​Graphpad prism 7作图教程 | 折线图与单维度分组柱形图

本文转载自：星星联盟会

Hello，

这里是行上行下，我是喵君姐姐~

Graphspad prism作为一个专业的画图软件，可以帮助我们处理行为数据，它的界面简洁，对小白用户十分友好。

之前我们介绍过如何使用prism画ERP波形图，之后就有很多小伙伴在后台问，是否可以出prism相关的教程。今天我们就带来了第一期教程，希望您多多支持哟~

在心理学实验中，处理行为结果的时候，我们经常会遇到多个条件分析，因此需要画出折线图。例，我们在研究掩蔽范式中的启动效应时，需要分析在不同条件下的反应时差异。如下图所示：

除了折线图之外，在条件较少的时候，可以以柱状图的形式展现。例，研究不同项目下CDA的幅度变化，便可以绘出柱状图，如下图所示：

本期就来教大家如何运用Graphspad prism画出折线图以及单维度分组柱形图（以Graphspad prism 7 为例）。

1.GraphPad Prism主要功能

首先，数据表格界面与Excel相似，可以将数据录入后保存。

注：一个GraphPad Prism文件里可包含多个数据表和图，即可以将同一文章或课题的数据归在一个文件里，方便管理。

其次，可作多种类型的数据图，基本满足科研需求。

线图

二维度分组图

单维度分组图

生存曲线

整体比例

最后，提供数据分析功能

基本统计：均值、标准差、标准误等

基本分析：t检验、正态分布、线相关分析等

2. GraphPad Prism界面介绍 

首先，双击GraphPad Prism 7图标，打开软件。

然后，弹出窗口中可选择需要制作的图标类型。

示例：文献：PMID:26565812;Fig 3C

模拟数据

示例解读：4个组别，分别是MGC-803对照、MGC-803 CISD2过表达、SGC-7901对照、SGC-7901过表达；每个组别检测了0、1、2、3、4、5天的数据，每个数据有3个重复。

