[10月31-11月1日 在线直播]手把手全流程5分+多组学生信数据挖掘速成
生信分析是直接从现有的公共数据库挖掘高通量数据进行综合分析,不用做实验就可以轻松发表文章。大家都说近年来生信文章越来越难发表了,实则不然!编辑、审稿人甚至读者已经厌倦了简单套路的生信分析,如果你能做出一个多组学、思路新颖的生信文章,5分+绝不是梦!
小张聊科研最新推出《多组学数据挖掘实战训练班》课程,紧跟生信发文的最新需求,让学员掌握生信文章所需要的技能。
简单来说,就是--
文章需要什么,我们教您什么!
课程特色
本课程从R语言基础讲起,为大家初步构建R语言基础,之后通过本课程提供的海量代码。
学员可轻松完成:
1、多组学数据(转录组+基因组+蛋白组+代谢组+免疫组)的下载及处理
2、预后预测模型的构建、评价与验证(训练集+验证集)
3、肿瘤微环境(TME)及免疫浸润分析
4、免疫治疗反应性预测
5、体细胞突变分析
6、拷贝数变异分析
7、基因集富集分析
8、靶向药物预测
......
在学员掌握了分析方法之余,讲师将会结合具体实例,为学员打开思路,并提供个性化数据挖掘咨询。
讲师介绍
王老师,医学博士,临床医生,主要研究方向为肿瘤的临床与基础研究,擅长数据挖掘与分析,共发表SCI论文37篇,总影响因子超过200分,其中一作18篇。目前担任Aging-US、OncologyReports 、Scientific Reports、Frontiersin Oncology等杂志审稿人。
课程图片展示
1.R语言基础绘图
2.基于转录组的风险预后模型
3.Nomogram的构建与评价
4. 免疫组学、基因组学、药物靶点预测
even more!
课程表:
Day1上午(9:00-12:00) | 数据挖掘介绍及相关背景知识 |
构建R语言基础 | |
基于R的统计分析及绘图 | |
午休 | |
Day1下午 (13:00-17:00) | 介绍常用肿瘤和非肿瘤数据库 |
多组学数据获取(转录组+基因组+蛋白组+代谢组+免疫组) | |
数据预处理(清洗、转换、缺失值、异常值等) | |
学员提问及讨论 | |
Day2上午 (9:00-12:00) | 构建预后预测模型(训练集) |
构建风险评分模型:Cox回归联合LASSO回归,生存分析,模型评价(ROC曲线,C指数) | |
构建Nomogram模型:Nomogram绘制(基础版+高级版),模型评价(校正曲线,ROC曲线,C指数) | |
验证预后预测模型(独立验证集) | |
午休 | |
Day2下午 (13:00-17:00) | 肿瘤微环境(TME)及免疫浸润分析(CIBERSROT,ESTIMATE,MCP-counter,ImmuCellAI,EPIC,TIMER,xCELL) |
预测免疫治疗的反应性 | |
体细胞突变分析(Somatic Mutation) | |
拷贝数变异分析(Copy Number Variation) | |
GO,KEGG,基因集富集分析(GSEA) | |
预测潜在的靶向药物 | |
经典文献+经典思路分析 | |
学员提问及讨论 |
注:
1、实际授课过程中,老师可能根据进度对课程进行微调。
2、请学员自带电脑,mac或者windows系统的笔记本(请勿使用XP系统,推荐win10),老师用win10系统进行讲解。
3、本次课程以R语言为工具,贯穿整个课程。
时间:2020年10月31-11月1日(周六、周日)
平台:腾讯会议
注册费(可开发票):
10月23日前 | 10月24日至30日 |
3400 | 3600 |
二人组团报名,每人可优惠100元
三人组团报名,每人可优惠200元
四人及以上组团报名,每人可优惠300元
办会员可以享八折优惠!详情咨询猫头鹰班长!
注:
1、本课程赠送加密的随堂录屏视频,供学员课后复习,不用担心跟不上,也无需顾虑学了就忘!
报名请联系猫头鹰班长(微信号:xzlky2015-training),加微信时请注明“姓名+数据挖掘”