生信技巧第3课-请你务必学好R语言
长期更新列表：
本期视频，学会R语言，方便你我他~~~
https://v.qq.com/txp/iframe/player.html?vid=r0659php87k&width=500&height=375&auto=0
为什么需要学习R语言呢？
可能是想画一个热图
或是想做GEO芯片数据分析
也可以说是各种统计分析（比如生存分析，差异分析，lasso回归）
各种搜索渠道
https://biotree.ke.qq.com/
http://study.163.com/
百度云资料
了解并安装R
安装包 install.packages(" xxxxxx ")
加载包 library( xxxxx )
查看包的帮助文档help("xxxxx") 或?xxxxx
获取当前工作区间getwd() 更改工作区间
setwd( "xxxxxx")
清除当前对象rm()
安装包你一定会遇到错误，请参考： R包终极解决方案！(http://www.biotrainee.com/thread-144-1-1.html)
R的包（package）(http://www.bio-info-trainee.com/579.html)
下载R语言的软件: https://cran.r-project.org/bin/windows/base/
下载Rstudio这个R编辑器: https://www.rstudio.com/products/rstudio/download/
安装一些必要的包，了解CRAN和bioconductor
理解R语言与Excel表格在数据处理的异同点
重中之重！！！
明白R中的变量
向量和因子：向量特简单,没什么好说的，因子太复杂了，我说不清楚，你们慢慢理解。
数据框：就像我们的表格,第一行就是每一列的名字,我们称之为字段,或者变量名。那么对应每列下面的数据就叫做记录或者观测。用data.frame( 字段1,字段2,…. )创建 )
列表：与数据框类似,区别就是每一列向量类型和长度可以不一致。用list( 字段1, 字段2,….. )创建
数组：其形式就像我们玩的模方,每一个面都是一个矩阵数据,用array(数据,各维度的最大值,各维度的名称)
了解变量的基础操作函数
str,class,names,row.names,col.names,length,unique,view,min,max,summay,table
我们处理生物信息学数据一般很少会手动创建这些对象，都是从文本里面读取，比如kegg数据库文件，差异分析结果，RNA-seq的表达量矩阵，但是读入之后，我们的重点就是知道它们变成了什么，该如何去一步步的转换它们。
变量怎么来，对它们处理什么？
数据的特性函数也必须要知道，无非就是一些英文单词而已，你经常的玩一下，就慢慢的熟练了。
数据对象的高级操作
前面我们对向量，数据框，数组，列表都了解了，也知道如何查看数据的特性，但是要进行高级转换，就需要一些时间来学习apply系列函数，aggregate，split等函数的用法。这是一个分水岭，用好了你就算是R入门了。也可以用一些包，比如reshape2，dplyr。
当然，R里面的字符串对象是另外完全不一样的操作模式，建议大家自行搜索学习。
高级分支
统计学
可视化
bioconductor与生物信息学
shiny与网页
关于我们
我的博客：生信菜鸟团 http://www.bio-info-trainee.com/
我们的论坛：生信技能树 http://www.biotrainee.com/thread-1376-1-1.html
我们的VIP社区：https://vip.biotrainee.com/d/311-
我们的知识星球: https://t.zsxq.com/VjmQZNn
我们的腾讯课堂： https://biotree.ke.qq.com/
请善用搜索功能：http://weixin.sogou.com/
发邮件向我反馈 jmzeng1314@163.com
R语言优秀推文列表
其实都很优秀，但是我懒得给你继续列表了，其实你看了我的视频，就应该学会搜索
点击下面的阅读原文，此文中的链接都是可以跳转的！