听过了那么多道理，还是过不好这一生；
收藏了那么多资料，还是学不会生信分析；
拷贝了那么多代码，还是做不出科研图表。
没有灵魂的商业培训比比皆是，走心又有趣的线下课程万里挑一！现在，有一个机会摆在你眼前，你看着办咯~
即将到来的五月，生信技能树重启线下培训：数据挖掘课。
1.课程介绍
生信技能树教学团队在生信菜鸟团博客、生信技能树论坛及同名公众号数万篇教程的基础上，经历7年沉淀和发展，探索设计了一套完全适合初学者入门且富有趣味的课程，循序渐进地带你越过初学生信的障碍，用优秀的数据分析与可视化技能为科研和工作增光添彩。目前团队成功举办的课程有：
2018
在珠海开设线下学徒班、周末班
2019
生信入门班全国巡讲21场（线下）
广州数据挖掘线下小班课3场
单位邀请上门培训3场
2020
生信入门班线上直播课12场
数据挖掘班线上直播课10场
2021(线上)
生信入门线上直播课2场
数据挖掘线上直播课2场
从2021年5月起，我们将陆续重启线下培训，从数据挖掘课开始啦~
2. 时间地点
广州：5.2-5.3，成都：5.15-5.16，长沙：5.22-5.23
上课时间早九晚六，详细地址将于开课前在微信群具体告知！
3.课表
第一天上午
9:00-10:25 R语言入门
1.R语言简介
2.R软件和Rstudio的安装
3.Rstudio的介绍、设置和使用
4.适合生信入门的R语言学习路线
5.Rproject与工作目录
6.R语言数据类型介绍
10:35-12:00 数据管理
1.R语言数据类型的判断和转换
2.数据结构介绍、生成和运算
3.数据筛选和修改
4.数据结构判断及转换
第一天下午
2:00-3:25 函数与R包
1.函数与参数介绍
2.自定义函数编写
3.R包的三大来源及对应安装函数
4.典型R包举例
5.R语言镜像设置的两种方法
6.R包安装和使用的逻辑
7.获取帮助的几种方法
8·初学者常见的R包五大报错及解决办法
9.R包进阶：批量安装和避免重复安装
3:25-4:55 数据读写与R语言绘图
1.R语言数据读入和写出的几对函数
2.R语言内置数据
3.工作目录管理范例
4.R基础包的高级、低级绘图函数和绘图参数
5科研绘图必学ggplot2和ggpubr
6.一页多图和图片保存
7.R语言绘图案例:热图、火山图、PCA、箱线图
8.各种统计分布
5:05—6:00 R语言进阶应用
1.条件与循环语句及其应用
2.长脚本管理方法
3.tidyverse三大包的应用
4·批处理函数（apply系列）
第二天上午
9:00-10:25 GEO数据库挖掘介绍
1.GEO数据库介绍
2.课题设计思路和数据分析流程介绍
3.几篇典型文献解读
4.不同种类的数据区分
10:35-12:00 GEO数据挖掘实战(上)
1.R包安装与数据准备
2.数据下载与读取
3.芯片注释与分组信息的获取
4.数据质控—PCA、热图、相关性
5.差异分析及结果整理
第二天下午
2:00-2:30 彩蛋时间
1.搜索技巧、学习方法、效率工具
2.文献查找、翻译、下载、管理工具
3.PPT技巧、云同步工具、优选学习资源
2:30-3:25 GEO数据挖掘实战(中)
1.GO和KEGG富集分析
2.多分组的芯片分析策略
3.多个数据集联合分析
3:35-4:55 GEO进阶和应用(下)
1.string网页工具获取ppi
2.cytoscape网络图
3.ppi子网络的拆分
4.hub基因获取
5:05-6:00 文章解读和复现
1.文章思路介绍与解读
2.图表重现
3.答疑和交流
考虑到TCGA部分分析难度较高，两天线下课能接受的知识有限，我们将TCGA改成了线上直播互动课的形式，将于六月第三周统一授课，并提供直播录屏给大家！
TCGA线上直播课
SPRING
Day1 TCGA数据下载
1.官网下载
2.xena下载
3.gdcRNAtools下载
Day2 差异分析及其可视化
1.三大R包差异分析
2.火山图、热图、PCA、维恩图
3.TCGA以外的转录组数据差异分析
Day3 数据整理
1.基因id转换和注释查找
2.lncRNA和mRNA的拆分
3.生存分析所需数据的整理
4.典型文献解读
Day4 生存分析与模型构建
1.任意基因的生存分析
2.单因素cox回归
3.lasso回归
4.多因素cox回归
5.随机森林和支持向量机模型
Day5 数据分析常见需求和文章复现
1.模型评估指标与方法
2.体细胞突变数据处理和可视化
3.任意基因的任意分组比较
4.任意两个分子的相关性分析
5.一篇TCGA文献解读和复现
部分图表：
具体的图表数量再多也是有限的，我们更注重的是帮助你搞定R语言画图的方法和规律，授人以渔~
4.课前准备与课后答疑
开课前一周为课前准备时间，团队会保障大家顺利安装软件、R包；
课后一个月为快速答疑期，将在微信群详细解答学员提出的问题。（群不解散，一个月后仍可提问，但不保证响应速度）
我们不仅关心你的课前课中课后，还设计了课上和课后的强化练习题，且会根据所有学员的反馈不断升级课程，因为用心，所以更好。反馈表现在攒了两三厘米，希望以后有你的一页
5.课程讲师
孙老师，生信技能树核心成员，生信星球公众号创办人之一，简书、公众号原创作者、今日头条认证优质作者。自 2018 年 5 月起，在各写作平台分享了数百篇生物信息学笔记、教程，累计 20 万+字（字数统计不包括代码），如《详解 R 数据科学》，《蛋白结构预测与分子对接》、《R 包 shiny 开发网页》、《ggplot2 作图》、《GEO 数据挖掘》、《TCGA》、《R 包开发》等系列；
2018 年 8 月至今，开办了100+期线上学习小组，指导了上千名生信小白零基础入门，十分了解初学者入门生信的障碍、心理和常见问题；
2019 年 担任生信技能树团队线下讲师，主讲了全国巡讲的 R 语言和 GEO 数据挖掘部分、广州专场 GEO 数据挖掘课和多场上门培训，累计 30 多场。
2020年全面转为线上课，主讲了数据挖掘直播课和全国巡讲全球听课程的 R 语言、 GEO 数据挖掘部分，累计22场。
课堂轻松有趣，重点明确，讲练结合，给学员充分的练习和试错机会，掌握必备的数据处理、挖掘、可视化等技能。
配备生信技能树强大的助教队伍，他们基础扎实、数据分析经验丰富，并多次参与线上和线下课程助教工作，全方位保障你的入门！
6.报名方式
报名费2899元，包含两天线下课与一周线上直播课的学费，可开据发票。本月的三场课程均可报名：
广州：5.2-5.3，成都：5.15-5.16，长沙：5.22-5.23
添加小助手微信即可咨询报名。⏬
团报优惠
两人团报限时每人优惠200元；
三人及以上团报限时每人优惠300元。
最后一个小惊喜，不仅仅是数据挖掘， 参加线下培训相当于进入生信技能树小圈子，解锁更多学习资料更方便！