这个研究方向的国自然资助项目数,居然比去年翻了6倍
2012年,Dixon等人在研究小分子化合物Erastin处理RAS突变的肿瘤细胞,发现了一个现象,并报道了一类新型的由铁依赖性的氧化损伤引起的细胞死亡模式,并命名为Ferroptosis(铁死亡)。
细胞铁死亡与多种疾病的发生发展密切相关,如亨庭顿氏疾病、阿尔兹海默、帕金森等退行性疾病有关,与肿瘤的发生、脑卒中、颅内出血、脑外伤、缺血再灌注损伤、肾病变性以及植物热应激等同样有关。另外铁死亡也具有肿瘤抑制功能,这一点可以运用到肿瘤治疗方面。
铁死亡受细胞内信号通路的严密调节,这些信号通路包括铁稳态的调节通路、RAS通路以胱氨酸转运通路。
铁死亡这一细胞死亡过程与凋亡、坏死和自噬在形态学特征及生理生化方面均有差异。
铁死亡典型的特征表现为细胞质以及脂质活性氧自由基增多。线粒体变小,而线粒体的双层膜密度增加。
凋亡典型的特征包括细胞皱缩、核浓缩、染色质边集、DNA片段化、膜起泡、核和胞浆断裂成凋亡小体,后被邻近的细胞吞噬和降解。
坏死的形态学特征是细胞和细胞器肿胀、膜破裂、核染色体溶解而不是固缩,线粒体受损,随后细胞溶解。
自噬典型的特征为细胞内出现大量泡状结构,即双层膜结构的自吞噬泡,吞噬泡内为胞质及细胞器.高尔基器、核糖体、内质网等均先于核的改变而被降解,但细胞骨架成分却大部分保存。
细胞铁死亡从开始报道至今也才五年时间,算是非常新星的领域,但是相比于之前梦熊介绍细胞焦亡、坏死性凋亡,铁死亡的国自然基金在今年实现了一个飞跃,从2016年的3项迅速增加到18项。
基金案列 |
MicroRNA-30e通过铁死亡途径调控乳腺癌放射敏感性的作用及其分子机制研究 |
新长链非编码RNA LncRNA-RP4HA通过CAPRIN2/HMGCS1调控鼻咽癌转移与铁死亡 |
PAK4特异性介导的铁死亡在非小细胞肺癌对Gefitinib耐药过程的作用及机制研究 |
双氢青蒿素通过上调铁结合蛋白自噬性降解诱导膀胱癌细胞铁死亡(ferroptosis)机制的研究 |
HMGB1调控急性髓系白血病细胞铁死亡的分子机制 |
GPX4去乙酰化诱导铁死亡增加肿瘤细胞辐射损伤的机制研究 |
这里我们可以看到,无论是我们熟悉miRNA、lncRNA、蛋白,还是中药、蛋白修饰在调控细胞铁死亡中均能涉及到。
我们来看一篇文章。
Activation of the p62-Keap1-NRF2 pathway protects against ferroptosis in hepatocellular carcinoma cells.Hepatology
文章讲的是在肝癌中,NRF2能够抑制Erastin和Sorafenib诱导的肝癌细胞的铁死亡,从而降低药物对肝癌的治疗效果。
之所以选中NRF2,是因为NRF2在氧化应激反应中有着重要作用(文献报道),同时还是一个转录因子(做机制就很方便了)。
先看NRF2的下游机制。考虑到铁死亡是一个与铁离子以及活性氧密切相关的细胞死亡过程,作者敲减NRF2后,观察下游铁代谢和亚铁血红素相关的基因表达量变化,筛选出NQO1、HO1和FTH1。这三者均是抗氧化剂,敲减这些基因会促进使铁死亡。NRF2与下游三个基因的具体机制是怎样的呢?毕竟转录因子,转录调控咯!NRF2通过与MafG(也是转录因子)的相互作用(文献报道),激活下游NQO1、HO1和FTH1的转录。
再看上游机制。在之前的研究中有报道:p62能够通过失活Keap1来激活NRF2。作者这里直接套用了这一机制,实验条件换成了Erastin和Sorafenib处理。
以上大抵上就是一个国自然面上项目的思路了:
1、确定一个机制——铁死亡;
2、选择一个核心基因——NRF2(转录因子);
3、设计上下游机制——文献报道结合转录调控等机制套路;
4、预实验——填补机制图中的空缺,一般可以通过表达相关性的验证来筛选目的基因,后续再通过实验验证它们与核心基因的作用机制。
Ref:
1 铁死亡:一种新的细胞死亡方式.Progress in Biochemistry and Biophysics
2 Ferroptosis: An Iron-Dependent Form of Non-Apoptotic Cell Death.CELL
3 THE PANTHEON OF THE FALLEN:WHY ARE THERE SO MANY FORMS OF CELL DEATH?Trends Cell Biol.
4 Ferroptosis: A Regulated Cell Death Nexus Linking Metabolism, Redox Biology, and Disease.CELL
5 Activation of the p62-Keap1-NRF2 pathway protects against ferroptosis in hepatocellular carcinoma cells.Hepatology
6 Role of nrf2 in oxidative stress and toxicity.Annu Rev Pharmacol Toxicol.
7 An Nrf2/small Maf heterodimer mediates the induction of phase II detoxifying enzyme genes through antioxidant response elements.BBRC
8 The selective autophagy substrate p62 activates the stress responsive transcription factor Nrf2 through inactivation of Keap1.Nat Cell Biol
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