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(工具篇)S4E05:手把手教你用R做韦恩图(Venn图)

2016-05-10 依凡 小张聊科研

大家好,我是依凡,今天我们介绍怎么用R画韦恩图(Venn图)。


Venn图,也叫韦恩图,文氏图,用于显示元素集合重叠区域的图示,是paper中最常用的展示方法之一,开始。

首先,安装好R以及作venn图所需的软件包VennDiagram;其次准备好目标文件(保存为Tab分隔的纯文本文件,如ABC.txt) :


现在有ABC三个组,目的是通过下图展示A、B和C三组中共同的miRNA:


方法如下:

1. 加载VennDiagram包并读入数据:

2. 计算各overlapper子集并写入overlapper.xls文件中


3.生成Triple_Venn.tiff图片


好了,完工!



小张看完后的感觉是:

甲:怎么把大象装进冰箱?

乙:一共分三步:

1. 把冰箱门打开  

2. 把大象放进去

3. 关上冰箱门。

甲:……,说了等于白说!



好,对于只想用一下的小伙伴来说,只需替换相应数字就行了,对于想学R的小伙伴来说,可以看每句代码的意思。


本文用的数据、材料和代码,下载链接:http://pan.baidu.com/s/1slvd8lv 密码: efr6,如果大家有疑问,欢迎留言交流!



That’s all. Thank you!



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