Graphpad prism7作图教程 | 单维度分组散点图、二维度分组柱形图
本文转载自:星星联盟会
Hello,
这里是行上行下,我是喵君姐姐~
大家是否还在苦恼用什么软件能画出漂亮的行为结果图?本期就来继续推荐Graphspad prism这一款画图软件,它界面简洁,易于操作,十分适合于小白们。
在之前的介绍中,我们首先介绍了如何使用Graphpad prism画出ERP波形图,后面接着介绍了如何用它画出折线图和单维度分组柱形图。
除了折线图与单维度柱状图之外,在平时阅读文献的过程中,我们还可以看到各种各样的散点图以及多维度柱状图。
例如,在探讨工作记忆更新中线索-目标间隔以及重复项目对移除过程的影响时,便可以使用二维度柱状图来呈现结果。
最后,以散点图的形式表现工作记忆容量与移除速度之间的关系。
基于以上,本期就来继续介绍如何用Graphpad prism画出单维度分组散点图与二维度分组柱形图~
单维度分组散点图适合于简单分组的数据,即数据组仅由一个方案定义,在数据表中每一列定义一个数据组,在行向量上没有分组;每组可以有多个相互间是独立或非独立的数据,作图时用点来显示每个数据的位置;可直观的看到每组数据的分布情况和统计情况。
示例:文献:PMID: 26565812;Fig 1A
示例解读:CISD2在37例癌旁组织和409例肿瘤组织中的表达差异
1. 新建数据表
选择“File”→“New”→“New Data Table and Graph…”,新建一个数据表。
2. 弹出的窗口里选择作图类型
首先,选择“Column”类型。
其次,选择输入的数据类型为独立重复类型。
然后,点击“Create”,完成表格创建。
3. 添加散点图
在表格里输入数据后,点击下方导航栏中的Graph视图按钮,选择散点图,点击“OK”。
4. 修改坐标
删除标题、x坐标轴标题;将Y坐标轴标题改为“Expression of CISD2 in TCGA sets”。
注:标题太长时可使用回车键进行换行。
5. 格式设置
双击作图区任意空白位置,在弹出属性框中对散点图进行格式设置。
首先,下单菜单里选择Adjacent组。
其次, 颜色选择深蓝色。
然后, Size 改为2号大小。
首先,下单菜单里选择Tumor组。
其次,Shape改选择成实心圆形; Size 改为2号大小。
然后,颜色选择红色。
最后,点击OK。
结果如下图所示:
6. 改变坐标倾斜度
双击X坐标轴,在弹出属性框中将标签的倾斜度改为水平,点击“OK”。
至此,散点图制作完成。
注:可点击坐标轴进行拉伸,以调节坐标轴长短。
二维度分组散点图适合于二重分组的数据,即数据分组具有双向变量,每一列定义一个组别,每一行也定义一个组别。
示例解读:两个细胞株里,过表达CISD2前后,细胞克隆形成能力的变化。
1. 新建数据表
选择“Grouped”类型,数据3次重复,点击Create建立数据表。
2. 输入数据
在表格里输入数据后,点击Graph视图。
3. 选择柱状图样式
弹出窗口里确认选择了第一个样式(“交错并联”式),点击“OK”。
注:可根据需要进行重命名。
4.编辑X、Y轴
输入Y坐标轴,删除图的标题和X坐标轴标题;将图例移动至作图区上方,图例字体加粗。
首先,单击Y坐标轴标题输入“Colony number”。
其次,分别单击或选中图表标题“Colony”和“XTile”,按delete键删除这两个标题。
然后,选中两个图例,点击顶部“Text”工具框里的加粗按钮,将字体设置为粗体。
最后,分别选中两个图例,将其移动至作图区上方。
结果如下图:
基本完成,下面按照示例的格式进行个性化设置。
5. 图形格式设置
双击作图区任意空白处,在弹出属性框里对各组数据的图形格式进行设置
首先, Data set下单菜单里选择Vector组。
其次, Fill改为白色。
然后, Pattern改为纯色填充, Border改为1/2 pt。
最后, Thickness改为1/2 pt。
首先, Data set下单菜单里选择CISD2组。
其次, Fill改为黑色。
然后, Border选择1/2 pt(当Fill选择纯黑色时,这里Pattern可以不改)。
接下来, Thickness改为1/2 pt。
最后, 点击“OK”。
结果如下图:
6. 设置柱子的粗细
鼠标单击X坐标轴,指针移动到末端,待指针变成双向箭头时,拖动鼠标,将X坐标轴缩短一点。
7. 设置柱子之间的间距,双击作图区调出属性窗口
首先, 点击图形设置选项。
其次, 设置组内柱子间距为柱子宽度的100%,组间距离为300%。
结果如下图:
8. 设置Y轴刻度方向
双击Y坐标轴,在属性框里设置刻度方向向右,点击“OK”
至此,二维度分组柱状图完成。
本期的教程就到此结束啦!
在这三期中,我们向大家介绍了ERP图、折线图、单维度柱状图、单维度散点图、二维度柱状图,当然,除了这些之外,还有一些饼状图、箱型图、相关分析图等等。
下期我们会整理一些线上资料以供大家学习,其中包括Graphpad prism系列,欢迎持续关注~
我们下期再见!
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排版:华华
校对:喵君姐姐
本文转载自:星星联盟会
参考文献:
1. Ecker U K H, Lewandowsky S, Oberauer K. Removal of information from working memory: A specific updating process[J]. Journal of Memory and Language, 2014, 74: 77-90.
2. Wang L, Ouyang F, Liu X, et al. Overexpressed CISD2 has prognostic value in human gastric cancer and promotes gastric cancer cell proliferation and tumorigenesis via AKT signaling pathway[J]. Oncotarget, 2016, 7(4): 3791.
3. 解螺旋PPT《Graphpad prism 7 作图教程》
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