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笔记01 | 为啥学“生信”

2017-09-15 徐梦 ActionFree ActionFree
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 开讲啦~应用生物信息学听课笔记
什么是程序?


生命是如何创造的?远古时代,我们认为是神创造的,上帝就是神!而在科技文明时代,那么上帝就是超级程序猿,生命则是上帝语言程序最佳的实现! 但是这个程序也会有bug,一旦有了bug的生命体,便有了“疾病状态”                                                         ——超哥如是说

形象的导入让人眼前一亮,来张图来感受一下


接下来开始我们专业的课堂笔记!

解析上帝的语言:生物信息学


生物信息学是一门收集、 分析遗传数据以及分发给研究机构的新学科 (Dr. Hwa A. Lim, 1987);

生物信息学采用计算机科学和信息技术的一系列概念和工具来理解生物学数据。


生物信息学是交叉学科


数据库、方法、工具和标准

例如建立数据库,开发工具~


为什么生物信息学如此重要?


micoRNA的发现实例告诉你WHY?先利用microRNA的特点,再利用生物信息学预测更多的microRNA,寻找到你的Target~那还有什么呢?高通量测序数据,质谱结果,蛋白质三维结构等等等等,这么多数据怎么办?嗯,生物信息帮你找到隐藏的信息!

传统生物学VS现代生物学


犹如高屋建瓴与管中窥豹


生物信息学的领域知多少?

         

化学,统计,计算机科学、生物等等可都有我们的身影哦,我们是焦点~划重点:生物学家的idear需要统计学家,计算机人员来帮助我们开发工具,解决问题,为生物界添砖加瓦

生物信息学局限之生物信息学可以给你带来什么呢?


嗯,不需要你是天才程序猿,也不需要你是天才统计学家,你只需要会用这个工具,并且能看懂bug,能够解决问题,足矣啦~

生物信息学之必备技能!


计算机技能:编程语言、数据库以及医学生物学统计学知识

        Unix/Linux    

为什么学习Linux?

科学研究平台

数量庞大的工具

高质量的文档

关键还有免费!


生信大全观


Linux、C++、Java(初学者较难,运行非常快)、Perl(文本处理能力很强,缺点,比较自由,不易交流,淘汰啦~),python(简短严谨,目前最流行)、AWK(文本处理语言,适合初学者,一行代码可解决~)还有R,为什么学R呢?R既是画图又是一门编程语言。可以画出非常高级的图,一看就是科研人员画的图(嗯,听到此,科研狗必需得入坑啊),excel太low了,较复杂的统计分析就做不了,而且可重复性就麻烦~

课程寄语


未来已来,只是尚未流行!所以从今天开始好好学习吧~


终于开始装linux啦~安装虚拟机~请移步!

往期精彩回顾

实习课01| 虚拟机安装教程| Linux学习前的准备~

UCSC数据库,全方位巡视一段DNA序列

人类基因信息的“百事通”genecards

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整理:徐梦


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