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课题做不下去怎么办(植物篇)?

2017-08-16 徐洲更 生信媛

李笑来曾在得到专栏上送了读者一把“万能钥匙”。

当你遇到一扇锁住的大门的时候,你该如何打开它。你肯定不会盯着锁孔看,因为如果锁上插着钥匙,这一扇门早就可以打开了。你肯定是需要去其他地方找钥匙。

通过这个比喻,我们可以知道,当你遇到问题的时候,不能盯着问题本身看,我们应该从其他角度,发散思维找找问题的可能答案。也就是说,当你的课题做不下去的时候,你或许需要从一个更加系统的角度看待你研究的基因,这其实也是查理·芒格建议的多元思考模型。

今天介绍的就是一个整合了几乎植物全网资源的可视化网站— ePlant, 它就给了我们一把好用的钥匙。

是不是一看这个就觉得很高大上

它能解决的问题
  • EIF2的表达模式如何? Heat Map Viewer

  • SIN1的表达是否有自然变异? World eFP Viewer

  • ABI3在何处表达? Plant eFP Viewer

  • 6个小时的UBQ4表达对干旱有什么影响? Abiotic Stress eFP Viewer

  • CESA10 蛋白定位在细胞壁上吗? Cell eFP Viewer

  • UBI6在染色体哪个地方? Chromosome Viewer

  • 有哪些与AT4G17410互作的蛋白呢? Interactions Viewer

  • GOS12的结合位点哪里呢? Molecular Viewer

  • AT1G049有哪些已知的多态位点呢?Sequence Browser

  • 你不知道找什么基因?Expression Angler


如何使用

当然,只要说了这个概念,大家就会自己去使用这个工具。但是为了凑字数,我还得继续写一点。网站分为两个部分: 查询,查看。就那么简单,1分钟学会。

你可以自己输入已知的基因,也可用Expression Angler进行模糊搜索。下图演示的就是在逆境处理下,1个小时冷处理后control叶片高表达,在对照组是根部高表达的基因。

于是我们得到了如下基因(我的天,居然还真有!!!)

随便看一个可视化工具呗,剩下大家自己去探索吧。

目前而言,这个可视化工具仅限于拟南芥,主要是拟南芥的研究信息比较透彻。 还有,估计是没有动物篇的。

阅读原文直达神器,或者访问http://bar.utoronto.ca/eplant/ 。或者长按二维码打赏支持我写作。



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