1. 在开始页面中选择作图类型

首先，选择“XY”类型。

其次，选择数据输入形式。

• X：X轴数据形式选择numbers。

• Y：Y轴数据形式选择输入重复数据，示例数据中是3个重复，这里填上重复数“3”。

最后，点击“Create”按钮，创建数据表。

注：第②步选择不同的数据输入方式，建立的数据表格式也会不一样。如Y的3种方式，数据表格式如下：

数据表和作图界面

下面以2.1中第（2）种方法为例，其他两种操作大同小异，请自己练习。

2. 输入数据

3. 选择图形类型

点击左方导航栏“Graphs”里跟数据表格同名称的表格，如数据表是“MTT”，则这里点击“MTT”；在弹出窗口中选择图的样式，点击“OK”。

4. 图例位置修改

生成的图，标题默认为数据表格的“名称”。数据表名称与之相连各表的名称以及图表的标题是动态相连的，当数据表名称修改后，跟它相链接的图表名称和图表标题也会自动改名。

如Date Tables里“Data 1”改名为“MTT”，与之相连的Graphs里的“Data 1”自动跟着改名为“MTT”，图表标题页改为“MTT”。

默认上下标的方式，标记了每个点误差棒（±SD值）。

5. 标题修改

首先，鼠标点击一下Y坐标轴标题，即可输入或修改Y坐标轴标题。

其次，鼠标点击一下图表标题，按delete删掉。

注:输入过的内容如果是以前有输入过，软件会有记忆，再输入的时候会浮出记忆列表，方便直接选择输入。

6. 曲线格式修改（1）

双击作图区（除图例外的任意位置），在弹出窗口中进行如下设置：

首先，选择“Data set”中的“MGC-803-vector”组。

其次，Shape改为黑色实心方形。

然后，Thickness改为1/2pt，即线条粗细改细一点。

注：版本不同，默认的设置可能会不一样，按作图设置一下即可。

7. 曲线格式修改（2）

设置“MGC-803-CISD2”组：

首先，选择“Data set”中的“MGC-803-CISD2”组；

其次，Shape改为空心方形；

然后，Color改为白色；

接着，Border thickness改为1/2pt；

最后，Thickness改为1/2pt。

设置“SGC-7901-vector”组：

首先，在“Data set”中选择“SGC-7901-vector”组；

其次，Thickness改为1/2pt；

最后，Pattern改为虚线。

设置“SGC-7901-CISD2”组：

首先，在“Data set”中选择“SGC-7901-CISD2”组；

其次，Shape改为空心三角形；

接着，Color改为白色；

然后，Border thickness改为1/2pt；

接下来，Thickness改为1/2pt；

再次，Pattern改为虚线；

最后，点击“OK”按钮。

最后调整如下图所示:

