微远基因许腾博士:临床病原捕获技术赋能mNGS,构建多技术平台,加速领跑感染精准赛道
整合创新资源
倾听技术之声
疫情下催化社会感染传染病防控能力,病原检测技术进一步升级。搭建更完备的预防和诊断方案,织起各级医院、疾控、第三方临检机构,乃至社区、居家,畜牧的监测网络需要行业各方的共同努力。
近日,作为感染精准医学的行业引领者之一的微远基因完成腾讯领投的2亿元C轮融资,将继续聚焦于产品研发与升级。近期,微远基因也推出病原宏基因组学升级技术与产品IDseqTMUltra,通过临床病原捕获技术实现全血检测,推动感染领域的临床精准诊断。
基于此,MDx组委特邀微远基因创始人兼首席技术官许腾博士进行深度专访,许博也将出席于2021年5月20-21日在上海新发展亚太JW万豪酒店召开的分子诊断年度盛会“MDx2021第七届先进分子诊断技术与应用论坛”参与圆桌讨论,深刻探讨不定向测序/靶向测序分子诊断产品开发及临床应用解决方案。
微远基因创始人&CTO
广州市“红棉计划”创业人才
云南省基因编辑重点实验室客座教授
广州市开发区抗击疫情科研攻关突出贡献个人
美国SA Scientific公司,感染产品线资深科学家(2012-2018)
美国SA Scientific公司,科学与技术顾问
中国医学装备协会及检验医学分会委员
中国生物医学工程学会医学检验工程分会青年委员
发表SCI论文20+,他引逾3000次;申请/授权专利近30项
MDx组委:
距离疫情爆发已经一年多,在这过程中感谢您和微远的突出贡献,在这期间您对于新冠等传染、感染性疾病的检测诊断有哪些新的思考?目前行业还存在哪些壁垒与解决思路几何?
许腾博士:
新冠疫情对病原体的鉴定周期只用了数天,相比于非典时期的数月,体现了感染诊断领域这十几年来的巨大进步。然而新冠疫情仍然对我们的医疗体系产生了重大的考验,使得我们发现整个行业,尤其是传染感染性疾病的检验诊断还存在一些问题,也说明全球应对大规模突发传染病的能力实际上还是有一些短板。从技术层面来讲,罕见新发病原体的检测能力还是需要从技术上进一步加强,虽然目前进步迅速,尤其是病原宏基因组学的进步带来了很大的变化,但不管是其规范化落地,还是进一步拓展实际应用,这个技术还在逐步优化的阶段。2021年国家临检中心针对mNGS技术的全国质评中,仅有44%的参与单位合格,5家单位获得满分(微远为唯一满分企业),说明该领域各单位间的技术水平仍然有非常大的差异,需要进一步的规范和提升; 从信息共享层面来讲,现在新冠病毒的个人检测信息跟疫苗接种信息都可整合到卫生健康平台,这是巨大的进步。后续还会有更多的信息平台要去整合,来提高整个社会疫情防控的能力,包括从个人信息、医疗机构来源、海关疾控、流行病学信息、新发病人、潜在新发病人信息等; 从检测场景与对象层面来讲,未来还需要一套更加完备的传染/感染疾病预防和诊断的方案,结合临床、疾控、检验、第三方临检机构形成的网络,甚至纳入社区检测跟家庭检测的场景,搭建这样一个完整的监测网络。
基于此,作为专注于分子精准诊断领域的头部企业,微远也在努力能够通过病原宏基因组学(mNGS)跟分子POCT两个技术平台产品的开发,从不同的场景和应用推进感染传染检测行业的发展。
MDx组委:
微远基因专注于基因技术创新与感染精准医疗,两大核心技术——病原宏基因组学(mNGS)诊断与基因编辑工具(CRISPR-Cas12/13)快速诊断都有很好的进展,也请您在这里透露下团队的最新技术与产品进展,开发过程中有哪些心得经验?
