简讯：太牛了！测了2000多肿瘤样本的circRNA数据，怪不得发Cell！

在最新的Cell杂志上发表了两篇circRNA的文章，今天就做简单介绍。

第一篇是关于肿瘤里面的circRNA全景图：The Landscape of Circular RNA in Cancer.Cell. 2019 Feb 7;176(4):869-881.e13.

这项研究通过外显子捕获RNA测序（exome capture RNA sequencing）的方法测了2000多肿瘤样本和细胞系，共涉及到肺癌、乳腺癌、肝癌、胰腺癌等10几种肿瘤：

并建立了一个迄今为止最全的多肿瘤circRNA数据库：MiOncoCirc

数据库的网址为：https://nguyenjoshvo.github.io/，我们可以下载分析和挖掘：

以及检索表达丰度：

通过MiOncoCirc，研究团队筛选到前列腺癌的潜在circRNA标志物：

由于circRNA的稳定性，可在尿液中检测到：

另外，研究团队还发现了一类circRNA：rt-circRNA（read-through circRNAs）

看到这里，嗅觉敏感的同学可能立马想到这是一个大宝藏了吧！

另外一篇发表在同期cell杂志上的文章：Widespread and Functional RNA Circularization in Localized Prostate Cancer.Cell. 2019 Feb 7;176(4):831-843.e22. doi: 10.1016/j.cell.2019.01.025.

在这项研究中，对144例局限性前列腺癌（Localized Prostate Cancer）中circRNA的表达、功能、对细胞增殖的必要性（essentiality）进行了研究：

从融合基因（Fusion Genes）与局限性前列癌进展：

从circRNA的表达丰度用于肿瘤分型等角度进行研究：

另外，研究团队还挑选2000条表达丰度最高的circRNA通过shRNA进行干扰，并研究其对前列腺癌细胞增殖的影响：

并选取circCSNK1G3对其功能和吸附miR-181b/d 的机制进行探索：

好了，两篇文章就简单介绍到这里。

长按二维码识别关注“小张聊科研”

关注后获取《科研修炼手册》1、2、3、4、5、6、7，8。