(策略篇)三分天下:分子机制研究的三种模式
第三季在分享文献的同时,会同时分享科研的策略,以帮助大家理清科研的思路。
本文分享的是分子机制的三种模式:表达、活性和定位。
1、表达:A分子通过调控B分子的表达水平来发挥功能,这种是最常见的,比如通过激活基因转录上调RNA丰度,或者抑制蛋白降解上调蛋白表达等,即数量的变化,类似于鸣人的影分身术。
在第一季的最后一张总结图里面,多数是归属于这种模式的。
2、活性:A分子通过影响B分子的活性来发挥功能,比如蛋白的磷酸化修饰对蛋白活性的调控等,即质量的变化,类似于路飞的二档或者黑崎一护的卍解。
3、定位:A分子通过影响B分子的定位发挥功能。比如B是转录因子,需要入核调控基因转录,而A分子使得B分子不再入核等,即空间的变化,就像小说里主角进入新位面后遭遇的属性压制。
需要说明的是,分子间调控的方式各种各样,以上三种仅仅是一家之言;三种方式可以单独或者以组合的形式出现,比如A因素既调控B分子的表达水平,又影响其活性,还可能改变其定位。
比如16年三月份的这篇文章:(百度云链接:链接: http://pan.baidu.com/s/1c26r40g 密码: w2rv)
Asp N, Kvalvaag A, Sandvig K, Pust S. Regulation of ErbB2 localization and function in breast cancer cells by ERM proteins. Oncotarget. 2016 Mar 23.
ERM 蛋白ezrin和radixin在表达沉默后不仅下调了ErbB2 的表达,还使得ErbB2的细胞定位从胞膜改变为胞内囊泡。
当然,有的调控机制也很难划到以上三种里面,以后遇到的话再补充进来。
That's all. Thank you!
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