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生信技能树(爆款入门培训课)全国巡讲约你

生信技能树 生信技能树 2022-06-06


如果你想学习生物信息学却没有听说过我们生信技能树,生信菜鸟团,生信星球······

那你应该反思一下自己了

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你需要对得起你付出的学习时间和课题经费,应该选择我们团队的入门培训全国巡讲,下面是详情



生信菜鸟团 创建于2013年11月,稳定持续更新至今,累积帮助20万生信工程师分析处理数据!

生信技能树 创建于2016年8月,是中国第一家专注于生信知识体系完善、促进生信学习交流的论坛。我们通过收集国内外生信学习资源,邀请大神分享的领域专业知识,发布菜鸟的真实学习笔记,搭建生信技术人员联盟,从入门到进阶帮助每一位生信人。

2018年我们已经建立了专业的线下培训体系,但主要在广东珠海举办培训,考虑到很多外地的学员过来舟车劳顿,而且不方便腾出时间来学习,2019年我们将走向全国,在各主要城市开启新的培训规划。

课程简介

小班教学:

10~20多人的精品小班课,按需求城市预报名人数优先开班,每月1~2次讲师外出授课,提供可供练习的服务器。

时间和地点:

  1. 珠海每月第一个周六日固定线下培训。

    下一期是:2019-03-02到2019-03-04

  2. 再下一期是:2019-04-06到2019-04-08

  3. 讲师外出前往全国各大城市巡讲:

  • 暂定北京、上海、深圳、武汉、成都、重庆、西安、杭州,其他城市有需求也欢迎咨询,可以随时联系进行预报名,待报名人数满足开班要求,团队将组织该城市的现场培训,场地和具体时间将共同协商。

  • 注意:培训中心刚刚起步,各城市报名人数无法预计,因此暂未确定具体开班的城市,小班制人数不多,可以共同协商。如果急需,可前往珠海参加每月固定时间的线下培训。(可协助珠海澳门3日)

报名时间:

即日起接受全年任何时段的预报名,有兴趣和时间安排的学员可以提前报名,定好行程计划

联系方式

扫描二维码添加小助手微信。



课程内容大纲

三天课程内容主要是:R基础及进阶、linux基础和进阶、RNA-seq上游和下游分析

课程安排



第一天




R语言简介、安装、Rstuido介绍

R语言基本命令

安装R包

获取帮助

读写文件

R数据类型

ggplot2作图

案例:热图、火山图

大样本批量操作技巧

tidyverse核心

GEO数据挖掘挖掘



第二天




服务器登录技巧

下载上传数据

linux基础命令

vim实用技巧

正则表达式

sh脚本的书写和运行

循环脚本的后台提交和进程的管理

三大文本处理进阶命令:

sed、grep、awk。

fastq准备数据的下载,Aspera高速下载SRA二代测序数据

fasta、gtf等不同数据库内的下载

生物软件安装的三种方法

常见数据格式的详细讲解



第三天




测序的基本原理

RNA-seq上游的处理,涉及数据的过滤,数据的正误判断。

RNA-seq下游的处理,差异表达矩阵的数据如何过滤以显著,差异分析到注释,注释,一篇简单三分文章到手!

总结

学习准则

1.针对零基础、linux外行的学员,从了解专业术语,操作基础命令,掌握任务的提交与终止的技巧开始,走入linux沟通交流圈,为掌握linux进阶和提交组学流程的任务夯实基础。

2.学习正则表达式、学习批量做事、高效的记录笔记、高效的搜索以及遇到报错的一般步骤处理、精细到流水线的环境变量的添加和理解,让你具有高效生产力和解决能力!

