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配对设计的分类数据分析: 配对卡方、Kappa检验、配对等级资料分析

郑老师 医学论文与统计分析 2022-10-07

第14讲 实验性研究分类数据统计策略(4):

配对设计的分类数据分析


和定量数据存在着完全随机分组和配对随机分组两种设计一样,分类数据也存在着同样的情况。配对设计分类数据在一些领域起到重要的作用,比如诊断试验研究、匹配病例对照研究、等级数据前后比较等。本文对此进行简单、系统的分析。


实例分析


•例1:某实验室分别用乳胶凝集法和免疫荧光法对58名可疑系统性红斑狼疮患者血清中抗核抗体进行测定,结果见下表,问两种方法的检测阳性率有无差别?(数据见McNemar.sav)



•例2:研究人员开展配对设计研究,将两组肿瘤小鼠同胎、同体重进行匹配(共102对小鼠),分别给予中药治疗和给予生理盐水作为对照,请比较试验后肿瘤大小(大、中、小)有无统计学差异。(数据见Bowker.sav)



1



案情分析

上述两个案例均为配对等级资料的分析比较,第一个案例为配对二分类数据,又称为配对四格表资料;第二个资料为配对多分类数据,是配对行列表资料。



2



统计分析策略

对于第一个案例:

配对二分类数据的比较,存在着两个目的,第一个目的,是探讨两组率有无差异;第二个目的,则是探讨两组结果是否一致。两种目的有一定的区别,两组结果高度一致,则两组率往往没有差异;但是两组率无差异,并不意味着两组率高度一致。只管来看,是否一致或者无差异可以采用配对四格表资料的b、c格大小可以看出。


无差异而一致:两种方法阳性率一致,且两组结果大致一致


有差异而不一致:b、c存在着差异,因此阳性率不一致,同时两组结果一致性情况也比较差。


无差异但不一致:两组结果b=c,阳性率一一样,但是一致性显然较差。


不同的目的有不同的方法。对于仅探讨阳性率是否相同,可采用配对卡方检验(又称McNemar检验);如果探讨结果是否具有一致性,则采用Kappa检验。通常,在诊断、检验领域,Kappa检验更为多见。


对于第二个案例:

配对多行多列的资料,其统计方法更多,包括与配对二分类同样的是配对卡方(McNemar-Bowker,用于分析构成比是否一致)、Kappa检验(用于分析结果一致性),此外,第二个案例事实上为等级数据,若需要分析两组数据总体程度是否有差异,可以采用配对秩和检验。


总的来说,对于2*2的配对资料(2组二分类配对资料),一般有两种策略


对于2组的配对多分类资料,一般考虑类似的两种策略


对于2组的结局为等级的配对资料,一般考虑类似的三种策略


配对卡方和Kappa检验分析


分析针对第一例和第二例进行配对和Kapp检验。两个案例软件操作程序一样,因此以第一例作为例子;结果分别呈现。

1



SPSS分析入口



2



配对卡方和Kapp检验


①分别填入配对产生的两个变量

②统计:“统计”中要设置的包括选择卡方①,选择Kappa②进行一致性检验,选择麦克尼马尔McNemar③进行配对卡方检验分析。 



3



配对卡方和Kapp检验

结果



案例1:卡方检验结果麦克尼马尔McNemar检验结果P=0.013,因此说明两种诊断方法结果存在着统计学差异。


Kappa一致性检验结果,显示Kappa=0.455,P<0.001,说一致性结果成立,但一致性情况0.455属于中等程度(一般高于0.7属于一致性程度较高)。



案例2: 卡方检验结果麦克尼马尔McNemar检验结果P=0.024,因此说明治疗方法方法结果存在着统计学差异。


Kappa一致性检验结果,显示Kappa=-0.074,P=0.266,说一致性不成立。

值得注意是,案例2虽然两组结果配对卡方显示P<0.05,但只能说疗效的构成比存在着差异,不能说中药组疗效高于西药组。


配对秩和检验分析


配对秩和又称符号秩和检验或者Wilcoxon配对秩和检验,主要用于比较配对的定量或者等级数据分析。案例2的结局等级数据,研究目标主要比较两种干预措施的总体程度而非构成比,应优先考虑配对秩和检验。


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SPSS分析入口

配对秩和的SPSS入口:“分析”--“非参数检验”--“旧对话框”--“2个相关样本”






2



配对秩和检验检验

结果

同时将“中药组”和“生理盐水组”选择放入右选框,开展威尔克森(Wilcoxon)检验





3



配对卡方和Kapp检验

结果





采用配对秩和检验发现,两组治疗方法在总体程度上存在着统计学差异(P=0.010)


注意事项


1. 配对卡方阳性率相等不等于一致

McNemar检验只会利用非主对角线单元格上的信息。对于即绝大多数数据都在主对角线的大样本列联表,McNemar检验可能会失去实用价值。因此,更多的时候配对资料探讨一致性而非率的相等性


下表若从配对卡方的角度进行统计分析,则无差异:两组结果b=c,阳性率一一样,但是一致性显然较差。

很多情况下,研究者希望检验结果是否一致l配对卡方检验在应用中主要探讨不同分组在配对的情况下,其两组率是否相同。主要考察的是B格和C格数字是否相等。一致性检验应采用Kappa检验方法。


2.大样本资料配对卡方结果有时意义不大

配对卡方在大样本时,容易得到阳性结果,但一些场景下,专业上的意义价值不大。


比如以下的数据:若从配对卡方的角度进行统计分析,则存在着统计学差异:但是显然下例免疫荧光法和乳胶凝集法的统计学差异意义不大。实际上两组数据一致性情况非常之好,完全可以忽略阳性率的差异


3. 配对资料分析,不同目的对应不同的统计分析方法。

从本研究的2个案例,可以看出配对秩和检验、配对卡方、Kappa存在着一定的差异,配对卡方探讨构成比差异性,配对秩和探讨总体程度有无差异,而Kappa检验结果更为精细,它不仅要求从总体上两组数据的相似性,且强调个体对个体的结果是否一致。不同的资料统计分析时,需要分清研究目的,再选择合适的方法进行分析。


配对卡方常见于实验性研究和观察性研究的配对设计,比如匹配病例对照研究;而Kappa研究主要在于诊断试验评价中较为常见;配对秩和主要用于配对设计的定量、等级数据分析(本文在第7讲已经就配对偏态定量数据介绍过配对秩和检验:SPSS 统计分析策略(7):配对设计资料的统计分析


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-本讲结束-


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