如何查询和展示一个基因在组织和细胞株里面的表达？

大家在研究某个分子的时候，常常需要了解下某个基因在各个组织和细胞中的表达，今天我们就介绍两个工具：

（1）The human protein atlas

网址：http://www.proteinatlas.org/

这个数据库我们前面介绍过（（工具篇）S5E50：航母级神器——蛋白组学结果大收录！），功能非常强大，我们举例查询一下基因Sox2在组织和肿瘤中的表达情况：

首先输入sox2,

接下来选择第一个,

打开后我们看到可以查询组织、细胞和肿瘤中的表达情况：

组织：

分别是蛋白表达和mRNA表达。单击细胞后，各个细胞系里面的表达：

以及在细胞内部的定位：

最后是肿瘤里面的免疫组化结果：

（2）CCLE：Cancer Cell Line Encyclopedia

网址：https://portals.broadinstitute.org/ccle/home

下面我们看一下怎么操作，在右上角的search框输入基因名：sox2

提交后在弹出的界面里选择sox2单击：

下面是打开的界面：

这里展示的就是sox2在各个组织类型的细胞里面的总体表达情况，这是箱式图，下面是散点图：

我们可以下载数据，下载后可以直接用morpheus（https://software.broadinstitute.org/morpheus/）展示：

也可以用graphpad自己绘制表达情况：

用origin8自己绘制：

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