单细胞初级8讲和高级分析8讲
之前我们推荐了《生信会客厅》的系列单细胞教程,非常棒!终于在《单细胞天地》转载完毕,合辑目录附上:
初级分析
单细胞转录组基础分析一:分析环境搭建 单细胞转录组基础分析二:数据质控与标准化 单细胞转录组基础分析三:降维与聚类 单细胞转录组基础分析四:细胞类型鉴定 单细胞转录组基础分析五:细胞再聚类 单细胞转录组基础分析六:伪时间分析 单细胞转录组基础分析七:差异基因富集分析 单细胞转录组基础分析八:可视化工具总结
高级分析
单细胞转录组高级分析一:多样本合并与批次校正 单细胞转录组高级分析二:转录调控网络分析 单细胞转录组高级分析三:细胞通讯分析 单细胞转录组高级分析四:scRNA数据推断CNV 单细胞转录组高级分析五:GSEA与GSVA分析 单细胞转录组高级分析六:TCGA生存分析 单细胞转录组高级分析七:整合scATAC数据 单细胞转录组高级分析八:整合V(D)J数据
其实我也有单细胞课程,有空的也可以看看哈!
全网第一个单细胞课程(免费基础课程)
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「生信技能树」单细胞进阶数据处理之文献导读,链接是:https://www.bilibili.com/video/BV17f4y1R7N8
「生信技能树」使用10X单细胞转录组数据探索免疫治疗,链接是:https://www.bilibili.com/video/BV1xD4y1S74P
「生信技能树」单细胞基因组数据拷贝数变异分析流程,链接是:https://www.bilibili.com/video/BV1Yf4y1R75R
「生信技能树」云服务器处理单细胞转录组数据,链接是:https://www.bilibili.com/video/BV154411Z7DU
「生信技能树」使用Smart-seq2单细胞转录组数据探索小鼠性腺发育,链接是:https://www.bilibili.com/video/BV1454y1q77Z
当然,如果你完全看不懂,那就是你的基础知识掌握的不牢固。再怎么强调生物信息学数据分析学习过程的计算机基础知识的打磨都不为过,我把它粗略的分成基于R语言的统计可视化,以及基于Linux的NGS数据处理: