中国宏基因组学第二代测序技术检测感染病原体的临床应用专家共识发布！
2020年11月15日，“中国宏基因组学第二代测序技术检测感染病原体的临床应用专家共识” 在《中华传染病杂志》发布。共识由来自全国18家单位的共22位编写专家组成员讨论撰写。复旦大学附属华山医院张文宏教授为通信作者。
图 | 共识与指南首页
作为全球首篇针对所有感染性疾病的宏基因组学临床应用专家共识，在二代测序病原检测技术越来越普及的当下，该共识的发布对感染病宏基因组学病原诊断的应用具有里程碑式的重要意义，建立了中国感染病原体宏基因组学检测的标准规范。也是中国感染病宏基因组学的阶段性成果总结。
图 | 编写专家名单
而从2017初起，作为国内第一家启动感染病原宏基因组学诊断计划的临床感染科科室，复旦大学附属华山医院张文宏教授带领的团队在感染病病原精准诊治领域陆续取得了一系列成果，先后与合作单位完成临床检测逾6000例，近20篇相关SCI论文被Clinical Infectious Diseases, Emerging Infectious Diseases, Emerging Microbes and Infections, Journal of Infection等多个国际知名期刊接收发表。研究聚焦在临床包括细菌、病毒、真菌、寄生虫等多类病原体，研究范围覆盖包括中枢、血流、呼吸道、局灶感染等多种临床感染类型。研究方向涵盖免疫缺陷、移植后感染、宿主转录组学等。研究成果多次在国内外会议中进行口头及摘要报告，获国内外学会会议汇报奖3次。为中国感染病宏基因组学病原诊断的临床应用打下了一份坚实的基础。
图 | 华山感染发表的部分研究
本次共识遵循循证医学原则，共引用54篇文献，其中中国19篇，占比35%，彰显了中国宏基因组学技术在感染性疾病精准诊疗应用中的成果和国际先进地位。共识就第二代测序技术的临床应用范围、样本采集、分析解读和诊断效能等进行了证据总结，给出27条推荐意见，首次针对不同感染症候群、不同病原体的适用范围给出了相应的推荐意见，并在共识中多次强调质量控制与数据量的重要性。
附
27条推荐意见
NO.1
NO.2
NO.3
NO.4
NO.5
NO.6
NO.7
NO.8
NO.9
NO.10
NO.11、12
NO.13
NO.14
NO.15
NO.16、17
NO.18
NO.19
NO.20
NO.21
NO.22
NO.23
NO.24
NO.25
NO.26
NO.27
本次新冠疫情初期，我国宏基因组测序技术在病原的早期鉴定中发挥了重要的角色。而在过去几年，宏基因组学技术也在临床诊疗中得到了越来越广泛的使用。我们希望此次共识的发表，能够进一步规范该项技术在临床的应用及质量控制。在未来，我们也期待通过严谨的临床设计，进一步探索宏基因组学在耐药基因检测、宿主免疫监测、病原体定量等领域中的落地，推动感染病精准诊疗的发展!
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