（文章篇）S3E12: 定位，lncRNA作用机制的第三种模式
大家好，我们在前面介绍分子机制研究的时候，提到了三种方式：表达、活性和定位，我们从lncRNA的角度介绍了lncRNA影响表达、活性的不同案例，今天我们分享的是lncRNA通过影响分子的定位发挥功能的文章。实际上，我们在讲到lncRNA通过调控基因的可变剪接发挥功能时，介绍过案例LncRNA Saf通过招募剪接因子SPF45调控Fas pre-mRNA的剪接，结果使Fas的跨膜序列被切除，从而降低了定位于细胞膜的Fas，而增加了可溶性的Fas（回复8 查看）
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实际上，影响分子的定位是一种不太常见的机制调控方式，通常都是与表达或者活性一起。从基金来看，单独以分子的定位改变来发挥功能的项目也不多，而lncRNA参与其中的就更少了：
miR-494调节肝缺血再灌注损伤中HIF-1α胞内重定位的机制研究 2012
ITSN1-S蛋白的胞浆/胞核异位表达在乳腺癌中的临床意义及其入核调控分子机制的研究 2016
KPNA2通过运输c-Myc蛋白入核促进上皮性卵巢癌转移的机制研究2015
14-3-3ε通过转运hnRNP C1/C2出核调控CRC细胞自噬的研究 2015
我们今天我们介绍一篇案例文章：
Long noncoding RNA NEAT1-dependent SFPQ relocation from promoter region to paraspeckle mediates IL8 expression upon immune stimuli. Mol Cell (IF 14). 2014 Feb 6.
先上机制图：
正常情况下，转录抑制因子SFPQ结合到IL8的启动子区域，抑制IL8的表达；而在病毒感染或者其它炎症因素刺激下，lncRNA NEAT1转录增加，表达升高，将转录抑制因子SFPQ从IL8的启动子区域重定位到Paraspekles（Paraspeckles是一种位于哺乳动物细胞染色体间区、由非编码RNA-NEAT1与多种RNA结合蛋白构成的新型亚细胞核结构体），从而使得IL8的表达去抑制，上调IL8表达，从而发挥抗病毒效应。
我们主要介绍lncRNA NEAT1 （nuclear enriched abundant transcript 1）通过重定位SFPQ，解除SFPQ对IL8的表达抑制的分子机制。这篇文章有三个点我们以前提过：
1. lncRNA研究的上下游:
上游：lncRNA NEAT1表达被TLR3-p38信号通路所激活；
下游：lncRNA NEAT1与SFPQ直接结合，导致SFPQ蛋白从下游基因IL8的启动子重定位到Paraspekles；而SFPQ的重定位使得IL8的转录抑制被去除，结果IL8表达上调。
2. lncRNA分子机制的第三种：定位。
lncRNA NEAT1对SFPQ的影响体现在对SFPQ定位的影响。
3. lncRNANEAT1有两条活性不同的异构体。
lncRNA NEAT1 存在两条异构体：NEAT1v2 和NEAT1v1，而且NEAT1v2形成Paraspekles的能力强于NEAT1v1，而且NEAT1v2对下游基因IL8 mRNA水平的影响高于NEAT1v1。
好了，我们看这篇文章的研究内容：
1. Poly I:C促进Paraspekles形成并通过TLR3-p38 信号通路上调lncRNA NEAT1表达。
poly(I:C)（聚肌苷酸胞苷酸）是一种合成的双链RNA(dsRNA)类似物，是一种与病毒感染相关的分子模式。Poly(I:C)可被TLR3识别，诱导NF-kB的活化和细胞因子的产生。
这一部分，作者没有详细介绍lncRNA NEAT1表达上调的原因，只是说TLR3-p38 信号通路参与了Poly I:C介导的lncRNA NEAT1表达上调，并且发现lncRNA NEAT1的转录活性提高。
2. lncRNA NEAT1与SFPQ结合，并对SFPQ进行重定位；
在这一部分，作者重点对lncRNA NEAT1与SFPQ结合以及两者的结合位点及序列进行探索。当然，这里可能受到技术上的限制，对于同样位于细胞核内的SFPQ定位的改变，要是能对SFPQ的定位进一步检测，从而说明lncRNA NEAT1表达沉默后更多的定位于Paraspekles，结果就更好了。当然，如果换一种情形，如果lncRNA NEAT1将SFPQ的定位改变为出核，那么我们相信这部分结果肯定是有的。
3. lncRNA NEAT1解除SFPQ对IL8的转录抑制；
这一部分，重点在通过CHIP实验明确SFPQ对IL8的转录抑制，有意思的地方：
a. lncRNA NEAT1 存在两条异构体NEAT1v2 和NEAT1v1不仅对于形成Paraspekles的能力不同，两者对IL8mRNA的影响也不同，明显NEAT1v2 的活性更高；
b. NEAT1 表达沉默不仅使IL8 mRNA的表达下降，还使得IL8 mRNA的达峰时间从5h提前为3h，也就是说NEAT1还影响了IL8 mRNA表达的动力学变化，那么原因是什么呢？本文没有进一步说明，我们知道影响IL8 mRNA水平的因素是比较多的，比如其它影响IL8转录的因素，比如影响IL8 mRNA的降解的因素：像microRNA等，如果大家感兴趣，可以作为一个方向往下做，或许以后有文章会报导原因呢。
4. 病毒感染诱导NEAT1v2表达、促进Paraspekles形成，上调IL8表达。
好了，这篇文章就到这里了，全文下载链接：http://pan.baidu.com/s/1c11YCwS 密码: p3q8
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