研究肠道菌群的代谢、营养和疾病的神器

我们都知道代谢在人类健康和疾病中起着至关重要的作用，并且它受内在（如遗传）和外在（如饮食和肠道微生物群）因素的调节。当单独考虑时，这些因素不能充分解释许多复杂的疾病的发展和进展。因此，科学家们有必要采用系统的方法来阐明这些因素中的每一个因素的贡献，并开发有效的新型治疗策略。

下面就来为大家介绍一个很炫酷的数据库------ The Virtual Metabolic Human database: integrating human and gu tmicrobiome metabolism with nutrition and disease

网址：https://www.vmh.life/

这个数据库包含了人类新陈代谢的当前知识，在使用上，我们可以通过快速搜索栏搜索所有资源，或通过“浏览”按钮或主页面中可用的资源面板搜索特定资源。在可用资源面板中我们可以选择“人体新陈代谢”，“肠道微生物组”，“疾病”，“营养” ，“ReconMaps”和“LeighMap”进行浏览。

我们以搜索“水h2o”，为例来看一下数据库的使用

这里面显示了“h2o”参与的反应，我们单击代谢产物中的“h2o”后得到详细信息，包括缩写，名称，化学式啊等等，还包括与其他资源的连接

我们点击相关的人类反应，数据库可以导航到反应细节页面

并从这里导航到其他相关实体，比如我们点击相关的人类基因

我们还可以通过点击“ReconMaps”资源显示代谢途径

我们点击ReconMap3后，在侧栏搜索“h2o”，右侧面板显示了“水”这种代谢物参与的所有的反应，其中的数字标签指的都是“h2o”

我们可以将右侧面板中的图进行放大来查看某一个感兴趣的反应，比如我用红线圈出的标签处的途径为

这个数据库最亲民的地方到了，我们通过点击主页面中营养资源，它就能设计出计算机模拟的饮食，在这里我们通过可用食物面板来搜索食物，并将它以克为单位的份量大小添加到“选定食物”面板中

在此过程中，“精选食品”面板的顶部将自动更新有关饮食的信息

最后就是下载了，我们单击底部的“Generate fluxes”来下载每种成份的通量值用于我们自己的实验或者研究中。

在下载方面，我们还可以根据主页面中的Downlowd来下载，它包含三个选项，分别是：人类代谢的构建，微生物的收集，微生物个体的构建

例如，我们选择微生物收集里面的实验数据

下载后的结果

知道大家最关心的是疾病中的代谢，再为大家简单介绍下通过疾病来搜索，我们通过点击主页中的“Diseases”，得到

例如，我们想查看“巴特综合症”，点击“BS1”得到它的详细信息，包括疾病的名称，缩写，类别，症状啊等等。我们可以通过PMID号链接到PUBMED中的文献，还能链接到OMIM数据库。

另外几种搜索选项与这个流程是一致的，这里就不一一阐述了，好啦，这个数据库就介绍到这里了！希望对大家有帮助哦！

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