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ERPLAB教程 | 原来画漂亮的脑电图可以这么容易!

喵君姐姐 壹脑云科研圈 2022-10-07



Hello,

这里是行上行下,我是喵君姐姐~


最近在家实在无聊,所以只好安安心心学习啦。你最近在家干什么呢?

今天来给大家安利ERPLAB的使用小贴士~

注意了!只需点点点就可以把脑电预处理搞定的软件来喽~

ERPLAB这款软件最大的优点就是将ERP数据处理图形界面化,操作友好,均在你我智商范围内,不用为代码而焦虑。

而且,它还能满足你随时随地处理数据的小心愿哦~还有,它画出来的图颜值高,可轻松搞定外貌协会。真的是太友好了!
 
今天这篇推文则主要介绍ERPLAB下载ERPLAB安装原始数据的载入画总平均图地形图导ERP成分峰值这6点内容。拯救不会敲代码的你。相见恨晚的LUCK团队来救你了!

1 ERPLAB下载


ERPLAB下载网址:
https://github.com/lucklab/erplab
图片源自https://github.com/lucklab/erplab

2 ERPLAB安装


因为ERPLAB依托EEGLAB实现其功能的,所以,首先将ERPLAB的文件夹安放到eeglab文件夹下属的plugins文件夹中。


ERPLAB文件夹安放位置:
eeglab14_1_2b/plugins/erplab7.0.0

安放好之后,eeglab软件变身为下图:


3 原始数据的载入


若你的数据是curry采集,那么需要安装插件loadcurry。


安装了该插件,curry软件采集的cdt格式的原始数据便能成功载入ERPLAB。


Loadcurry安放位置:

eeglab14_1_2b/plugins/loadcurry2.0


之后,载入curry软件采集的cdt格式的脑电数据了。步骤如下图:


鉴于ERPLAB去眼电的操作较难掌握的原因,那么为了避免不必要的误差,我选择curry软件进行脑电数据的预处理。经过一系列预处理之后,得到了avg格式的文件。接下来,我们便可以利用ERPLAB来画总平均图了。

4 总平均图

4.1 载入总平均文件

将Curry软件处理而得的avg格式的文件载入进ERPLAB。


具体步骤如下图:
 
之后,将各实验条件的avg格式的文件转化为erp格式。步骤如下图:


这样,avg格式的文件就转化为erp格式的文件了。

4.2 画总平均图

接下来,我们画总平均图。
画总平均图的命令如下:

 
点击Plot ERP Waveforms之后,我们得到了如下窗口:


在这一屏,我们便可以通过点点点来实现相应的avg画图操作啦!
 
比如,
Bins to plot小窗口下,选择自己确定要画的几种实验条件;

Scale小窗口下,定义坐标系的X轴、Y轴坐标系的长度和单位信息,振幅值得正负以及各实验条件的线型及颜色;

Channelto plot小窗口下,选择要画的电极点;

Baseline Correction小窗口下,选择基线矫正的时间窗口;

Set Font SizeSet frame(s)小窗口下,选择字体和总平均图行列的具体信息。
 
点击PLOT即可画出总平均图。在这之后,可以用ERPLAB自身的画图编辑窗口或者PS、PPT软件来继续美化完善总平均图。

5 地形图

首先调出画地形图的命令,如下图:

 
接着,需要将这个文件命名一下,如下图:

 
点击OK之后,得到下图:


在这一屏,同学们可以愉快地点点点了。

比如,
Latency(ies) to plot in ms小窗口下,根据地形图欲展示的时间窗口,在空格中填写相应信息:100:50:350。它表示此地形图对应的时间窗口为100~350ms,以50ms为一个步幅;

Value to plot小窗口下,可以根据需要选择Instantaneous或者Mean等

Baseline Correction小窗口下,选择基线矫正的时间窗口;

Colormap小窗口下,选择自己喜欢的颜色模式;

Colorbar scale小窗口下,选择合适的幅值模式及其范围。
 
定义完毕之后,点击PLOT,即可出现美腻的地形图。

随后可根据自己的需要,在PS软件上进行相应的操作。

6 导ERP成分峰值


ERPLAB还可以导出各个成分的峰值。
操作如下图:

 
之后,在这一屏,大家可以根据自己的需要进行点击操作。

 
比如,
Measurement小窗口下的Type可以选择峰值的类型PeakMean

Bin(s) & Channel(s)小窗口下,选择(Browse)要导出的条件(Bin文件)以及本实验所关注的Channel

Measurement window小窗口下,如图所示填写具体时间窗;

Baseline period小窗口下,根据需要选择基线矫正的类型及时间窗;

Save output file as小窗口下,设定文件的存储位置。

后记

以上的内容源自GitHub网址上LUCK梦之队的智慧产出:
https://github.com/lucklab/erplab

图片源自https://github.com/lucklab/erplab

此外,本公众号还有对脑电数据处理的prism软件操作推文,见Graphpad Prism也能做ERP图?So Easy!

图片源自行上行下


下面分享一个我近期画的地形图。


是我自学总结的一些操作步骤,助你论文发表顺顺利利哈~

个人能力有限,多有不足。ERPLAB也可实现代码化操作。欢迎大家相互交流!


PS:后台回复关键词“ERPLAB画图”即可获得所述的相关资料啦!

作者:羽绒

排版:秋秋

校对:喵君姐姐


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