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新版PubMed答疑来了!

The following article is from 科研讲坛 Author 明明知道了

在上期发出新版PubMed的推文不久(新版Pubmed,新花怒放,快来看看有哪些变化!收到了很多同学和网友关于新版PubMed的问题和反馈,今天笔者在此就提出的问题给出一些解决方案。笔者的回答可能存在一些经验局限,若大伙有更好的建议,请一定要分享哈。

1、新版PubMed是否已替代旧版PubMed
没有。

依据NLM团队的官方计划,2020年初,才将新版PubMed设为默认搜索界面,另外,旧版PubMed也将于2020年后半段下线。

对于大伙反应的问题:点击PubMed链接进去,显示出来的就是新版PubMed

笔者试了下,当你退出PubMed的时候,是显示的新版PubMed界面,那么,你下一次进PubMed就自动显示出新版PubMed的界面。而退出时候是旧版PubMed,下次再进来就是旧版PubMed

即是说,你退出PubMed时候是新/旧界面,那你再进去的时候,显示的就是新/旧界面。可能是PubMed会记录你使用哪个版本PubMed的偏好,从而更好地为我们服务。

此外,目前的新版PubMed还不是完全体,像My NCBI的资料和过滤条件之类的,还没完全同步过来,还得等一段时间哈。

但可以放心的是,当新版PubMed正式成为默认界面时,其功能和资料就可同步过来了。因此,这方面,大伙还是稍耐心一下哈。同时,由于新版PubMed还未正式替代旧版PubMed,在目前的试运营期间,大伙的建议也可以影响新版PubMed的最终敲定。

2、Scholarscope插件还适用于新版PubMed吗?
适用。

在笔者的Chrome浏览器上,Scholarscope插件已适用于新版PubMed,且在显示上,增加了年份和文章类型。相信不少同学也看到了。

看到不少同学比较看重Scholarscope插件在新版PubMed的适配性,把期刊的IF、分区这些信息都显示出来。但笔者认为,在PubMed上的IF过滤条件才是更重要的
Sci-Hub脚本同样适用)

Scholarscope把期刊相关信息展示出来,即展示;IF过滤条件可以把某个水平或以上的期刊文献给筛选出来,而这才是我们的最大需求——选出高质量文献。故IF过滤条件在前,Scholarscope在后。

而这也是笔者最为担忧的一点,万一IF过滤条件在新版PubMed不可用,这就是大问题了。(相信不会有那么一天)

另外,在火狐浏览器上,目前(写稿时)Scholarscope插件还不适用于新版PubMed,但后面应该会更新。为此,笔者特意去Scholarscope的官网看了下,暂无相关的信息更新。笔者在官网发现了一个比较惊讶的事情,2017Scholarscope开发者自垫130元来维持Scholarscope的正常运营,到了18年的时候才勉强有了一些盈余。
Scholarscope插件已经成为了我们平常PubMed的不可或少的免费搭配,有一些零花钱的同学,笔者还是建议多多支持下开发者,1元,2元都是一份力量

3、如何在新版PubMed里将文献信息导入到EndNote
有的。

尽管跟旧版PubMed的界面有所不同,但针对文献引用与管理的巨大需求,新版PubMed也是不会忘了这点的。在特定文献界面,点击“cite”,出现引用该文献的选择设置,其中,中间选项“Download .RIS”就是为将该文献信息导入文献管理软件(如EndNote)服务的。

只是跟原有的不一样的地方在于,将文献信息导入文件的默认格式改为.RIS(说是目前在大多数文献管理软件最为兼容的格式),而不是旧版PubMed PubMed独有的NBIB Formatted File文件格式这可能是出于使用不同文献管理软件的大伙却可以顺畅进行文献管理的目的。

点击“Download .RIS”后,即出现了文献信息的导入文件的下载界面,保存位置和文件名你们随意,建议英文,最好记得保存路径(用于后续的EndNote导入)。然后,保存就好。

把文献信息的导入文件下载好,导入EndNote的方式有两种:
一是,直接双击打开,即导入。(建议文献管理软件只有EndNote时,EndNote图书馆时目的图书馆时才用)。

二是,EndNote里面导入记得import option与导入文件类型相一致。看下图。
PubMed文献的EndNote导入操作简单,相信对大伙来说,也是容易。

4、能不能以搜图片的方式搜索文献,如输入某个关键词,点击搜索出的图片追溯原文?

这个问题上,大伙提到了PMC Image。在这里,笔者得说下,PMCPubMedNCBI两个不同且独立的数据库(尽管PMC的文章会匹配到PubMed)。所以呢,这次新版PubMed的更新与PMC数据库不存在直接的因果关系哈。

那在PMC中搜索关键词,然后点击搜索结果中的图片,再跳到原文献的反向搜索方法存在吗?是存在的,看下图。

先在PMC搜索输入关键词,搜索,然后点击右侧的PMC Imagine Search,即可实现。

另外,关于这种以图搜文的方式,笔者推荐另一个网站:Open-i(也是隶属于NIH的)
网址:https://openi.nlm.nih.gov/
具体用法笔者就不详细展开了,大伙可以网上搜索下。

5、有没有ChromeScholarscope的呀,装在火狐不习惯?
有,但存在网络土啬(连起来)。而这个话题存在限制,所以,你们也懂的。
同时,无论新版PubMed如何变化,插件的安装流程是依浏览器负责公司而定,如Chrome浏览器,就是由Google制定。所以,之前已发布的相应的插件安装流程,也是可以使用的

不过,大伙担心的应该是:一是安哪些插件,二是在新版PubMed是否可行

Scholar scope显示期刊IF和分区,Scite显示引用次数(目前的引用数据还没完全,建议结合PubMedCited by来使用),Sci-Hub脚本用于文献下载(基于Tampermonkey插件,安装流程可看之前的推送),均已适配新版PubMed

那么,最后还得考虑一个问题:知道以上两个问题的答案,如何把它实现?

在尚未取得相应工具之前,建议大伙还是优选Firefox浏览器(即火狐),操作简单,稳定。若是懂得一些土啬方面的技术,则建议考虑下Chrome浏览器,毕竟可以上Chromeweb store随着Chrome的越发加大对插件安装源的管理,是否顺利安装插件会是个大问题,哪怕强行安装,后面Chrome浏览器是否会让它继续稳定运行,也会是个问题。

但看到大伙的需求这么强烈,笔者会去寻找一种适合所有人且操作不太难的方法,如有进展,也会跟大伙分享

6、小结
综上所述,关于Schoalrscope是否适配新版PubMed这点,大伙是完全可以放心的。笔者相信,在新版PubMed最终敲定的时候,相应配套旧版PubMed的插件也跟上新版PubMed的步伐,插件安装攻略也一样

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