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[10月31-11月1日 在线直播]手把手全流程5分+多组学生信数据挖掘速成

猫头鹰教室 小张聊科研 2021-02-21

生信分析是直接从现有的公共数据库挖掘高通量数据进行综合分析,不用做实验就可以轻松发表文章。大家都说近年来生信文章越来越难发表了,实则不然!编辑、审稿人甚至读者已经厌倦了简单套路的生信分析,如果你能做出一个多组学、思路新颖的生信文章,5分+绝不是梦!


小张聊科研最新推出《多组学数据挖掘实战训练班》课程,紧跟生信发文的最新需求,让学员掌握生信文章所需要的技能。

简单来说,就是--

文章需要什么,我们教您什么!


课程特色

本课程从R语言基础讲起,为大家初步构建R语言基础,之后通过本课程提供的海量代码。

学员可轻松完成:

1、多组学数据(转录组+基因组+蛋白组+代谢组+免疫组)的下载及处理

2、预后预测模型的构建、评价与验证(训练集+验证集)

3、肿瘤微环境(TME)及免疫浸润分析

4、免疫治疗反应性预测

5、体细胞突变分析

6、拷贝数变异分析

7、基因集富集分析

8、靶向药物预测

......

在学员掌握了分析方法之余,讲师将会结合具体实例,为学员打开思路,并提供个性化数据挖掘咨询。


讲师介绍

王老师,医学博士,临床医生,主要研究方向为肿瘤的临床与基础研究,擅长数据挖掘与分析,共发表SCI论文37篇,总影响因子超过200分,其中一作18篇。目前担任Aging-US、OncologyReports 、Scientific Reports、Frontiersin Oncology等杂志审稿人。


课程图片展示


1.R语言基础绘图


2.基于转录组的风险预后模型


3.Nomogram的构建与评价


4. 免疫组学、基因组学、药物靶点预测


even more!



课程表:

Day1上午(9:00-12:00)

数据挖掘介绍及相关背景知识

构建R语言基础

基于R的统计分析及绘图

午休

Day1下午

(13:00-17:00)

介绍常用肿瘤和非肿瘤数据库

多组学数据获取(转录组+基因组+蛋白组+代谢组+免疫组)

数据预处理(清洗、转换、缺失值、异常值等)

学员提问及讨论



Day2上午

(9:00-12:00)

构建预后预测模型(训练集)

构建风险评分模型:Cox回归联合LASSO回归,生存分析,模型评价(ROC曲线,C指数)

构建Nomogram模型:Nomogram绘制(基础版+高级版),模型评价(校正曲线,ROC曲线,C指数)

验证预后预测模型(独立验证集)

午休

Day2下午

(13:00-17:00)

肿瘤微环境(TME)及免疫浸润分析(CIBERSROT,ESTIMATE,MCP-counter,ImmuCellAI,EPIC,TIMER,xCELL)

预测免疫治疗的反应性

体细胞突变分析(Somatic  Mutation)

拷贝数变异分析(Copy  Number Variation)

GO,KEGG,基因集富集分析(GSEA)

预测潜在的靶向药物

经典文献+经典思路分析

学员提问及讨论

注:

1、实际授课过程中,老师可能根据进度对课程进行微调

2、请学员自带电脑,mac或者windows系统的笔记本(请勿使用XP系统,推荐win10),老师用win10系统进行讲解。

3、本次课程以R语言为工具,贯穿整个课程。


时间:2020年10月31-11月1日(周六、周日)

平台:腾讯会议


注册费(可开发票):

10月23日前

10月24日至30日

3400

3600

二人组团报名,每人可优惠100元

三人组团报名,每人可优惠200元

四人及以上组团报名,每人可优惠300元


办会员可以享八折优惠!详情咨询猫头鹰班长!

注:

1、本课程赠送加密的随堂录屏视频,供学员课后复习,不用担心跟不上,也无需顾虑学了就忘!


报名请联系猫头鹰班长(微信号:xzlky2015-training),加微信时请注明“姓名+数据挖掘



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