化,等位基因的优势表达,C4途径,抗病性等进行了研究。文中利用北京百迈客生物科技有限公司的Hi-C建库测序技术,并结合明瑞光课题组独立研发的ALLHiC算法成功地将甘蔗基因组组装到染色体水平,高质量甘蔗基因组的获得再次印证了百迈客Hi-C建库测序中绝对优势。


为了让更多科研工作者体验Hi-C建库,百迈客在成功构建多种物种Hi-C建库测序的经验上,正式推出了Biomarker Hi-C Library Prep Kit for Illumina。Biomarker Hi-C Library Prep Kit for Illumina涵盖了Hi-C实验全部环节,包括甲醛交联、Hi-C提取和Hi-C文库构建,适用于细胞系、动物和植物组织样本。1套Hi-C试剂盒包含5个反应,1个反应构建的文库可用于200Gb数据量的测序,试剂盒构建的文库适用于Illumina测序平台。



新产品上市预售活动

  • 原价购入1盒Biomarker Hi-C Library Prep Kit for Illumina,送一个Hi-C样本200G数据测序,仅限购买Hi-C建库试剂盒,完成建库后的测序。

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百迈客部分已发表文献案例









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内容:拓展部

编辑:市场部

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