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plotnine: Python版的ggplot2作图库

大邓 大邓和他的Python 2022-07-09

R语言的ggplot2绘图能力超强,python虽有matplotlib,但是语法臃肿,使用复杂,入门极难,seaborn的出现稍微改善了matplotlib代码量问题,但是定制化程度依然需要借助matplotlib,使用难度依然很大。

而且咱们经管专业学编程语言,一直有一个经久不衰的问题-“学数据分析,到底选择R还是Python”。通过plotnine这个库,你就可以在python世界中体验下R语言的新奇感,体验可视化之美,如果着迷上瘾,再学R也不迟。

plotnine包,可以实现绝大多数ggplot2的绘图功能,两者语法十分相似,R和Python的语法转换成本大大降低。

  • plotnine文档 https://plotnine.readthedocs.io/en/latest/
  • R语言ggplot2文档 https://ggplot2.tidyverse.org/reference/index.html

安装

pip install plotnine

准备数据

from plotnine.data import mpg

#dataframe
mpg.head()

manufacturermodeldisplyearcyltransdrvctyhwyflclass
0audia41.819994auto(l5)f1829pcompact
1audia41.819994manual(m5)f2129pcompact
2audia42.020084manual(m6)f2031pcompact
3audia42.020084auto(av)f2130pcompact
4audia42.819996auto(l5)f1626pcompact

快速作图qplot

我们先直接看最简单好用的快速作图函数qplot(x, y, data)

  • 横坐标displ
  • 纵坐标cty
  • 数据mpg
from plotnine import qplot

qplot(x='displ'
      y='cty',
      data=mpg)

<ggplot: (322851325)>

ggplot图层

qplot是快速作图函数,如果想让图更好看,进行私人订制,那么我们需要进行图层设计

首先设置ggplot图层(相当于买了一个高级画布),

  • 数据mpg
  • 横坐标x轴为displ
  • 纵坐标y轴cty

在plotnine中,变量所对应的数据均可通过字段名调用

from plotnine import ggplot, geom_point, aes

ggplot(aes(x='displ', y='cty'), mpg)

<ggplot: (321957793)>

图层叠加

我们可以看到,已经绘制出一个空的ggplot图层,x轴为displ,y轴为cty。

接下来我们给这个图层上加上数据对应的散点,使用geom_point()直接追加在ggplot图层之上即可。

(
    ggplot(aes(x='displ', y='cty'), mpg)
    + geom_point()
)

<ggplot: (322466061)>

color

在上图中,散点是没有区分每辆车的气缸数cyl。

在geom_point()中,我们可以按照气缸数cyl分门别类,按照颜色显示出来

(
    ggplot(aes(x='displ', y='cty'), mpg)
    + geom_point(aes(color='cyl'))
)

<ggplot: (323647173)>

上图挺好看的,有时候需要绘制的字段是离散型数值,但是上色后可能不够明显,需要声明该字段为离散型。这时候用factor()来告诉plotnine,这个字段是离散型数值

(
    ggplot(aes(x='displ', y='cty'), mpg)
    + geom_point(aes(color='factor(cyl)')) 
)

<ggplot: (321918425)>

size

有时候为了增加可视化显示的维度数,还可以考虑加入点的大小size

(
    ggplot(aes(x='displ', y='cty'), mpg)
    + geom_point(aes(size='hwy'))
)

<ggplot: (323399013)>

梯度色

如果你想自己设置颜色的梯度,可以通过scale_color_gradient设置

from plotnine import scale_color_gradient

(
    ggplot(aes(x='displ', y='cty'), mpg)
    + geom_point(aes(color='hwy'))
    + scale_color_gradient(low='blue', high='red')
)

<ggplot: (323622897)>

条形图

plotnine中可绘制的图有很多,刚刚已经讲了散点图,接下来我们看看plotnine中的条形图。

首先准备一下数据

import pandas as pd

df = pd.DataFrame({
    'variable': ['gender''gender''age''age''age''income''income''income''income'],
    'category': ['Female''Male''1-24''25-54''55+''Lo''Lo-Med''Med''High'],
    'value': [604050302010252540],
})
df['variable'] = pd.Categorical(df['variable'], categories=['gender''age''income'])
df['category'] = pd.Categorical(df['category'], categories=df['category'])

df

variablecategoryvalue
0genderFemale60
1genderMale40
2age1-2450
3age25-5430
4age55+20
5incomeLo10
6incomeLo-Med25
7incomeMed25
8incomeHigh40
from plotnine import ggplot, aes, geom_text, position_dodge, geom_point

#调整文本位置
dodge_text = position_dodge(width=0.9)                              # new

(
    ggplot(df, aes(x='variable'
                   y='value'
                   fill='category')) #类别填充颜色
    + geom_col(position='dodge'
               show_legend=False)   # modified
    + geom_text(aes(y=-.5, label='category'),                          # new
                position=dodge_text,
                color='gray',  #文本颜色
                size=8,   #字号
                angle=30#文本的角度
                va='top')
    
 + lims(y=(-560))                                                 # new
)

<ggplot: (334727813)>

from plotnine.data import economics_long

economics_long.head()

datevariablevaluevalue01
01967-07-01pce507.40.000000
11967-08-01pce510.50.000266
21967-09-01pce516.30.000764
31967-10-01pce512.90.000472
41967-11-01pce518.10.000918
from plotnine import ggplot, aes, geom_line

(
    ggplot(economics_long, aes(x='date', y='value01', color='variable'))
    + geom_line()
)

<ggplot: (334895445)>

plotnine目前已经支持绝大多数ggplot2,但是文档方面没有ggplot2全,所以学习plotnine时可以参考ggplot2。

  • plotnine文档 https://plotnine.readthedocs.io/en/latest/
  • R语言ggplot2文档 https://ggplot2.tidyverse.org/reference/index.html

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