【科研方法38】研究生如何做出高颜值的SCI论文配图？

科研sci绘图 2022-05-19

　　不少科研工作者，包括在读的博士生、硕士生等可能都有这样的体会：千辛万苦得来的实验结果，不知道该如何展现给别人？曾经有位论文审稿人在自己的博文中就写道：“我审稿时看稿件的顺序是题目、摘要、图表、前言、参考文献和正文”。可见论文中图片的质量是非常重要的，处理一张图可能会花费大量的时间，图片质量的好坏一定程度上决定了论文能否被录用。
　　而反过来，仔细分析大牛们的文章，不难发现，这些高水平论文的图表质量也高人一筹。那么，这些高颜值的SCI论文配图是如何来的？有什么秘籍吗？这里，小研特别汇总了SCI论文配图过程中可能遇到的各种需求。

SCI论文之作图四大原则

原则一：分辨率

多数期刊对不一样的图也会有不一样的要求，一般来说有三种要求：
　　1.line artwork（纯纯的黑白图，没有中间颜色）是要求最高的，1200dpi以上。
　　2.combiantion artwork（halftone artwork与line artwork的组合，或彩色图与line artwork的组合）属于中间档，600dpi以上。
　　3.halftone artwork（颜色深浅有差别的灰度图，也就是我们最常用的形式）要求最低，300dpi以上就OK了；大家可以从实验阶段就留心保存高分辨率的原始图，一般来说600dpi就完全够用了（line artwork是极少数的情况，特殊对待），当然也不能一味追求高分辨率，分辨率太高会导致图片很大，投稿时上传容易出现困难。

原则二：图片格式

多数期刊要求图片为TIFF格式或EPS矢量图，并且要形成独立文件。好多同学就会冒出来说：“我好钟意bmp或者jpg的。”小研表示绝不能纵容这类习惯的养成，因为这两种格式包含的信息量相对较少，即便是可以转换为TIFF，质量也会因此而下降（部分图像信息也会丢失哦）。

原则三：物理大小

关于这方面小研要强调这是不容忽视的。虽然在投稿阶段并没有做出严格的要求，可在印刷排版时就会变得格外讲究起来。但是大家也不要过于担心，一般情况只会规定一下宽度，半幅（单栏）在7.5cm左右，全幅（双栏）在15cm 左右，不同期刊的要求会略有差异。

原则四：色彩要求-仅针对彩色图

关于这个问题大家很少会注意，一般情况分为2 种：RGB用于数码设备上；CMYK为印刷业通用标准，这两种对图片色彩的要求也是不尽相同的，多数期刊在Manuscripts Accepted for Publication阶段会要求图片为CMYK色彩。但现在很多期刊都是有网络版的，且RGB图比CMYK图表现出的效果好，色彩亮丽，更适合出现在网络上。而由RGB转变为CMYK模式容易，但是由CMYK模式转变为RGB模式，图象的表现力却会下降。所以有些期刊开始要求提供RGB的图。小研建议大家平时也留心保存RGB的图，不管是为了发表论文还是制作PPT报告，RGB的图都要更加合适哦。

　　简单总结一下：会议文章对图片质量的要求比较低，一般投了后基本都没有修改的机会，而杂志文章对图片质量的要求相当高，可能来回改几次才能满足要求。如果论文投稿前就达到了较高的质量，相信修改时会轻松很多。

复制与粘贴的小技巧

　　图片：如果图片的来源是origin、visio、autocad等软件，且图片以后不需要再次修改，建议粘贴时采用“选择性粘贴”，选择“windows图元文件”或“增强型图元文件”；
　　文字：如果文字的来源是网络、pdf文件或者其他文档（格式不同），建议粘贴时采用“无文本格式”粘贴。

作图软件的利器

1.EXCEL

这个不用多说，小伙伴们都比较熟悉，不少小伙伴也习惯用excel来整理数据。不过需要注意的是，excel虽然在处理图表时功能强大，在作数据图方面，也毫不逊色，但是，它生成的图，分辨率有限。一般小文章要求不高（300dpi）没问题，但是一些要求严格的期刊，如1200dpi，它就无能为力了。而且，图片的导出只能通过复制、截图或者用VBA，前两者分辨率可能不满足要求，后者要装VBA，操作也非常麻烦。此外，有些特殊的图，excel也显得有心无力，比如纵坐标分段，又比如临床研究中的生存曲线。

2.Origin和Originpro

这两个都是OriginLab公司研发的专业制图和数据分析软件，简单易学、功能齐全、操作也很灵活，大部分科学研究的统计、作图、函数拟合等要求都可以满足，尤其适合曲线、曲面的图。它还提供了几十种二维和三维绘图模板，而且允许用户自己定制模板。Originpro是Origin的专业版，增加了峰值拟合、表明拟合、统计、信号处理等功能。生成的图片可以很方便地导出为TIFF/bmp/eps等十多种格式。

