免费视频课程ATAC-seq实战演练

我这七年写了几万篇教程，制作了几百个小时的教学实战演练视频课程，都是免费分享在各大网站（B站，知乎，简书，博客，GitHub，微云），必然会出现部分教程过时，一些资料缺失（主要是链接失效）。而且很多平台都是生信技能树的各个志愿者帮忙打理，我不可能要求大家伙在辛辛苦苦帮我整理和发布资料的同时还提供答疑。比如这几天在登陆b站，就看到了这两年来积累的“铺天盖地的”留言和私信，我已经在：免费视频课程《RNA-seq数据分析》交流群组建通知 列出来了。

我非常能理解，大家想急切跟我交流的心情，其实就是初学者心态，七年前我也是这样过来的。但是我的时间和精力确实是有限的，很多事情我只能是雇人来做！接下来我会组建15个B站NGS组学答疑微信群，老规矩，需要18.8的入群费用，里面的群公告会及时更新课程相关资料，主要是云盘链接总是被坏人举报，太多的好资料需要更新。也会有一些答疑视频互动，以及对应的答疑推文。

今天，我们带来的是ATAC-seq数据分析-B站免费课程交流群。

我们所有的群都是由生信技能树的官方拉群小助手操作，大家在应该是多次看到了：

还是老规矩，18.8元进群，一个简单的门槛，隔绝那些营销号！同时，我们也会在群里共享跟ATAC-seq数据分析-B站免费课程相关资料，仅此而已，考虑清楚哦！ 

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烦请备注姓名学校单位信息

课程观看方式

• 视频免费在B站,https://www.bilibili.com/video/BV1C7411C7ez 大家学习的时候记得发弹幕交流哈

• 同步查看视频配套代码 ：https://www.jianshu.com/p/5bce43a537fd

• ATAC-SEQ实战演练的素材 链接：https://share.weiyun.com/5rYmPT1 密码：dr3ub6 包括一些公司PPT，综述以及文献。测试数据下载方式也是在里面了。

• ATAC-SEQ 实战演练的思维导图：文档链接：https://mubu.com/doc/2DG1mC2kdg 密码：rf2n

• 学徒学习笔记：https://mp.weixin.qq.com/s/7wNRrpkqcuQmJ7ASlpytqw

课程目录

章节1:背景

• 课时1：序言，时长09:44
• 课时2：技术背景知识，时长03:50
• 课时3：学习资料推荐，时长04:00
• 课时4：提取分析流程，时长03:36
• 课时5：流程相关软件细化，时长03:00
• 课时6：实例文章解读，时长03:45

章节2:实战

• 课时7：软件安装及数据下载，时长06:30
• 课时8：fastq数据质控过滤，时长10:06
• 课时9：质控的可视化，时长09:28
• 课时10：使用bowtie2进行比对，时长05:19
• 课时11：比对后的bam文件的系列过滤，时长08:31
• 课时12：批处理比对全流程，时长06:26
• 课时13：比对过程总结，时长12:18
• 课时14：使用macs2找peaks，时长04:59
• 课时15：插入片段统计以及FRiP值计算，时长11:36
• 课时16：IDR检验技术重复性，时长06:01
• 课时17：deeptools，时长14:35
• 课时18：peaks的注释，时长11:49
• 课时19：atac-seq-19-找motif大全，时长08:29
• 课时20：我为什么我不用esATAC，时长07:23

章节3:外传

• 课时21：python模块版本调试

需要基本生信背景知识

当然需要读者具备计算机基础知识，我把它粗略的分成基于R语言的统计可视化，以及基于Linux的NGS数据处理：

其中，对ATAC-SEQ实战演练来说，R和Linux都很重要，我把R的知识点路线图搞定，如下：

• 了解常量和变量概念
• 加减乘除等运算（计算器）
• 多种数据类型（数值，字符，逻辑，因子）
• 多种数据结构（向量，矩阵，数组，数据框，列表）
• 文件读取和写出
• 简单统计可视化
• 无限量函数学习

如果大家没有时间自行慢慢学习，可以考虑我们生信技能树官方举办的学习班：