利用高通量单细胞RNA测序解析人类多能干细胞的分化通路 | Genome Biology

人类多能干细胞（Human pluripotent stem cells, hPSCs）是用于细胞分化研究的重要模型，为再生医学提供了无限的细胞来源。然而，目前仍未建立全面的hPSCs单细胞水平分化图谱。

在发表于Genome Biology上的Mapping human pluripotent stem cell differentiation pathways using high throughput single-cell RNA-sequencing文章中，来自浙江大学的Haide Chen、Guoji Guo及其研究团队使用高通量单细胞RNA测序法（scRNA-seq），在优化的微流体环路基础上分析了人胚胎体系中的早期分化谱系。

图：高通量单细胞RNA测序法（scRNA-seq）分析hPSC的早期分化

Xiaoping Han et al.

该研究展示了涵盖多种细胞谱系的hPSC早期分化的细胞状况，其中包括神经细胞、肌肉细胞、内皮细胞、基质细胞、肝脏细胞和上皮细胞。通过拟时间分析法，研究者们构建了这些祖细胞的发育轨迹，并揭示了细胞分化过程中的基因表达动态。他们还将始发态H9细胞（primed H9 cells）重新编程为原始态H9细胞（naïve-like H9 cells），用于研究细胞态的转换过程。研究者发现在原始态H9细胞中富含血源性内皮发育相关基因。在功能上，原始态H9细胞分化成造血细胞的潜力比始发态细胞更高。

该单细胞分析揭示了hPSC早期分化的细胞状况，并提出了有关优化分化方案的新见解。

Genome Biology

Doi: 10.1186/s13059-018-1426-0

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Mapping human pluripotent stem cell differentiation pathways using high throughput single-cell RNA-sequencing

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