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计算重合元素—— 韦恩图走起

2017-06-12 Action Free ActionFree ActionFree

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     在茫茫的科研生涯里,总是有很多时候需要找重合的元素,你是不是还在头痛导师给你了好几个数百个基因/元素的表格,让你把重合的元素找出来? 你是不是也在纠结自己得到的结果,与文献中报道的结果到底有多少重复?一个一个的看,眼都看花了还容易出错,问题是时间啊,大把大把的时间都用来数数了,我都怀疑自己读了一个假博士T_T~~~用excel的match函数? 斯以为还是耗时又麻烦,如果碰到基因数目太多的时候,会卡死电脑ORZ~~~

       今天跟大家安利两个网站,Venny 和BEG Calculate and draw custom Venn diagrams 帮你轻松搞定如上困境。

Venny

     Venny(http://bioinfogp.cnb.csic.es/tools/venny/ )是由Juan Carlos Oliveros发布的一个在线的Venn图制作工具,支持4个以内的列表的比较,可以快速的给出图片结果,只需要将你要比较的list复制-粘贴到对应的方框里面,修改list名称,还可以查看overlap的元素。另外,Venny支持三种不同的表现形式,喜欢彩色或者黑白任你选择。示例如下:

图1 网站页面


图2 分析实例



      而如果你要比较的list比较多,大于4个,Venny可能就无能无力了,这时候BEG Calculate and draw custom Venn diagrams的优势就显出来了。

BEG Calculate & draw custom Venn diagrams

(http://bioinformatics.psb.ugent.be/webtools/Venn/)

图3 网站首页


       该网站最多给出5组比较的结果,但是可以通过Add Another List增加list数目,就可以比较数十种list的overlap,表格的结果。结果示例如下

怎么样,你学会了吗?


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