3.三大进阶awk,grep,sed命令,让你统计的需求快速便捷,与R搭配,助力你飞的更快;

4.组学的操作与学习,充分练习linux命令,掌握进阶以及命令间的搭配和区别;同时,掌握隐藏的小技巧和组学准备工作等,目的是让你在充分掌握基础和解决报错输出正确结果的同时,还能达到日后自学的能力,当然也离不开你日后坚持不懈的努力与探究 ^_^。

5.RNA-seq以完整项目为案例,从fq到差异分析再到注释,通过服务器自己动手操作,快速掌握技能及数据过滤。

6.不主张不践行把课程讲的多么高大上,土话解释到你能理解,正如江西一位老师说的,"我不怕问尴尬的问题,问了之后,解决后就很开心"。

售后

1.可以选择一折购买原价1596元的4套各ngs组学视频教程,且持续不断更新答疑,满足大家的继续学习需求!

2.课程结束后,微信交流群提供一个月售后答疑[群不解散,供大家持续讨论学习使用。你学习,我们帮你复习!

3. 可以选择购买原价138的生信技能树纪念版U盘  32G  USB3.1,内附生信入门资料,学员爱心售价30元,我们将会双倍捐献给有需要的人群,并在公众号告知大家!

大家说






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学员评价与学习心得

学员评价


暨南大学钱老师(3天)

先前一直不能理解正则表达式,现在懂了很多,回去看课本理解的不会那么痛苦了!


川大华西口腔大皮童鞋(9天)

老师你讲的通俗易懂。


赣南师范大学张老师(学徒):以前完全看不懂生信资料,也尝试过自学,但真找不到入口,真是自学不下去。经过培训,入门了,资料能看懂了,Linux也不发怵了。最主要得感受是自学有信心了。


金域检验科薛检验员(学徒)

深入学习生信而共享的学习方法:原理知识块掌握要全面,产生整体认知;实战训练模块要掌握仔细,理解每一行代码的作用和意义;反复听视频和练习,多投入时间,


学习心得


湘雅医院耳鼻喉张老师(学徒)


第一:需要师傅领进门

我在生物信息学门口徘徊了快一年,看了很多很多的文献。以为自己不需要掌握这样的技术。但是,就是因为对技术的不了解,导致自己的认知程度无法提升。这十天来,真真切切的让我提升了认知能力。

第二: 三天是搞不定生物信息学一门学科,学习一个月/一周肯定更好,但仍然需要持续学习

在师傅领进门的前提下,必须还要在一个特定的学习环境下进行实战。不然自己的学习成本很高,学习曲线很长。我想很多人就此放弃了。那就可惜了。如果有条件还是要将自己置身于一个相对好的学习环境,尽快的掌握或者了解生物信息学技术。时间是什么都换不来的最宝贵的资源。

第三: 遇到报错一定要耐心

学习过程中,遇到报错一定要有耐心,不要轻言放弃。95%的报错是因为输入、输出的路径或者文件的错误,所以仔细检查是能发现错误的。5%的报错,新手还是需要借助外界的帮助,这再次说明了学习环境的重要性。

第四:修行最终要靠自己

那么多软件,那么多分析方法。学到的只是最常用,入门的方法,后面的修行要靠自己了。多思考,多摸索。如果学习生物信息的目的是科研,那一定需要有自己探索精神,寻找资料,解决问题的能力。我希望我今后能有这样的能力。

第五: 记录很重要,没有记录就等于没有发生,真的是这样

学习的过程,在督促下坚持记录笔记,慢慢的就体会到了笔记的重要性。事无巨细,什么都可以记录。笔记是给自己看的,自己记录的点点滴滴,自己翻起来马上就会有影响。所以,别人整理的再好,那是别人的,一定要借鉴过来,整理出自己的。我的简书https://www.jianshu.com/u/548b03e8cfb3。

第六: 学无止境

生物信息学是一个知识的海洋,有太多的东西需要学习,不断提高自己的认知能力,思维能力,操作能力。这是一个无比漫长的过程。在jimmy的带领下,大家一起往前走。




西安交通大学宋博士(淘淘)(实习生)


之前觉得电脑是一个用来看视频,慢慢会被手机取代的笨笨的大玩意。直到自己定课题出现了问题,海量的文献海量的资料,不知道怎么找头绪。然后了解到基因批量处理技术,然后又重新捡起那个笨笨的大玩意,原来笨笨的是自己。

