【金域医学陈敬贤教授专访】新冠常态化+突变形势下，呼吸道病原体检测前行之路在何方？

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日前，印度新冠疫情再次迎来大爆发，统计数据显示：印度日增确诊病例已连续多日超过30万例。印度疫情为何突然疯狂反弹？原因之一推测是印度已成为变异新冠病毒聚集地。随着新型冠状病毒不同突变株的出现，疫情也许会进入一个更加难以预测的阶段。国际疫情形势依旧严峻，国内趋于平稳，并大力推动疫苗注射，由于新冠疫情刺激下的呼吸道病原体检测也迎来新的关注。

对我们核酸检测工作来说，需要时时注意各个突变的位置，如果突变的位点恰好位于探针或引物的序列内，则可考虑重新调整探针/引物内的某一二个核苷酸，以免漏检。如果突变导致病毒抗原编码区内氨基酸的改变，则需注意它们可能对抗原抗体检测产生影响。

——陈敬贤教授

基于此，MDx组委特邀金域医学病毒诊断与转化中心呼吸道疾病学科带头人陈敬贤教授进行深度专访，率先分享他和团队在新冠等传染性疾病病毒研究及检测领域的创新开发与实践经验。将于2021年5月20-21日在上海新发展亚太JW万豪酒店召开的生物药年度盛会“MDx2021第七届先进分子诊断技术与应用论坛”也有幸邀约陈教授出席现场做精彩分享。

陈敬贤  微生物学博士、教授金域医学病毒诊断与转化中心呼吸道疾病学科带头人

国家呼吸疾病临床研究中心病毒诊断研究分中心和金域医学集团临床呼吸道病毒诊断与转化中心的学科带头人，前美国哥伦比亚大学病理与细胞生物学系统资深研究员。

毕业于安徽医科大学、上海第二医科大学和美国哥伦比亚大学医学院，1992年起在美国哥伦比亚大学医学院从事分子病毒学和神经生物学研究。迄今已在Cell, Journal ofInfectious Diseases, Clinical Infectious Diseases等杂志发表论文70多篇。参与编写Manual of Clinical Microbiology (9thEdition)，出版了《诊断病毒学》（编著）和《临床病毒学》（主译）等专著。

MDx组委：金域医学在本次新冠疫情中勇担核酸检测重任，截至2021年3月底核酸检测累计超6200万人份，想请您谈谈对于目前的新冠检测，尤其是变异株频繁发现等全球疫情背景下，您对于新冠病毒检测的新思考？以及关于国内外的新冠疫苗的看法和建议？

陈教授：

新冠检测已常规化和全方位化，除了作为主流的核酸检测，还包括抗原抗体的检测，以满足不同临床场景（疑似、密切、发病初期、恢复期）的需要。另一方面，核酸检测的普及大大提升了对其他呼吸道病原体的检验，需要我们加强对基层医疗机构的培训。此外，要进一步加强对环境样本的病毒监测，包括各种水源、医院环境以及食品如冷链食品及其包装的检测。

核酸特别是RNA在复制过程中会发生一定频率的突变，这些突变通常是随机，无方向的。病毒由于增殖快，突变株会更容易出现。对我们的核酸检测工作来说，需要时时注意各个突变的位置，如果突变的位点恰好位于探针或引物的序列内，则可考虑重新调整探针/引物内的某一二个核苷酸，以免漏检。如果突变导致病毒抗原编码区内氨基酸的改变，则需注意它们可能对抗原抗体检测产生影响。

关于新冠疫苗，国内目前主要应用的是灭活疫苗，其它如基因重组疫苗（如mRNA）、病毒载体疫苗、重组蛋白疫苗。从已报道的三期临床数据来看，这些疫苗对重症感染和致死性感染都有优良的保护率，因此建议大家及时就近注射，这将有助于尽快建立全民免疫。

展望未来，我觉得需要建立和完善各种疫苗的研发平台，增加能够提供小动物和灵长类动物试验的合格实验室，以及规模化生产所需要的细胞培养、纯化与浓缩培养物/蛋白质/核酸、产品的灌装与保存等场所和设备。特别要指出的是，研发能够更有效地提高免疫效果的疫苗剂型和佐剂。

MDx组委：您对于呼吸道传染性疾病病毒研究成果颇丰，对于在新冠刺激下，目前行业内风头正起的病原多重联合检测技术与宏基因组测序技术在感染诊断领域的开发应用，想听听您的看法和评价如何，对于行业有什么建议？

陈教授：

病原体多重联合检测特别是以临床表现为区分的多重检测技术（呼吸道、消化道、中枢神经系统等），可以同时检测一种以上的病原体，有明显的优势。而mNGS则能对样本中几乎所有的核酸予以扩增和测序，因而覆盖面更广。这些基于核酸扩增的方法大大提高了检测的应用范围。但是带来的问题主要有2个：

1.适用于哪些临床场景？性价比怎么样？

2.由于这些技术的应用结果是常常同时检出多种病原体包括条件致病菌，如何对结果作出合理的解释，或从中筛选出正确的信息，对实验室和临床医师都是一个挑战。

我觉得mNGS宜用于：

1. 未知病原体;

2. 相对无菌的临床样本（脑脊液、血液等）;

3. 紧急情况（ICU、中枢神经系统感染）。

遇到有较为明确的怀疑对象（如结核病、曲霉菌感染），则宜先用单重/小多重PCR，因为那些方法比mNGS更为快速、敏感、经济。

MDx组委：您作为金域医学病毒诊断与转化中心呼吸道疾病学科带头人，也想请您简单谈谈，接下来在后疫情时代，金域对于感染疾病诊断领域的研究计划和布局？

陈教授：

2018年，在钟南山院士支持下，金域医学与其团队广州呼吸健康研究院联合成立了临床呼吸道病毒诊断与转化中心，并挂牌“国家呼吸系统疾病临床医学研究中心病毒诊断研究中心”。经过新冠一战，金域医学专门成立了新冠核酸检测的工作组，承担日常疫情防控所需的检测工作，一旦有突发疫情，工作组可以在公司的协调下迅速扩增其检测能力。把新的核酸检测技术项目向各个子公司推广，并通过大规模筛查、网格化常备、移动方舱实验室、区域检测/病原学诊断中心等四大方案，进一步向基层医疗机构推广。

2020年，在金域医学助力下，国家呼吸系统疾病临床医学研究中心病毒诊断研究和推广区域平台正式成立，将为各单位提供精准的医学检测、基层学术推广、诊断能力共建、大数据开发及应用等多样化的服务。

此外，我们还将建立健全感染病理学科的各种技术平台，为感染性疾病的精准诊断做好服务。

MDx组委：感谢陈教授的精彩分享！敬请期待陈教授在会议现场带来更多专业分享！

END

（点击图片查看精彩议题及重磅嘉宾）

2021年5月20-21日，MDx 2021第七届中国先进分子诊断技术与应用论坛将在上海新发展亚太JW万豪酒店举办。

本届论坛将结合国内当下分子诊断大环境，深度探讨分子诊断“特区”“自检”“人遗”等IVD注册申报法规变更、基于NGS/纳米孔测序技术的临床落地方案/平台进展等前沿走向、PCR/RAA/dPCR/MMCA/CRISPR等核酸快检技术路线优化落地、微流控/POCT/多重病原体联检等一体化、自动化产品开发等分子诊断行业痛点与年度热门议题。

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