（策略篇）：To be or not to be, that's a question！
大家好，我们今天讲的主题是lncRNA在基因可变剪接（Alternative Splicing，AS）中的研究，我们在第一季的第一期介绍了可变剪接:聊基金系列 • 第一期：选择性剪切（一龙生九子，九子各不同），大家回复11可以查看。
一般来说，基因经过可变剪接产生的异构体分子结构和功能上会有差异，比如
活性上的差异：异构体A活性高，异构体B活性低；
功能上的差异：异构体A促进某一过程，异构体B抑制某一过程；
定位上的差异：异构体A定位于胞浆，异构体B定位于胞膜或者胞等等，而这些改变则会导致生物学过程的变化，从而导致疾病发生、发展。
由于基因的可变剪接一般都是由剪接因子所介导，而lncRNA作为一类可以调节蛋白的分子，完全有可能通过调控剪接因子的表达、活性和定位来调节下游分子的剪接过程，从而发挥功能。结合我们以前介绍的lncRNA对蛋白的调节方式，lncRNA可以影响剪接因子蛋白的稳定性（如泛素化，回复34）、产生（如翻译，回复4）、mRNA的稳定性（如反义lncRNA的经典调控模式，回复5）、与靶基因的mRNA竞争结合调控蛋白（回复37）等等，随着对这方面研究的深入，我们相信会有更多文章和基金出来。
以可变剪接为主题的中标基金还是不少的，不过lncRNA参与该过程的只有2012年一项：
BMAT1通过结合hnRNP-I调控TAZ可变剪接促进膀胱癌EMT的机制研究 2016
CWC22调控Nnat前体RNA可变剪接介导的慢性炎性疼痛机制研究 2016
应激反应蛋白RBM3调节CD44可变剪接对前列腺癌进展的影响 2016
剪接因子U2AF2通过介导CD44s/v亚型转化调控黑色素瘤转移中力学信号转导分子机制 2016
pre-mRNA剪接因子PRPF3在肝癌发生发展中的作用及其分子机制研究 2016
lncRNA MALAT1通过SF2/ASF调控癌基因RON剪接促进膀胱癌演进的机制研究 2012
说明这方面的基金申请还是蓝海，大家可以多关注。
相关的文章也不多，我们选了三篇为案例来说明lncRNA通过调控可变剪接发挥功能的方式。
1. Wu H, Zheng J, Deng J, Zhang L, Li N, Li W, Li F, Lu J, Zhou Y.LincRNA-uc002yug.2 involves in alternative splicing of RUNX1 and serves as a predictor for esophageal cancer and prognosis.Oncogene. 2015 Sep 3;34(36):4723-34. 下载链接：http://pan.baidu.com/s/1hrGJt6c 密码：tjm9
LincRNA-uc002yug.2通过影响SFRS1、MBNL1等剪接因子与RUNX1 pre-mRNA的结合，从而上调RUNX1a的表达和下调RUNX1的表达，最后使基因CEBPα的表达水平下降，结果促进细胞增殖和肿瘤生长。
2. Villamizar O, Chambers CB, Riberdy JM, Persons DA, Wilber A.Long noncoding RNA Saf and splicing factor 45 increase soluble Fas and resistance to apoptosis.Oncotarget. 2016 Feb 11. 下载链接：http://pan.baidu.com/s/1kVwAD4F 密码：s87b
LncRNA Saf招募剪接因子SPF45到Fas pre-mRNA的6号外显子（exon 6）位置并进行剪接，使得Fas的跨膜序列被切除，从而降低了定位于细胞膜的Fas，而增加了可溶性的Fas，结果使得细胞对Fas介导的细胞凋亡不敏感。
3. DeOcesano-Pereira C, Amaral MS, Parreira KS, Ayupe AC, Jacysyn JF, Amarante-Mendes GP, Reis EM, Verjovski-Almeida S.Long non-coding RNA INXS is a critical mediator of BCL-XS induced apoptosis.Nucleic Acids Res. 2014 Jul;42(13):8343-55. 下载链接：http://pan.baidu.com/s/1eSbMgdc 密码：rusy
在凋亡诱导因素UV 等刺激下，lncRNA INXS 表达上调，而高表达的lncRNA INXS通过与Sam68剪接复合物结合，导致发挥促凋亡作用的BCL-XS表达上调，而下调发挥抑制凋亡作用的BCL-XL分子，从而促进细胞凋亡。
以上三篇文章都是lncRNA INXS通过与剪接因子结合从而调控下游基因的剪接过程，改变剪接产物的表达或者定位而发挥功能的。
下期我们分享一篇lncRNA通过调控基因的可变剪接发挥功能的文章：
The long noncoding RNA Pnky regulates neuronal differentiation of embryonic and postnatal neural stem cells.Cell Stem Cell. 2015 Apr 2;16(4):439-47. 下载链接：http://pan.baidu.com/s/1mi2En5A 密码：uhyq
最后，我们整理了前面发过的文章，见副本"往期内容查看方法"，回复相应数字即可。
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