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诺奖热点:这个基因的研究同一天发表在Nature主刊和子刊,到底说了什么?

风行者 小张聊科研 2021-02-21

双链RNA腺苷脱氨酶(ADAR)的主要功能是对RNA进行修饰,它能够和双链RNA结合,诱导RNA序列中的腺苷酸(A)脱氨基转变为肌苷(I),导致A:U无法配对,从而双链RNA不稳定,引发机体多种疾病。目前关于ADAR蛋白的研究相对较少,只有500多篇文章,但是一半的文章都发表在5分以上的杂志,这也暗示ADAR基因具有非常重要的作用。


虽然目前关于它的研究较少,但是近些年来文章的发表呈现递增的趋势。


这不,昨天nature杂志和其子刊nature medicine同时刊登了ADAR调控抗肿瘤免疫的文章,一起看看吧。

     

第一篇文章发表在2018年12月17日的nature杂志上,影响因子为41.577,文章题目是Loss of ADAR1 in tumours overcomes resistance to immune checkpoint blockade.

 


研究背景:尽管近些年来PD-1和PDL-1等免疫检查点抑制疗法展现出高效的疗效,但是大部分病人对该疗法不敏感,还会出现治疗抵抗的情况,但是其中的机制还不清楚。


研究思路及结果:为了找到一些病人对免疫疗法不敏感的机制,作者通过cas9文库方法进行筛选,发现当敲除肿瘤细胞中的ADAR1后,小鼠对PD-1抗体治疗的敏感性显著增加。

 


随后,作者对机制进行探究,既然ADAR1的主要功能是影响双链RNA的稳定性,因此,作者猜想它是否通过影响IFN信号通路来调控抗肿瘤免疫。通过检测肿瘤微环境中的INF含量,作者发现当ADAR1缺陷后,IFN-β和IFN-γ的含量明显增加,并且作者发现当同时敲除ADAR1和IFN受体Ifnar2以及Ifngr1或者同时敲除ADAR1和INF下游信号stat1时,ADAR1缺陷引起的抗肿瘤免疫增强的现象消失,这表明ADAR1缺陷活化抗肿瘤免疫效果依赖于IFN信号。

   

接下来作者探究ADAR1究竟如何活化IFN信号,通过cas9基因组文库筛选以及基因富集的方法,作者发现影响ADAR1缺陷诱导IFN增强的基因都集中抗病毒信号通路上,主要包括Eif2ak2 (PKR), Mavs (MAVS), Ifih1 (MDA5)和Ddx58 (RIG-I),随后作者在体外进行验证,与单独敲除ADAR1相比,同时敲低ADAR1和PKR、MAVS以及MDA5时,IFN-β的分泌明显减少,但是敲低RIG-1时,IFN-β的分泌无明显变化,这表明ADAR1缺陷诱导IFN产生依赖于PKR、MAVS和MDA5。为了验证在体内是否具有相同的现象,作者将ADAR1与PKR、MAVS和MDA5同时敲除,发现小鼠对PD-1抗肿瘤免疫效果出现抵抗,这表明在体内ADAR1缺陷诱导抗肿瘤免疫效果增强也依赖于PKR、MAVS和MDA5。

 

研究意义:作者揭示了一种新的抗肿瘤免疫抵抗机制,为克服肿瘤治疗抵抗提供新的靶点和策略,同时给予ADAR1的抗体和PD-1抗体将高效治疗那些对抗肿瘤免疫不敏感的病人。


第二篇文章发表在2018年12月17日的nature medicine杂志上,影响因子为32.621,文章题目是Tumor-derived IFN triggers chronic pathway agonism and sensitivity to ADAR loss。

 


研究背景:越来越多的研究表明,IFN信号通路不仅在天然抗病毒中具有重要作用,而且在肿瘤的发生发生以及抗肿瘤免疫过程中也起到重要作用。但是在肿瘤中,何种蛋白调控IFN信号通路活化目前还不清楚。


研究思路及结果:首先,作者探究IFN信号通路在各种肿瘤中的活化状态,通过对干扰素诱导基因(ISG)的表达组学进行分析,作者发现IFN-α和IFN-γ诱导的基因有38个共同基因。

 

通过TCGA数据库对这38个共同的ISG基因在各个肿瘤中的表达进行分析,作者发现在多数实体瘤中IFN信号通路均存在活化。

 

随后,作者探究肿瘤中IFN信号通路活化的原因,通过对IFN信号通路上游基因进行筛查,作者发现sting在其中扮演重要作用,通过cas9敲除sting后,ISG基因的表达显著下降,这表明肿瘤中IFN信号通路活化由sting介导。

 

接下来作者探究何种蛋白调控sting介导的IFN信号通路活化,通过cas9基因组文库筛选的方法,作者发现ADAR与ISG基因的表达呈现显著的负相关关系,这表明ADAR负调IFN信号通路。


随后,作者在动物实验中进行验证,发现当敲除肿瘤细胞中的ADAR后,肿瘤对阿霉素的敏感性显著增加,但是在敲除ADAR的同时也敲除IFNAR1、STING、MAVS和PKR后,阿霉素的化疗效果明显降低,这说明ADAR缺陷增强阿霉素的抗肿瘤效果依赖于IFN信号通路。



研究意义:作者揭示了在肿瘤细胞中IFN信号通路活化的机制,为抗肿瘤免疫治疗提供新的药物靶点。


总结这两篇文章,作者集中在ADAR对IFN信号通路以及其在肿瘤免疫治疗中的重要作用,虽然内容相似,但是nature文章从动物模型入手,先揭示ADAR影响抗肿瘤免疫效果,随后机制上影响IFN信号通路;而nature medicine文章则是从机制入手,探究ADAR1在IFN信号通路的作用,随后在动物模型中进行验证。这是两种不同的思路,值得我们借鉴。



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