(10.3) 教你用Image J处理各种科研论文图，成就Nature级美图，给论文加分！
对科研小白来说，论文作图往往是一件非常烦恼的事情。今天一文让小白精通科研作图。
首先，我们大部分看文献的时候，论文里面的图片如下，要么好几张图片组合在半栏图，要么要几张实验图组合在一个全栏里面：
那么，作图的软件及流程是什么，如下：
也就是用SPSS、origin等做好的统计图，PS处理好的实验图，然后导入AI里面组合好；最后导出矢量图或者位图，用于投稿。
一、对于SPSS，我们分享过：
2、Graphrism、SPSS、SAS、R语言四大数据统计软件教程合集。
二、对于Origin，我们分享过：
1、跟Nature文章学绘图：用Origin轻松绘制出美观柱状图！附Origin中文版安装包免费下载！
2、30套Origin作图配色模板，离Nature更近一步！
5、手把手教你OriginPro绘制各种统计图（附中文版安装包免费下载）
三、对于GraphPad，我们分享过：
1、GraphPad做各种科研统计图最全教程（附安装包+激活码），26种科研图教程，都在这里了，赶快收藏！
3、GraphPad作各种图万能模板，输入数据，直接出图，科研必备！
四、对于R语言，我们分享过：
4、qPCR计算万能模板，输入CT值，直接知道有没有差异，有没有统计学意义，太好了！
五、对于PS，我们分享过：
1、【干货分享】PhotoShop视频教程及素材——70G资料免费下载
3、免费资源 | 最新直装版PS+AI（含Win版、Mac版）
六、对于AI组图，我们分享过：
1、Adobe Illustrator（AI）矢量图软件分享给大家，不用安装即可使用！
3、教你用PPT 1分钟绘制符合SCI要求的Science/Nature级美图，给论文加分！
那，组合图好之后，最后我们就需要导出，AI导出的时候，不同的期刊对图片的大小、格式、色彩模式、分辨率等均有要求。如下：
首先是格式：矢量图没有分辨率的问题。因为矢量图可以任意缩放而保持清晰度不变，位图在放大后图片会变模糊，出现马赛克般的像素小点。所以，我们组合好图片之后需要保存为PDF或者EPS属性的矢量图：
其次是分辨率：如果我们用AI导出为位图（PNG\TIFF等），建议彩图、照片分辨率 > 300 dpi，灰度图 > 600 dpi，黑白图 > 1200 dpi。同时，请保存好源文件格式，方便以后修改。另外，photoshop 不能提高位图的分辨率，仅增大该图所占内存，得到虚假的高分辨率图片（所以这里建议，组图一定要用AI）。
最后是颜色：导出的时候，会让我们选择色彩模式，作图中常用的模式有两种，RGB 和 CMYK。若投稿期刊未做要求，建议使用 RGB 模式，色彩表现力比较强，适合投稿后编辑和审稿人的阅读。
那懂了这么多之后，如何对免疫组化图片定量评价和自动评分？
在组织学中，组织样本中疾病标志物的免疫组化（IHC）为疾病分级提供了诊断指标，这将影响病人的治疗策略制定。到目前为止，组织样本的病理学分析依旧是一项耗时且依赖主观判断的工作，然而对抗体作色的强弱直接进行人为的判断会带有明显的视觉误差。因此来自印度的科学工作者基于Imagej软件设计了一款插件来实现IHC电子图片的自动定量分析和评分。接下来我们一起走进这款神器的插件吧！
首先这款神器的插件在哪里可以下载？
IHC Profiler插件可以在https://sourceforge.net/projects/ihcprofiler/免费获取。
其次这款插件如何安装到自己的Imagj软件中？
1、解压下载好的IHC_Profiler.zip文件，得到两个文件：IHC Profiler文件和IHC_Profiler.txt宏文件。
2、复制这两个文件粘贴至Plugins文件夹中：
My Computer > C: > Program Files > ImageJ > plugins
此外复制IHC_Profiler.txt文件粘贴至macros文件夹中：
My Computer > C: > Program Files > ImageJ > macros
重启软件即可，我们会在Imagej软件Plugins中发现已经安装好的IHC_Profiler插件。
如何使用该插件?对于胞浆着色的IHC图片，读入图片能够快速得到结果。
对于胞核着色的IHC图片：
计算Score的公式为：
Score有四个等级，分别为4/3/2/1，High Positve为4分，Positive为3分，Low Positive为2分，negative 为1分。整个分析的流程如下：
现在我们以实际例子来演示整个操作：1、打开Imagej软件，软件界面如下：
File，Open，打开胞浆着色的图片：
2、点击Plugins，点击IHC Profiler，进入以下界面：
询问是否是胞浆着色，下拉可选择核着色，此处选择胞浆着色，点击OK，进入以下界面，选择H DAB点击OK。
得到结果为High Positive：
而对于胞核着色，操作略微不同：1、 打开Imagej软件，打开胞核着色图片：
2、点击Plugins，点击IHC Profiler，进入以下界面，选择胞核着色：
同上选择H DAB，点击OK
进入以下界面：
调节Threshold阈值选中所有核着色，点击Plugins，选择IHC Profiler Macro，得到结果：
这个用于临床或者科研组织病理学分析的新工具可以在全球范围内用于评估大多数定位于细胞质或者细胞核的蛋白质，这种方法可以尽量减少不同实验室之间观察者之间差异的问题，为进一步为跨国间的临床试验提供了有效的保证。
好了，最后我们还有：
“Image J处理各种科研论文图视频教程”
如做细胞追踪：
等，目录如下：
一共98节课，如下免费获取：
"Image J处理各种科研论文图视频教程"免费领取方式：
长按二维码关注
②对话框回复关键词：Image J
辛苦整理，全文未插入任何广告！
觉得有用的话，您就点个在看、点赞!