【前沿资讯】Hepatology | lncRNA CASC9:HNRNPL复合物协同调控AKT信号通路
与生存能力相关的长链非编码RNA(lncRNA)的鉴定有望为新的肝癌治疗方法提供理论基础。作者首先采用RNAi技术在肝细胞癌(HCC)细胞系中筛选与生存能力相关的lncRNAs。从鉴定到的对HCC细胞活力具有显著影响的多个lncRNA中,作者选择了CASC9(Cancer Susceptibility 9),因为其对肿瘤细胞生存力影响更强、在纳入试验的各肿瘤细胞系中均表达,且与正常肝脏组织相比其在HCC中呈上调表达。
通过CRISPR干扰、单个siRNA或siPOOL介导的CASC9敲减的结果表明,CASC9调控多个HCC细胞系的生存能力。此外,CASC9敲除促进了凋亡,降低了增殖。文章通过RNA亲和纯化(RAP)鉴定出RNA结合蛋白HNRNPL(异质性胞核核糖核蛋白L)是与CASC9相互作用的蛋白,并通过RNA免疫沉淀(RIP)对其进行验证。敲除HNRNPL后表现出生存力丧失,这与CASC9敲减后所观察到的表型一致。
对CASC9和HNRNPL敲除细胞的蛋白质组(SILAC,Analysis of the proteome)分析结果表明其为一组协同调控的基因,说明CASC9:HNRNPL复合物在AKT信号传导和DNA损伤感应中的作用。与正常对照组织相比,患者来源的肿瘤样本中CASC9表达水平升高,并且与HCC患者的总生存期显著相关。
总体而言,文章提供了一个全面的HCC生存相关的lncRNA列表,并发现CASC9:HNRNPL复合物作为临床生存力相关的lncRNA/蛋白质复合物,影响HCC AKT信号通路和DNA损伤感应。
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参考文献
Marcel Klingenberg, Matthias Groß, Ashish Goyal, et al. The lncRNA CASC9 and RNA binding protein HNRNPL form a complex and co-regulate genes linked to AKT signaling. Hepatology. Published online:23 May 2018.
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