许腾博士:
微远作为国内最早开展病原宏基因组学技术开发的企业之一,在病原宏基因组学方面已经积累了丰富经验:已经服务超过十万名临床病患。2019年北京朝阳医院的鼠疫,以及此次新冠疫情最早期的鉴定过程中,微远团队利用病原宏基因组学产品IDseqTM均尽到了行业企业的一份责任。
随着临床应用经验的加深,我们也对该技术有了更深入的理解,病原宏基因组学技术最大的优势在于“一网打尽”的技术特点,这是其检出新发的新冠病毒的能力来源,但这同时也是一把双刃剑,因为检测出大量非病原核酸(如大量人源核酸),对整个检测的灵敏度和特异性产生很大挑战;
基于十万例大样本的检测,微远团队花了两年多的时间,投入大量人力物力开发了临床病原捕获新技术,推出了基于临床病原捕获技术的新产品IDseqTMUltra:
技术设计思路是基于十万例真实基因组大数据,设计百万级别的探针,经过多轮优化,从而可以对临床重点关注的数千种病原体做百倍以上富集的同时,保留mNGS一网打尽的技术特点,不遗漏新发病原体。
在临床病原宏基因组学的应用里,常见的三种样本类型为血液、脑脊液和呼吸道样本,我们此次的技术对于以上样本类型的检测均有很好的优化与突破进展:
1.血液样本,受限于血液中白细胞的影响,目前病原宏基因组学基本只能折衷选择用血浆进行检测,而基于临床病原捕获技术升级的IDseqTMUltra,可以克服人源干扰,用全血进行检测,与临床其他的培养,传统方法学的样本类型更一致,从而避免病原漏检;
2.脑脊液样本,一直是病原宏基因组学的难点之一,之前阳性率只有大概30%,但通过这个捕获技术,可以把灵敏度提高十到十五个百分点;
3. 对于呼吸道样本来讲,甚至可以对一些高载量病原,进行耐药突变检测(如结核耐药),给临床更多的用药指导建议。
另外关于POCT领域,我认为目前的分子POCT领域虽然依旧存在很多不完善不成熟的方面,但是整体发展趋势是对的。我们也可以预见在未来5年内,在疾病防控、检测、诊断等方面均将有很多新的变化。微远团队也正在积极地推进一款一体机,稍微可以透露一点是,我们的一体机是针对呼吸道感染性疾病的检测,主要应用场景为临床感染诊断,这里可以期待一下后续会有更新的进展和消息。
MDx组委:
最后请您谈谈对于感染诊断领域的前景展望,行业还可以有哪些突破思路?以及下一阶段您和微远团队将在哪些方向发力布局?
许腾博士:
感染精准诊断领域还有很长的路要走。据日前王辰院士分享的数据显示,对于抗感染用药,具有病原学诊断依据的抗生素用药比例,国际一线医疗机构的标准是28%,即28%的病人要有病原诊断的参考结果才能用药。从数据上看,实际上中国还是有不少距离的,意味着我们在感染诊断的能力跟技术上,还需要花很多的功夫去打造更多的“武器”,能够让临床跟检验科医生做好诊断。
感染是一大类非常复杂的疾病,从回答这个病人是不是感染,感染的是什么,感染的病源是怎么样的,到宿主响应和预后是什么样,实际上是一系列的问题,而行业现在很多时候还在努力地去解决“是不是感染”与“感染的是什么”这两个最基础的问题。
基于分子生物学的精准治疗,对于推动相关领域会发挥很大作用。这次新冠疫情以来,国家积极推动分子生物学实验室在各个医疗机构的建设,也为未来这个领域的深入发展奠定了一个非常好的基础。
微远会持续聚焦在感染精准诊断这个方向,从自身的病原宏基因组学(mNGS)诊断与基因编辑工具(CRISPR-Cas12/13)快速诊断为两个主要切入点去打造更好的产品,给临床科室、检验科室、海关疾控等各个应用场景去提供一套感染精准治疗的解决方案。
MDx组委:感谢许博士的精彩分享!敬请期待许博士在会议现场带来更多专业分享!
2021年5月20-21日,将在上海新发展亚太JW万豪酒店举办的MDx 2021第七届中国先进分子诊断技术与应用论坛完整议程精彩亮相,诚挚邀请行业精英齐聚一堂,共探感染诊断新格局!
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MDx2021终版议程
第一天 5月20日|周四
第二天 5月21日|周五
* 议程更新截至5月11日,以现场为准,
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