掌握了这个万金油套路，课题思路就不用愁了！

今天给大家分享一个万金油套路，既然用“万金油”来形容，该套路的适用范围就会非常广，夸张点说，有1/4-1/3的文章和基金都是这个套路，所以对于基础科研入门后需要升级的同学来说非常合适。

下面我们先来看这个套路涉及到的研究方向：

1. 非编码RNA：circRNA/lncRNA和miRNA，其中circRNA/lncRNA与miRNA以及mRNA的调控关系时，我们选取大家最为熟悉的ceRNA调控关系：circRNA/lncRNA通过吸附miRNA调控mRNA表达（mRNA则又可以翻译成蛋白）。

2. 转录因子：我们在大家说的转录调控到底是什么（2）？一文中做过介绍，简单来说：转录因子这类蛋白可调控circRNA, lncRNA, miRNA和mRNA的转录表达。

这里的Gene X既可以是mRNA，也可以是circRNA, lncRNA, miRNA

3. 调控转录因子的蛋白，比如激酶和泛素酶：很多激酶Kinase可介导转录因子的磷酸化，从而调控转录因子的活化和定位等；很多泛素酶则通过介导转录因子的泛素化进而通过蛋白酶体降解途径降解转录因子，从而调控转录因子表达。

激酶介导的蛋白磷酸化

泛素化（ubiquitin）-蛋白酶体降解途径

好了，万金油的套路涉及到的分子类型就介绍完了。

我们介绍把以上3种关键分子组合起来的各种模式：

（1）以miRNA为中心的模式：下游：miRNA调控靶基因和信号通路，上游：转录因子和lncRNA/circRNA。因此形成：

1.1 模式一：miRNA——靶基因——信号通路；

1.2 模式二：lncRNA/circRNA——miRNA——靶基因/通路；

1.3 模式三：转录因子——miRNA——靶基因/通路；

1.4 模式四：转录因子——lncRNA/circRNA——miRNA——靶基因/通路；

1.5 模式五（反馈回路） ：miRNA——转录因子——lncRNA——miRNA

1.6 模式六（反馈回路）：

转录因子——miRNA——转录因子   或者

转录因子——lncRNA/circRNA——miRNA——转录因子。

（2）以转录因子为中心的模式：作为蛋白能被磷酸化活化，也能被泛素化降解，因此可形成：

2.1 模式七 ：激酶——转录因子——靶基因，

2.2 模式八：泛素酶——转录因子——靶基因

2.3 模式九及其它：这里的靶基因也可以是ncRNA，比如miRNA和lncRNA，因此也可以形成激酶/泛素酶——转录因子——miRNA/ lncRNA的模式，

miRNA和lncRNA又可以调控转录因子/泛素酶/激酶从而形成反馈回路。

其实只要灵活变通，模式有太多太多……

下面我们看文章和基金的案例：

• miRomics and proteomics reveal a miR-296-3p/PRKCA/FAK/Ras/c-Myc feedback loop modulated by HDGF/DDX5/β-catenin complex in lung adenocarcinoma. Clin Cancer Res.（miRNA——激酶——转录因子反馈回路，模式2.3）

• ERK2-ZEB1-miR-101-1 axis contributes to epithelial-mesenchymal transition and cell migration in cancer. Cancer letters.（激酶——转录因子——miRNA，模式2.3）

• KRAS/NF-kappaB/YY1/miR-489 Signaling Axis Controls Pancreatic Cancer Metastasis. Cancer research.（通路——转录因子——miRNA，模式2.3或者1.3）

• A Novel Regulatory Mechanism of Smooth Muscle alpha-Actin Expression by NRG-1/circACTA2/miR-548f-5p Axis.（因子——circRNA——miRNA，模式1.6）

• LncRNA-RP11-296A18.3/miR-138/HIF1A Pathway Regulates the Proliferation ECM Synthesis of Human Nucleus Pulposus Cells (HNPCs).Journal of cellular biochemistry.（lncRNA——miRNA——靶基因/通路，模式1.1）

• FBW7 suppression leads to SOX9 stabilization and increased malignancy in medulloblastoma. EMBO J. (泛素酶——转录因子——靶基因，模式2.2)

• Destabilization of Atoh1 by E3 Ubiquitin Ligase Huwe1 and Casein Kinase 1 Is Essential for Normal Sensory Hair Cell Development. The Journal of biological chemistry （泛素酶/激酶——转录因子——靶基因，模式2.2）

基金也放一些：

• 转录因子GATA1调控lncRNA参与红系分化的作用及机制研究

• 转录因子NFI-C通过miR-200家族调控细胞自噬在神经管畸形发生中的作用与机制

• miR-205调控转录因子RunX2表达在乳腺癌干细胞侵袭转移中的作用及其机制研究

• 转录因子HIC1通过lncRNA-numb调控葡萄膜黑色素瘤的发生发展

• lncRNANONMMUT010710/miR-27-3p/PPARγ信号通路参与术后认知功能障碍的机制研究

• LncRNATCONS_00134892/miRNA-21/Trim33调控轴介导的激活的酶原颗粒泛素化在胰腺腺泡细胞选择性自噬中的作用研究

• LncRNA MEG3作为ceRNA参与miR-155调控FOXO3a磷酸化修饰影响滋养细胞自噬的机制研究

• 泛素E3连接酶HACE1调控核转录因子NRF2促进神经胶质瘤发生发展的机制研究

• 转录因子c-Maf去泛素化酶USP5的鉴定及其在多发性骨髓瘤中的功能研究

• 锂盐通过β-arrestin2/Akt通路调控FoxO1转录因子磷酸化

• 转录因子Pit-1磷酸化及其调控机制在垂体瘤发生发展中的作用研究

• miR-520h调控去泛素化酶OTUD3水平促进乳腺癌发生发展的机制研究

• 泛素连接酶CHIP通过miR-92b/PTEN调控胶质瘤恶性增殖的机制研究
  

用一张图来展示就是：

好了，模型我们已经讲的很清楚了。其实呢，这一部分的内容是我们去年的收费课程《基金申请与课题设计：从入门到精通》里面的一节课而已，如果大家感兴趣想了解更多内容，可单击文末链接购买。

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