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亚实性结节和磨玻璃结节肺腺癌单细胞水平的差异如何

生信技能树 生信技能树 2022-08-15

最近在朋友圈看到两个还算是比较类似的单细胞文章:

  • 2021年1月27日,亚实性结节(SSN)的肺腺癌 单细胞文章是:https://advances.sciencemag.org/content/7/5/eabd9738
    • Here, we performed single-cell RNA sequencing analyses of 16 SSN samples, 6 adjacent normal lung tissues (nLung), and 9 primary LUAD with lymph node metastasis (mLUAD).
    • 亚实性结节(SSN)的肺腺癌 单细胞
  • 2020的10月6日,磨玻璃结节肺腺癌(GGN-ADC)单细胞文章是: https://www.nature.com/articles/s41421-020-00200-x
    • We obtained 60,459 cells and then classified them as eight cell types, including cancer cells, endothelial cells, fibroblasts, T cells, B cells, Nature killer cells, mast cells, and myeloid cells. We provided a comprehensive description of the cancer cells and stromal cells.
    • 磨玻璃结节肺腺癌(GGN-ADC)单细胞

一些科研公司的公众号对该文献具体的介绍是:

  • 2020的10月6日,复旦大学附属中山医院胸外科王群教授团队在Cell Discovery杂志(IF:6.255)发表了题为“Single-cell transcriptome atlas of lung adenocarcinoma featured with ground glass nodules”的研究论文。该研究利用高通量单细胞转录组测序比较了磨玻璃结节肺腺癌(GGN-ADC,lung adenocarcinoma featured with ground glass nodules)和实性肺腺癌(SADC,solid adenocarcinoma)肿瘤微环境图谱的异同点,解析了GGN-ADCs能够保持稳定并有良好预后的可能原因。详见:https://mp.weixin.qq.com/s/m-jjizPdk6dSpOukmhsdXw
  • 2021年1月27日,京大学人民医院胸外科主任王俊院士团队与北京大学生物医学前沿创新中心(BIOPIC)、北京未来基因诊断高精尖创新中心(ICG)、生命科学学院白凡研究员团队合作在Science Advances(IF 13.116)发表肺腺癌肿瘤微环境最新研究成果"Decoding the multicellular ecosystem of lung adenocarcinoma manifested as pulmonary subsolid nodules by single-cell RNA sequencing" 该研究利用单细胞测序技术全面揭示了影像学表现为亚实性结节(SSN)的肺腺癌免疫微环境特征,为SSN相对惰性的生物学特性和较好的临床预后特点提供了单细胞尺度上的解释。详见;https://mp.weixin.qq.com/s/4f-LbubSwmB4R3zcFcmakg

其单细胞数据集分别是:

  • 磨玻璃结节的肺腺癌单细胞研究是:选取GGN-ADC和SADC组病人各5例进行10x Genomics单细胞转录组测序,结果共获得60,459 个细胞的表达谱数据,成功鉴定出肿瘤细胞、内皮细胞、T细胞等9种细胞类型。
  • 亚实性结节的肺腺癌单细胞研究是:对16名CT影像学表现为SSN的肺腺癌患者的手术切除样本进行单细胞转录组测序,同时整合已发表的6例癌旁样本(nLung)和9例进展性肺腺癌样本(mLUAD)的数据,共获得118,293个单细胞数据,鉴定出10种主要的细胞类型。

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