3.Prism

一个简单易用的医学绘图软件，功能非常强大，几乎能搞定所有医学研究所需的统计与作图。除了作图之外，它还能帮你把不同的图组合之后导出。

4.Statistical Product and Service Solutions（SPSS）

SPSS是世界上最早的统计分析软件，它的主打功能是数据统计分析（据说在国际学术界有条不成文的规定，即在国际学术交流中，凡是用SPSS软件完成的计算和统计分析，可以不必说明算法，由此可见其影响之大和信誉之高），但是它的作图功能也算齐全，而且很多excel无法做的统计型结果图（如误差线图），在它这里就轻而易举。

5.MATLAB

这个绝对是灰机中的战斗机。其强大的数据处理能力加上出色的显示能力，几乎能做所有的图片处理，传说只有你想不到，没有它做不到！但是使用它首先得学会MATLAB的编程。

6.图片的导出

上面提到的软件，除了excel外，本身都有强大的图片导出功能。

　　而事实上，我们除了数据统计作图后需要导出图外，还有一些图片，是实验过程中拍摄的照片，如荧光显微镜拍的显微照片。一般这些仪器配套的拍摄软件都会有比较齐全的图片导出功能。但是有些小伙伴觉得截图更方便，又不想损失分辨率。这里给大家推荐两款截图软件：ACDsee、Snagit。这两款操作简便，功能也非常强大，Snagit甚至可以捕获活动的画面。

共聚焦图片处理

　　1.拍照时要保留大中小三个倍数的图，且图片分辨率不能太低（我们用1024*1024），能大则大，我们是因为机器限制。用的时候要进行裁减，比如文章上放的是200倍和400倍的图，实际上200倍的图来自拍照时100倍的图，400倍的图来自拍照时200倍的图。这样有利于准确地形成系列图片。
　　2.图片对比度、中间色之类可以（或者是必须）在保证趋势的基础上进行适当调整。　　
　　3.荧光图片不提倡定量，定量要配合western。
　　4.应该是tif格式。
　　5.拍照时一般不要把对比度调节得太大，尽量保存细节。拍的太强了后期是不好调弱的，或者背底太暗了也会丢失细节的。这些后期都可以通过软件调节。
　　6.低倍-高倍的顺序。反之会形成暗区，特别是在高倍加zoom放大层扫之后特别明显。这是教训，不能看见高倍下面比较好的结果，就欣喜若狂，先高倍后低倍。
　　7.一定要保留你的oib格式，不能因为省空间，只存留tif格式。有些杂志会要求伪色，比如，红色的用粉色显示，要是有oib格式就很好调整，重新出图就是。没有oib，用其他软件转换也可以。

　　8.层扫的图片叠加或出2D的tif图，建议不要用“输出所见”这个选项，这样出来的1024-1024的会变成512-512，这时候还是选择一般tif，1024-1024，后期再用其他软件合成会比较好。
　　9.结果好，拍照好，才是最基本的，一定要杜绝对结果的修改。对于形态学的图片来说，用一些二进制的软件打开后可以明显看出修改过程。

　　除了上述的一些基本技巧之外，小研还为各位准备了进阶版的科研论文配图软件和技巧！

　　一篇好的文章往往是图文并茂的，有时一张清晰、直观、正确的图片会让文章显得更加优美、舒服、更有说服力，远远胜过一大段文字描述，这也是CNS的标配。

　　下图是Cell的一篇文章中的信号通路图，是不是顿时心生崇拜之情，要是也能做出如此高大上的图片，投稿的文章岂不是就离CNS这些高端杂志更近一步了呢？

　　看到如此精美的图片，绝大多数科研狗恐怕在心中膜拜感叹的同时，也在想这肯定是用专业的画图软件（如photoshop、AI）做出来吧？我等凡人怕是做不到吧？

　　NO!小研给大家推荐四款作图神器，让你分分钟搞定高逼格的信号通路图、各种模型图、流程图。

Scienceslide

首先第一个就是Scienceslide，这是一款专门做医学图片的ppt插件。

　　安装后，会在PPT界面出现一个工作条（如下图所示），包括了常用元件、信号通路、方法学、生物化学、分子生物学等几千种素材。

　　它做出来的信号通路图可以是这样的：

　　想要什么图，只需要选择相应的模板，就可以在此基础上进行文字及分子形状的修改，而后可以做成精致无比、赏心悦目的示意图。有了这个PPT插件，足以满足你对任何信号通路图的要求。

pathwaytool

另一个软件pathwaytool，也是一款作图神器哦。它几乎自带了分子生物学会用到的所有元素，如不同的细胞、细胞器、分子、老鼠模型、器官模型以及经典的信号通路图。安装该软件后，它的界面是这样的：