8. 坐标轴修改（1）

双击X坐标轴，在弹出窗口中进行如下设置：

首先，取消勾选“Automatically determine the range and interval”；

其次，将“Maximum”设置为“5.5”；

最后，将“Major ticks interval”设置为“1”。

设置Y轴：

首先，取消勾选“Automatically determine the range and interval”；

其次，将“Maximum”设置为“700”；

然后，将“Major ticks interval”设置为“100”；

最后，点击“OK”按钮。

9. 文字格式修改

首先，按住Ctrl+A，选中所有文字；或单击需要修改的文字；

其次，在上方的Text工具盒里可以对文字的大小、字体、加粗、斜体等进行设置。

注：在实际应用时，图的文字大小、字体等格式一般可以等组图时再进行统一的设置。

修改后如图所示：

10. 坐标轴独立格式修改

双击坐标轴，弹出坐标轴属性框，可对各项属性进行修改。

① 横向菜单栏，依次为整体、X轴、Y轴、右方（次要）Y轴、标题与字体。

② 自动决定坐标轴范围和刻度间隔，默认勾选。如果需要修改坐标轴范围和刻度间隔，需要取消勾选此选项。

③ 坐标轴范围，即坐标轴起点值和终点值。

④ 刻度属性设置，可分别对刻度的方向、标签位置和倾斜角度以及刻度的长度进行设置。

⑤ 刻度间隔。

⑥ 可设置在特定的位置增加额外的刻度或在某刻度处画水平线。如设置在Y=300的地方画一水平线，标签显示为“Tripling”：

11. 坐标轴整体格式修改

点击坐标轴属性框上方菜单栏中的第一个选项，可对坐标轴的共同属性进行修改，完成设置后点击“OK”。

① XY轴相交的位置

② 图的形状，如横向长方形（默认），纵向长方形，正方形或自定义等（可通过在下方直接输入坐标轴的长度进行设置）以及图形在页面中的位置

③ 坐标轴的线条粗细、颜色以及作图区颜色、页面背景颜色设置

④ 边框设置：默认无边框；坐标轴是否隐藏；大小网格设置

12. 标题与字体格式修改

点击上方菜单栏中的“Titles & Fonts”选项，可对坐标轴的标题和字体等格式进行修改，完成设置后点击“OK”。

① 标题格式设置

• Show Graph Title: 是否显示标题

• Font…：字体格式设置，也可以从顶部快捷方式设置

• Distance from top of graph: 标题的位置距离图的顶部的距离

② 图坐标轴标题设置

• Direction：Y坐标轴标题的方向设置

③ 坐标轴标签字体和位置的设置

13. 作图区的修改

①双击作图区，弹出属性窗口，完成设置后点击“OK”。

②横向菜单栏，这里只介绍第一个“Appearance”，其余两项很少用到。

③ 选择需要设置的组别。

④数据作图数据选择。我们前面选择了均值和SD，这里可以切换成其他。

⑤数据标志颜色、形状、大小等设置。

⑥设置是否显示数据点的垂直线，一般不显示。

⑦设置是否显示error bars，即± SD以及其颜色，线条粗细，线条类型等。

⑧是否显示连线(数据点之间的连线)。

⑨是否显示线下填充。

⑩其他设置: 可设置数据线的样式。

需要设置哪一项，勾选前面的复选框，然后再进行该项设置。

结果图如下：

示例：文献：PMID：26565812；Fig 1C

示例解读：qPCR检测了6株细胞里CISD2的mRNA水平

模拟数据

注：

• 单维度分组柱形图适合于比较简单分组的数据，各组间的变化或差异，每组可以有1到多个重复

• 只有Y轴方向上有数据，X轴方向没有；或相反

1. 新建数据表

选择“File”→“New”→“New Data Table and Graph…”，新建一个数据表

注：

• Prism里可以建立多个表格，方便把同一个项目里的不同实验数据放在一起管理

• “New Project File”是新建一个prism文件

2. 在弹出窗口中进行如下设置

① 选择“Column”类型。

② 选择重复数据项

③ 点击“Create”，创建表格

注：只能选择一种类型

3. 输入数据

可以看到，新建的表格里，没有“X轴”的数据，全是Y轴。

对表格重新命名：

4. 点击Graphs目录下对应的图表

5. 弹出窗口，默认设置即可，点击“OK”

6. 点击Y坐标轴标题，输入标题

7. 删除标题

点击图标标题，按delete键删除；点击X Title，按delete键删除

注：其实到这一步图就可以用了，下面再根据示例的格式做一些个性化偏好设置。

8. 统一格式设置

在作图区双击鼠标，弹出的属性框里选择全部组别，进行统一格式设置。

① “Data set”里选择“Change ALL data sets”。

② Fill选择黑色。

③ Border color，边框颜色，选择黑色。

④ Thickness，误差棒的线条粗细，选1 pt。

注：

•  Border，边框线条粗细，这里不用设置，因为我们选择了填充黑色，因此框线看不到。

•  Fill pattern勾选的话可以在Desigh里选择花式填充的样式。

9. 调整柱子间距

点击“Graph Settings”，可对柱子间距进行调整。

10. 调整子柱的宽度

① 单击X坐标轴线。

② 鼠标放在X坐标轴线末端，待鼠标变成双向箭头状时，可通过左右拉动轴线，调节X轴线的长度。

11. 设置Y坐标轴刻度方向

双击Y坐标轴，在弹出的属性框里设置Y坐标轴刻度的方向

默认是在左边，示例里是在右边。再“All ticks”的“Ticks direction”里选择“right”，即可把刻度设置在Y轴线的右边。

12. 设置标题与标签距离

点击“Titles & Fonts”，在“Axes titles/Numbering and labeling”里设置Y坐标轴标题和标签距离坐标轴线的距离，点击“OK”。

结果如图所示：

13. 不连续坐标轴的设置和应用

当数据中有值相差比较大的时，需要设置不连续坐标轴，以清楚显示各部分的数据情况。假设本例中的数据变为：

由于有2组数据与其他组数据大小差距太大，导致值比较小组别的柱子可能看不清楚。

在这种情况下，可以通过将Y坐标轴设置为不连续坐标轴，分别显示大小两类数据

14. 不连续坐标轴的设置步骤

首先，双击Y坐标轴，弹出窗口里，进行如下设置：

结果图如下：

总结：

本期的教程就到此结束啦!本期文章带大家了解了如何用Graphpad prism画出折线图和单维度分组柱形图。

下一期我们继续教大家学习如何画出单维度分组散点图、二维度分组柱形图以及分组曲线。我们下期再见！

PS：后台回复关键词“graphspad prism”即可获得安装包以及对应教程。

排版：华华

校对：喵君姐姐

本文转载自：星星联盟会

参考文献：

1. Lan, W. , Fei, O. , Xiaobo, L. , Shu, W. , Hong-Mei, W. , & Yuandong, X. , et al. (2016). Overexpressed cisd2 has prognostic value in human gastric cancer and promotes gastric cancer cell proliferation and tumorigenesis via akt signaling pathway. Oncotarget, 7(4).

2. Dehaene S, Naccache L, Le Clec'H G, et al. Imaging unconscious semantic priming[J]. Nature, 1998, 395(6702): 597.

3. Ikkai A, McCollough A W, Vogel E K. Contralateral delay activity provides a neural measure of the number of representations in visual working memory[J]. Journal of neurophysiology, 2010, 103(4): 1963-1968.

4. 解螺旋PPT《Graphpad prism 7 作图教程》