      来到公司学习的之前,生信技能树Linux的视频匆匆的看了一遍,也是雨里雾里的一脸懵。一开始感觉好麻烦,各种命令一个都不知道,也记不住,还得一个一个输入,竟然也没有模糊匹配,多一个空格有时候也会报错。切换一个文件夹都得折腾老半天,崔老师讲的命令我很多时候也记不住,当时就很着急了,就百度上各种搜索,结果搜了一大堆基础知识,操作的时候还是不会,感觉自己好笨。但崔老师很有耐心,我们每次问的问题,可能都被问过好多次了,或者她已经强调了很多次了,她还是会给我们解答,耐心的帮我们解决报错。崔老师督促我们记学习笔记,真的会很好的帮我们复习和巩固今天学的知识。

      感觉就像老师说的那样子,带着学习需求去学习,带着某个命令可以帮自己实现某个功能去学习。不是一股脑地谷歌或者看书把基础知识全部看完之后再去做,然后会发现自己还是不会操作。边做项目边学习,遇到问题解决问题,自己测试发现这样是更高效。

     感谢生信技能树提供的平台,感谢崔老师耐心的指导,让我从零基础入门很有信心!




上海某司法鉴定所孟孟感言(实习生)


崔老师,首先特别感谢你!今天是我觉得最开心的一天,有了一点点参与进去的感觉。最主要是上午你站在我身边,让我把那条命令输完,接下来才有了今天下午后了生产vcf文件,才慢慢和大家一样,把当天该做的做了。老师你说得对,再先有了一点理解的基础上先把命令输完,看输出结果是什么,报错是什么,再去调试。我不知道我之前为什么要在那看,瞪着两个眼睛看,别人都输完了,我都忘了要干什么了。可能是我反应比较慢吧,亦或者学习方法一直不对。我其实动作一直比较慢,执行能力比较差,谢谢老师让我通过这几天的学习,意识到自己的严重问题。我想着如果一开始就抓紧动手操作,一有问题就问,积极的和旁边快的同学及时交流,可能就不会落下。我想着现在意识到还不晚,希望自己能尽快赶上。有的问题,问过老师您以后,自己真正会了才能记住,幸亏是小班教学。而今天我遇到的问题张老师也遇到了,因为问了崔老师您,我知道了,理解了,就能告诉张老师,帮他解决了这个报错,内心还是非常开心的,特别感谢崔老师您的耐心,因为有的问题可能您说一遍,我并没有get到那个点,可能还要问您,而您还耐心的给解答,太了不起啦。总之,我觉得我最大的心得是,特别感谢老师!让我渐渐入门了!


讲师附言

见证了一批批学员从疑惑,迷惑到清晰,再迷惑再到自己解惑的时期。虽然三天不能让你全部学会,但是我希望初学的你有一个开心接受的过程,能激发你日后还想研究、继续探究的动力!

很多学员和老师也都是一脸懵圈的学习生信,尤其年龄大且公事烦身者,但是见过太多老师坚持学习一周后,思路就清晰了。其实纯湿实验者理解数据分析,尤其电脑动手能力不强者,学得慢和难也属正常,要么怎么说万事开头难,但是传递方法正确了,入门也可以快一些。

加油,互勉!

收费

统一收费  3199  ,三天课程,因为上门培训需要租借场地会议室,讲师们的机票和酒店费用也不少,不设置减免渠道。

但是如果选择来广东珠海公司参加线下培训,可以朋友圈集赞或者团报优惠,优惠金额500元封顶。

礼品留念

生信技能树纪念版U盘  32G  USB3.1,内附全套生物信息学入门资料,学员爱心售价30元,我们将会双倍捐献给有需要的人群,并在公众号告知大家! 

同时提供定制化培训

肿瘤多组学;

三维基因组;

单细胞转录组;


同样的联系小助手咨询详情哦! 

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