（文章篇）S3E17：哎呦嘿，这小丫头片子还有两幅面孔呢？！（二）

大家好，我们前面分享过一篇Cancer Cell的文章"（文章篇）S3E10：哎呦嘿，这小丫头片子还有两幅面孔呢？！"(回复310查看)，讲的是 lncRNA-ATB 细胞上皮间质转化（EMT）和肿瘤迁移定植两种方式发挥功能。

今天我们再分享一篇文章，还是Cancer Cell，还是2014年的，还是两种方式：

The risk-associated long noncoding RNA NBAT-1 controls neuroblastoma progression by regulating cell proliferation and neuronal differentiation.Cancer Cell. 2014 Nov 10. 

这篇文章的主角是lncRNA NBAT-1，在成神经细胞瘤中发挥两个功能：细胞增殖/迁移和神经分化。

首先看机制图：

1）lncRNA NBAT-1通过与PRC2复合物的组成成分EZH2蛋白直接结合，通过影响组蛋白甲基化修饰调控增殖/迁移关键基因SOX9等的表达，发挥抑制细胞细胞增殖/迁移的功能；

2）lncRNA NBAT-1通过某未知转录抑制因子，下调NRSF/REST的表达，解除NRSF/REST对神经分化相关基因的抑制，从而促进神经分化；

3）lncRNA NBAT-1的表达水平与成神经细胞瘤的风险预后负相关，且其高表达与增强子区域SNP位点多态性和CpG位点的甲基化相关。

这篇文章前面两个figure是作者从不同亚型的成神经胶质瘤样本出发，通过测序确定潜在的lncRNA以区分高、低风险的成神经胶质瘤的过程，通过这部分实验，作者发现了本文的主角lncRNA NBAT-1，并对lncRNA NBAT-1进行了蛋白编码能力等诸多lncRNA特性的鉴定，对鉴定一条新的lncRNA需要做哪些工作感兴趣的可以看我们前面的文章（回复37，查看（文章篇）S3E7：一文掌握lncRNA研究的套路和创新点），这部分结果我们就不讲了。

下面我们看文章的主体：

1. lncRNA NBAT-1与成神经胶质瘤样本的临床相关性。

一般来说，研究分子与疾病（比如肿瘤）的相关性，通常要做以下三部分实验：

a. 表达：即分子的表达差异，比如lncRNA NBAT-1在高风险成神经细胞瘤中低表达；

b.与病理参数的相关性，比如lncRNA NBAT-1与成神经细胞瘤分期的相关性；

c. 预后，通过KM生存分析，研究lncRNA NBAT-1与成神经细胞瘤病人预后的关系。

2. 关于lncRNA NBAT-1在高风险肿瘤样本中的低表达，作者从SNP位点多态性和甲基化修饰两个角度分析。

SNP：rs6939340位点位于lncRNA NBAT-1增强子区域，基因型G/G对应的lncRNA NBAT-1转录活性显著低于A/A等基因型。

甲基化：通过焦磷酸测序发现低风险样本中 NBAT-1的CpG位点甲基化程度显著低于高风险样本，这也可以对应：低甲基化——高表达——抑癌基因——低风险。

3. lncRNA NBAT-1抑制细胞增殖和迁移的功能和机制研究。

首先是细胞水平和动物水平的功能，以及对NBAT-1下游分子机制的初步检测。

然后通过RIP实验发现NBAT-1与PRC2复合物的关键组分EZH2直接结合，并影响了增殖和迁移相关基因的表达。

这里又出现了PRC2复合物，这个复合物是一个明星分子，由EZH2、EED和SUZ12亚基组成，在上篇"（文章篇）S3E16：一篇亮点满满的甲基化文章"(回复316查看)中，lncRNA PARTICLE也是通过结合PRC复合物亚基SUZ12结合调控靶基因甲基化水平的。

4.  lncRNA NBAT-1促进神经分化的功能和机制研究。

这一部分里面，作者确定了lncRNA NBAT-1对神经分化的影响，并发现lncRNA NBAT-1通过抑制NRSF/REST表达调控起作用，但是NBAT-1如何抑制NRSF/REST则没有说明，而且，NBAT-1抑制NRSF/REST并不是通过NBAT-1与EZH2（PRC2复合物）的结合完成的。

好了，这篇文章就到这里了。

这篇文章以lncRNA NBAT-1为关键分子，从诊断意义上讲，NBAT-1异常表达与成神经胶质瘤的风险、预后相关；从功能和机制上讲，NBAT-1上游受SNP多态性和甲基化修饰的双重影响；下游又通过不同的途径发挥功能，一方面 NBAT-1与PRC2复合物组分EZH2直接结合，影响增殖和转移关键基因的表达，另一方面 NBAT-1又通过抑制NRSF/REST表达上调下游基因的表达，调控神经分化。实验内容涵盖了分子、细胞、动物和临床四个水平，既有biomarker的结果，又有功能干预的实验，内容非常丰富，大家可以下载全文看。

全文下载链接: http://pan.baidu.com/s/1eSNjST8 密码: 1kaf

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